Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N4Z0

Protein Details
Accession A0A5C3N4Z0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
849-870TTRLPFWRTRHLRNPWNHEREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MAADASGDGSQDLQLANASTQSHTADTGRSPGPSRLSYPESSAPWRQHTRPAFQTAPGHSYSRTSSSDTQQGPSGLGSRYTGAPQPFQTRGAPYAQPSGYGGQYTLSPQPAGNLQPPPSGAFPYGPGFSHHGQYVHETPMIPQNAHMAYPSANMPSLMHHHSSPGPSSMYVHSQAAPSPPSRSPLSSPSSQGPHSASYSGSASFYPSPLSASSFPYPAQPFSPSTPIYQSPYSSPSYPPQFISPGEQEGQGTWWYVPSNVPSPNQYDPMSHTYQAHYAVPYASLNRQEFEGYRRPGPQSVSSAGYPVSSPLPQASMGQPHVFGPGHESASPSLIYPTSPGPASSEVSAASARAASNLSSARRAYHPNPPAHRSEWVMWVGNVPGDATVEELWRVFNQPRPLTQSPDSDSKESDAEGQLYGGVVSIYPIVRSNCAFVNFESEAHLHSAIARFNGQQLRSHDPKCPRLVCRVRAKEDDLRAGVGAQRGTGVHTRWVRERRARDRERKEEGEEEQGGAERRSASPAESPRGLAQRLASLSLGSEEEGRFRRGTKKSSSGSYASTNSSFLARHFPKRYFILKSLTQFDLDLSVEKGLWATQRHNETILDQAYRTSRDVYLIFGVNKSGEFYGYARMASPILRGEERISWASRTDASPASLRGQRRSEPILEEGGSPTQARPTFLPLSEHRLVDESPLPLSPPHKQILPSAVAEAPREFLSAPAEMNQPHHRFSFQAPAPKPSLDVPRVLPAAPSLFGADKFELKEGPVIAARARGKSGSSSKSSKDSKPDSEGVKRMDMLMDEYPGSPLRTVAEEGSKEDLGEEEPEEEAKPGKFERAGENWGEPFRIEWIQTTRLPFWRTRHLRNPWNHEREVKVSRDGTELEPSVGQALLDEWERPEPPQSPVSFKYPGQGRRPTGEPKSASTNTAPTLSRKGDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.12
5 0.13
6 0.12
7 0.14
8 0.16
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.23
15 0.23
16 0.24
17 0.26
18 0.3
19 0.34
20 0.34
21 0.37
22 0.38
23 0.42
24 0.41
25 0.43
26 0.44
27 0.43
28 0.46
29 0.49
30 0.48
31 0.51
32 0.57
33 0.54
34 0.58
35 0.6
36 0.62
37 0.62
38 0.65
39 0.59
40 0.57
41 0.61
42 0.55
43 0.53
44 0.47
45 0.42
46 0.35
47 0.35
48 0.33
49 0.31
50 0.3
51 0.31
52 0.33
53 0.37
54 0.45
55 0.44
56 0.43
57 0.41
58 0.39
59 0.34
60 0.3
61 0.28
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.17
67 0.19
68 0.23
69 0.22
70 0.25
71 0.29
72 0.34
73 0.34
74 0.36
75 0.36
76 0.35
77 0.35
78 0.36
79 0.34
80 0.31
81 0.36
82 0.33
83 0.31
84 0.29
85 0.29
86 0.25
87 0.22
88 0.19
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.2
98 0.23
99 0.25
100 0.26
101 0.27
102 0.28
103 0.29
104 0.3
105 0.28
106 0.27
107 0.23
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.19
113 0.2
114 0.23
115 0.23
116 0.25
117 0.25
118 0.23
119 0.22
120 0.27
121 0.28
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.22
126 0.29
127 0.3
128 0.25
129 0.22
130 0.24
131 0.23
132 0.23
133 0.22
134 0.16
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.18
144 0.2
145 0.2
146 0.19
147 0.22
148 0.24
149 0.27
150 0.26
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.22
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.21
160 0.2
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.2
165 0.22
166 0.22
167 0.25
168 0.27
169 0.28
170 0.29
171 0.33
172 0.37
173 0.35
174 0.37
175 0.38
176 0.4
177 0.37
178 0.36
179 0.32
180 0.29
181 0.28
182 0.25
183 0.2
184 0.18
185 0.19
186 0.16
187 0.15
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.17
197 0.15
198 0.2
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.26
203 0.27
204 0.24
205 0.24
206 0.22
207 0.23
208 0.25
209 0.31
210 0.26
211 0.26
212 0.29
213 0.29
214 0.31
215 0.29
216 0.27
217 0.24
218 0.27
219 0.28
220 0.26
221 0.26
222 0.29
223 0.33
224 0.34
225 0.32
226 0.31
227 0.31
228 0.3
229 0.33
230 0.28
231 0.25
232 0.24
233 0.23
234 0.21
235 0.18
236 0.19
237 0.14
238 0.13
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.16
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.25
250 0.27
251 0.29
252 0.27
253 0.24
254 0.26
255 0.3
256 0.31
257 0.28
258 0.27
259 0.25
260 0.26
261 0.27
262 0.23
263 0.18
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.29
278 0.26
279 0.29
280 0.32
281 0.33
282 0.34
283 0.37
284 0.35
285 0.3
286 0.3
287 0.3
288 0.26
289 0.25
290 0.22
291 0.19
292 0.15
293 0.12
294 0.11
295 0.08
296 0.09
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.18
308 0.17
309 0.14
310 0.15
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.17
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.11
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.06
342 0.08
343 0.11
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.23
350 0.24
351 0.31
352 0.37
353 0.42
354 0.47
355 0.48
356 0.5
357 0.46
358 0.45
359 0.39
360 0.34
361 0.31
362 0.28
363 0.25
364 0.21
365 0.19
366 0.17
367 0.14
368 0.12
369 0.08
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.09
381 0.09
382 0.13
383 0.2
384 0.21
385 0.24
386 0.32
387 0.33
388 0.36
389 0.38
390 0.38
391 0.34
392 0.4
393 0.4
394 0.33
395 0.31
396 0.27
397 0.25
398 0.2
399 0.19
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.09
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.05
408 0.04
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.13
421 0.14
422 0.12
423 0.17
424 0.16
425 0.16
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.08
432 0.08
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.12
439 0.16
440 0.15
441 0.18
442 0.22
443 0.28
444 0.32
445 0.33
446 0.35
447 0.38
448 0.43
449 0.44
450 0.44
451 0.4
452 0.46
453 0.51
454 0.53
455 0.58
456 0.58
457 0.57
458 0.56
459 0.58
460 0.53
461 0.49
462 0.44
463 0.34
464 0.28
465 0.23
466 0.21
467 0.18
468 0.14
469 0.11
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.09
474 0.11
475 0.1
476 0.15
477 0.17
478 0.19
479 0.25
480 0.31
481 0.35
482 0.41
483 0.49
484 0.53
485 0.62
486 0.7
487 0.73
488 0.77
489 0.79
490 0.79
491 0.73
492 0.67
493 0.6
494 0.52
495 0.47
496 0.38
497 0.3
498 0.23
499 0.21
500 0.18
501 0.15
502 0.13
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.15
509 0.18
510 0.21
511 0.2
512 0.21
513 0.22
514 0.24
515 0.24
516 0.19
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.13
522 0.1
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.06
527 0.07
528 0.06
529 0.1
530 0.12
531 0.14
532 0.13
533 0.15
534 0.24
535 0.27
536 0.32
537 0.35
538 0.41
539 0.43
540 0.45
541 0.47
542 0.41
543 0.38
544 0.37
545 0.32
546 0.26
547 0.24
548 0.21
549 0.17
550 0.16
551 0.14
552 0.11
553 0.19
554 0.2
555 0.27
556 0.31
557 0.32
558 0.35
559 0.4
560 0.44
561 0.4
562 0.4
563 0.38
564 0.38
565 0.4
566 0.4
567 0.36
568 0.32
569 0.27
570 0.23
571 0.19
572 0.15
573 0.13
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.06
580 0.09
581 0.11
582 0.13
583 0.18
584 0.22
585 0.22
586 0.24
587 0.23
588 0.21
589 0.24
590 0.24
591 0.19
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.19
596 0.19
597 0.15
598 0.14
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.17
604 0.17
605 0.15
606 0.15
607 0.13
608 0.12
609 0.12
610 0.09
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.12
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.11
621 0.12
622 0.1
623 0.12
624 0.12
625 0.13
626 0.14
627 0.16
628 0.18
629 0.2
630 0.19
631 0.17
632 0.18
633 0.18
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.16
638 0.17
639 0.17
640 0.18
641 0.21
642 0.24
643 0.26
644 0.29
645 0.31
646 0.32
647 0.35
648 0.38
649 0.36
650 0.34
651 0.34
652 0.31
653 0.28
654 0.25
655 0.22
656 0.19
657 0.17
658 0.14
659 0.12
660 0.15
661 0.15
662 0.16
663 0.15
664 0.21
665 0.23
666 0.24
667 0.29
668 0.25
669 0.33
670 0.34
671 0.33
672 0.27
673 0.26
674 0.25
675 0.23
676 0.24
677 0.17
678 0.15
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.18
683 0.2
684 0.21
685 0.22
686 0.24
687 0.25
688 0.27
689 0.31
690 0.31
691 0.27
692 0.25
693 0.25
694 0.23
695 0.23
696 0.21
697 0.17
698 0.14
699 0.14
700 0.11
701 0.1
702 0.12
703 0.11
704 0.11
705 0.12
706 0.14
707 0.14
708 0.19
709 0.27
710 0.27
711 0.28
712 0.29
713 0.28
714 0.27
715 0.3
716 0.35
717 0.3
718 0.38
719 0.37
720 0.41
721 0.43
722 0.41
723 0.4
724 0.34
725 0.39
726 0.31
727 0.32
728 0.3
729 0.33
730 0.34
731 0.32
732 0.27
733 0.21
734 0.21
735 0.18
736 0.16
737 0.12
738 0.12
739 0.13
740 0.16
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.17
745 0.16
746 0.15
747 0.18
748 0.15
749 0.16
750 0.15
751 0.15
752 0.14
753 0.21
754 0.23
755 0.21
756 0.22
757 0.21
758 0.2
759 0.26
760 0.33
761 0.32
762 0.35
763 0.38
764 0.4
765 0.48
766 0.52
767 0.51
768 0.53
769 0.54
770 0.54
771 0.57
772 0.59
773 0.57
774 0.59
775 0.6
776 0.55
777 0.5
778 0.45
779 0.39
780 0.34
781 0.28
782 0.24
783 0.2
784 0.18
785 0.15
786 0.15
787 0.16
788 0.17
789 0.17
790 0.13
791 0.12
792 0.12
793 0.14
794 0.15
795 0.16
796 0.21
797 0.21
798 0.23
799 0.27
800 0.25
801 0.22
802 0.21
803 0.19
804 0.14
805 0.15
806 0.13
807 0.1
808 0.1
809 0.11
810 0.12
811 0.12
812 0.13
813 0.12
814 0.15
815 0.15
816 0.19
817 0.21
818 0.23
819 0.3
820 0.32
821 0.36
822 0.36
823 0.38
824 0.37
825 0.36
826 0.34
827 0.26
828 0.22
829 0.22
830 0.21
831 0.18
832 0.2
833 0.23
834 0.28
835 0.31
836 0.36
837 0.36
838 0.41
839 0.44
840 0.45
841 0.46
842 0.52
843 0.57
844 0.61
845 0.67
846 0.7
847 0.76
848 0.8
849 0.84
850 0.84
851 0.83
852 0.78
853 0.74
854 0.69
855 0.68
856 0.65
857 0.59
858 0.55
859 0.49
860 0.47
861 0.44
862 0.42
863 0.36
864 0.36
865 0.33
866 0.27
867 0.25
868 0.23
869 0.21
870 0.18
871 0.15
872 0.09
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.1
877 0.11
878 0.15
879 0.16
880 0.17
881 0.22
882 0.22
883 0.26
884 0.32
885 0.33
886 0.37
887 0.4
888 0.45
889 0.44
890 0.42
891 0.46
892 0.47
893 0.52
894 0.54
895 0.59
896 0.58
897 0.59
898 0.64
899 0.65
900 0.64
901 0.64
902 0.59
903 0.54
904 0.59
905 0.55
906 0.53
907 0.47
908 0.45
909 0.38
910 0.4
911 0.38
912 0.33
913 0.38