Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NKB6

Protein Details
Accession A0A5C3NKB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-204TDAPNEPPRKKRKGPKGPNPLSVKKKKBasic
255-279GMDGDTSHKRKRHRQHKSTARDEPHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-219PPRKKRKGPKGPNPLSVKKKKTKSDVATPSAKKGDK
263-271KRKRHRQHK
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 12.499, nucl 9, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKTYRKLMSLYCLHFGFRQPYQVLVDSEMCKEAISSHLDLGQQLGVVLQGTVKPMITQCCIHELYLQGRSQQPAVDLAKTFERRKCNHREAIPGDECLVSVVGDANKHRYVIATQSQPLRSTLRKIPGVPLVHINRSVVILEPPSNATLDKKETEEEQALHVPDAEKAQLPSTDAPNEPPRKKRKGPKGPNPLSVKKKKTKSDVATPSAKKGDKVVKPRVQSTQSDGGVTGAKRKRVDVDTSMDGREGSGMDGDTSHKRKRHRQHKSTARDEPH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.61
3 0.55
4 0.46
5 0.39
6 0.37
7 0.39
8 0.36
9 0.3
10 0.34
11 0.29
12 0.31
13 0.33
14 0.35
15 0.32
16 0.29
17 0.32
18 0.26
19 0.27
20 0.25
21 0.22
22 0.18
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.18
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.15
34 0.11
35 0.09
36 0.08
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.13
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.22
52 0.23
53 0.22
54 0.22
55 0.22
56 0.23
57 0.27
58 0.26
59 0.24
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.22
64 0.19
65 0.2
66 0.21
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.24
71 0.29
72 0.32
73 0.31
74 0.38
75 0.4
76 0.48
77 0.56
78 0.58
79 0.6
80 0.6
81 0.63
82 0.59
83 0.64
84 0.57
85 0.48
86 0.4
87 0.33
88 0.29
89 0.2
90 0.16
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.16
104 0.21
105 0.19
106 0.21
107 0.25
108 0.26
109 0.26
110 0.27
111 0.26
112 0.22
113 0.24
114 0.26
115 0.28
116 0.3
117 0.3
118 0.31
119 0.34
120 0.33
121 0.3
122 0.31
123 0.27
124 0.26
125 0.26
126 0.23
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.17
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.14
165 0.16
166 0.15
167 0.19
168 0.27
169 0.35
170 0.38
171 0.45
172 0.51
173 0.58
174 0.66
175 0.72
176 0.75
177 0.78
178 0.84
179 0.86
180 0.89
181 0.87
182 0.87
183 0.85
184 0.82
185 0.81
186 0.79
187 0.77
188 0.75
189 0.77
190 0.76
191 0.76
192 0.78
193 0.74
194 0.76
195 0.75
196 0.72
197 0.73
198 0.67
199 0.63
200 0.6
201 0.54
202 0.44
203 0.41
204 0.45
205 0.43
206 0.51
207 0.56
208 0.56
209 0.6
210 0.64
211 0.65
212 0.6
213 0.55
214 0.53
215 0.51
216 0.45
217 0.41
218 0.37
219 0.3
220 0.3
221 0.27
222 0.3
223 0.25
224 0.3
225 0.3
226 0.32
227 0.38
228 0.38
229 0.45
230 0.4
231 0.43
232 0.44
233 0.45
234 0.44
235 0.38
236 0.33
237 0.26
238 0.22
239 0.16
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.13
246 0.2
247 0.26
248 0.33
249 0.36
250 0.44
251 0.55
252 0.65
253 0.73
254 0.76
255 0.8
256 0.85
257 0.91
258 0.93
259 0.92