Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NDA9

Protein Details
Accession A0A5C3NDA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-141QAEAKTAKNRAKRQKKKEKAKTVKQDTQKDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-131KKREWEEQAEAKTAKNRAKRQKKKEKAK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences SHSPSPGPSSIGPRHAQTALDKQRSQLEKLLKDPAKPAYIPPPPKEKTVRAPREMMKNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLKLMEEENKKEAEVAEFERKKREWEEQAEAKTAKNRAKRQKKKEKAKTVKQDTQKDESQGIARSREDDGVPSAPLKKRRLVSGKELLFRRPGEDSEDEEMGGSGDEAGPQLSGQEKAEEAAAPVPIIEGHKITIIEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.37
4 0.34
5 0.4
6 0.43
7 0.49
8 0.47
9 0.45
10 0.53
11 0.54
12 0.52
13 0.48
14 0.47
15 0.44
16 0.47
17 0.55
18 0.49
19 0.47
20 0.48
21 0.46
22 0.41
23 0.37
24 0.37
25 0.36
26 0.43
27 0.47
28 0.47
29 0.52
30 0.5
31 0.56
32 0.59
33 0.55
34 0.57
35 0.62
36 0.66
37 0.6
38 0.65
39 0.64
40 0.67
41 0.65
42 0.58
43 0.53
44 0.48
45 0.44
46 0.38
47 0.33
48 0.24
49 0.21
50 0.17
51 0.11
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.08
60 0.09
61 0.14
62 0.22
63 0.29
64 0.34
65 0.39
66 0.45
67 0.54
68 0.61
69 0.65
70 0.65
71 0.6
72 0.56
73 0.53
74 0.49
75 0.47
76 0.43
77 0.38
78 0.31
79 0.29
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.22
87 0.24
88 0.25
89 0.29
90 0.3
91 0.31
92 0.32
93 0.34
94 0.31
95 0.34
96 0.4
97 0.4
98 0.42
99 0.42
100 0.39
101 0.34
102 0.31
103 0.3
104 0.28
105 0.31
106 0.38
107 0.46
108 0.58
109 0.67
110 0.75
111 0.82
112 0.87
113 0.91
114 0.93
115 0.93
116 0.92
117 0.92
118 0.92
119 0.9
120 0.87
121 0.84
122 0.82
123 0.76
124 0.71
125 0.63
126 0.55
127 0.46
128 0.4
129 0.33
130 0.3
131 0.27
132 0.24
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.19
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.19
144 0.22
145 0.29
146 0.31
147 0.34
148 0.35
149 0.44
150 0.51
151 0.5
152 0.54
153 0.57
154 0.59
155 0.6
156 0.59
157 0.52
158 0.49
159 0.44
160 0.38
161 0.31
162 0.27
163 0.26
164 0.27
165 0.3
166 0.29
167 0.28
168 0.26
169 0.23
170 0.22
171 0.16
172 0.13
173 0.08
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.14
202 0.14