Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NC87

Protein Details
Accession A0A5C3NC87    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-164EAVWNPPKKPKQAKGKVKKGQGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-161PKKPKQAKGKVKKG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.5, cyto 7, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSAELKRKRQESEDSDDEEPSFGRQILPVANLPHNYNGPIEDGLQYLFTVRRDARRLPHVTRVVNPYEMPDVPGPLKDDTPHPSLPSELWRTVFERRFRNFRKNSVQPTIHVQRPGNQPKQKLMPDKHERDLWWEFVAGQPEAVWNPPKKPKQAKGKVKKGQGMRGFSEDFADYDDSRQAGGSKAGPDDGNVTLMYGEEDVSMEPVHPQASGYGSLPTPSGTPSRPEDGEIADTTAEVFIPREPTPALLNRIDHRLAIHLLVYFTNWLNHYVRHPEHFTNRLTDVHARWIFALLSRVDDYVGADDMSIIRNLARACIGLLKEQMWKKTLLAQAGADLIAEDVMSERSCWMVIAAVVDVWAQRDLWQDAEAMLKDLNAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.57
3 0.53
4 0.47
5 0.38
6 0.31
7 0.23
8 0.18
9 0.14
10 0.13
11 0.12
12 0.15
13 0.17
14 0.19
15 0.21
16 0.24
17 0.28
18 0.29
19 0.31
20 0.32
21 0.3
22 0.29
23 0.26
24 0.22
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.13
35 0.12
36 0.17
37 0.19
38 0.26
39 0.31
40 0.37
41 0.42
42 0.5
43 0.57
44 0.55
45 0.62
46 0.62
47 0.6
48 0.6
49 0.59
50 0.53
51 0.48
52 0.43
53 0.36
54 0.33
55 0.3
56 0.27
57 0.21
58 0.21
59 0.19
60 0.21
61 0.21
62 0.18
63 0.19
64 0.18
65 0.21
66 0.23
67 0.28
68 0.27
69 0.26
70 0.25
71 0.26
72 0.26
73 0.29
74 0.29
75 0.26
76 0.26
77 0.27
78 0.29
79 0.37
80 0.41
81 0.41
82 0.44
83 0.47
84 0.56
85 0.6
86 0.68
87 0.66
88 0.68
89 0.72
90 0.71
91 0.74
92 0.73
93 0.69
94 0.59
95 0.62
96 0.59
97 0.53
98 0.49
99 0.42
100 0.4
101 0.49
102 0.57
103 0.57
104 0.56
105 0.55
106 0.56
107 0.63
108 0.62
109 0.61
110 0.57
111 0.58
112 0.63
113 0.66
114 0.64
115 0.59
116 0.53
117 0.5
118 0.48
119 0.39
120 0.3
121 0.24
122 0.21
123 0.19
124 0.21
125 0.14
126 0.11
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.14
132 0.13
133 0.19
134 0.28
135 0.33
136 0.41
137 0.49
138 0.56
139 0.63
140 0.72
141 0.78
142 0.8
143 0.86
144 0.84
145 0.82
146 0.79
147 0.72
148 0.7
149 0.65
150 0.59
151 0.5
152 0.46
153 0.4
154 0.35
155 0.31
156 0.23
157 0.16
158 0.14
159 0.13
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.13
210 0.15
211 0.19
212 0.19
213 0.2
214 0.19
215 0.18
216 0.2
217 0.17
218 0.15
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.15
233 0.19
234 0.22
235 0.21
236 0.23
237 0.24
238 0.28
239 0.27
240 0.24
241 0.21
242 0.19
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.18
258 0.25
259 0.26
260 0.29
261 0.33
262 0.35
263 0.4
264 0.44
265 0.42
266 0.39
267 0.39
268 0.35
269 0.34
270 0.34
271 0.29
272 0.34
273 0.33
274 0.29
275 0.27
276 0.27
277 0.24
278 0.21
279 0.23
280 0.13
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.11
288 0.12
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.19
308 0.26
309 0.3
310 0.32
311 0.29
312 0.3
313 0.28
314 0.34
315 0.36
316 0.31
317 0.3
318 0.26
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.16
323 0.12
324 0.09
325 0.06
326 0.06
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.08
348 0.1
349 0.15
350 0.17
351 0.18
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.22
356 0.21
357 0.17
358 0.16