Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MIU8

Protein Details
Accession A0A5C3MIU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-34AKADAIQPVHKRRNNSKRNPAPRNGPSKHHydrophilic
535-597ATSKASKEKMKMRGRNKALKRYLRKQRKNVIDPKAIAVRQKLEREREERRKEREKARLGPAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-28KRRNNSKRNPAPR
538-603KASKEKMKMRGRNKALKRYLRKQRKNVIDPKAIAVRQKLEREREERRKEREKARLGPAAERKPSAL
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDSLIAKADAIQPVHKRRNNSKRNPAPRNGPSKHAPQTDSTLSSITHQTALPRSLRPSSPLPENAPTHNHVPNKKLRAELSRQSAQSIRRKQLIEDAAELLLVDDAGKMEVEGEMERTWRMTQEEICREAGAEAAKGRREWKLDGGPYRARYTRNGRHIAVMGRKGHVATFDWQTGTLHTELQLQETCRDIAFLHSHTHFAVAQQKHVFVYDQDGVELHKLKSHVEATRLEYLDYHWLLASISTAGHLQYLDATNGQIVAVHQTTRHKLGTPISMTKNPHNAVIHLGHQNGVVSLWTPNLPHPAVRLLAHLGPVQSVSVSIGSQGEGGRYMATAGKDGMVKVWDCRNWKGAVRSWRVRSAGDAEVEFSQRGMLAVASGGSVNVYTKPTLPAPNSPPPLYLTHPITHKPTTSIRFCPFQDILTVGHEKGLSSILVPGAGEPNFDSSEADPFENKRGRREREVKGLLDKIPADMIALDPDFVGSLGPSGTKEPDEGVPFARLPRLQRLKIQGKADETEVDADGGDGEGNDGDGDGAATSKASKEKMKMRGRNKALKRYLRKQRKNVIDPKAIAVRQKLEREREERRKEREKARLGPAAERKPSALDRFASNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.6
4 0.67
5 0.76
6 0.81
7 0.83
8 0.84
9 0.85
10 0.92
11 0.93
12 0.9
13 0.9
14 0.88
15 0.88
16 0.8
17 0.75
18 0.7
19 0.7
20 0.7
21 0.66
22 0.6
23 0.52
24 0.56
25 0.55
26 0.51
27 0.43
28 0.36
29 0.3
30 0.3
31 0.29
32 0.24
33 0.2
34 0.18
35 0.21
36 0.25
37 0.3
38 0.3
39 0.31
40 0.34
41 0.38
42 0.39
43 0.39
44 0.41
45 0.41
46 0.45
47 0.47
48 0.47
49 0.49
50 0.5
51 0.49
52 0.48
53 0.46
54 0.44
55 0.45
56 0.47
57 0.44
58 0.49
59 0.54
60 0.57
61 0.57
62 0.57
63 0.56
64 0.57
65 0.61
66 0.61
67 0.6
68 0.6
69 0.56
70 0.54
71 0.54
72 0.54
73 0.55
74 0.56
75 0.54
76 0.54
77 0.55
78 0.53
79 0.57
80 0.55
81 0.47
82 0.41
83 0.36
84 0.29
85 0.28
86 0.26
87 0.17
88 0.11
89 0.08
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.21
110 0.3
111 0.35
112 0.37
113 0.37
114 0.35
115 0.33
116 0.3
117 0.26
118 0.17
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.21
125 0.23
126 0.25
127 0.27
128 0.31
129 0.36
130 0.41
131 0.45
132 0.49
133 0.51
134 0.51
135 0.53
136 0.49
137 0.43
138 0.44
139 0.48
140 0.51
141 0.54
142 0.57
143 0.53
144 0.53
145 0.54
146 0.53
147 0.5
148 0.47
149 0.4
150 0.35
151 0.34
152 0.31
153 0.28
154 0.24
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.14
165 0.11
166 0.1
167 0.15
168 0.14
169 0.17
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.19
174 0.19
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.2
186 0.16
187 0.15
188 0.22
189 0.19
190 0.23
191 0.23
192 0.24
193 0.23
194 0.23
195 0.22
196 0.13
197 0.18
198 0.16
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.18
205 0.13
206 0.12
207 0.13
208 0.13
209 0.17
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.24
214 0.26
215 0.32
216 0.32
217 0.28
218 0.24
219 0.23
220 0.25
221 0.22
222 0.18
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.12
251 0.14
252 0.17
253 0.18
254 0.16
255 0.18
256 0.21
257 0.25
258 0.25
259 0.29
260 0.29
261 0.33
262 0.34
263 0.35
264 0.39
265 0.33
266 0.34
267 0.29
268 0.26
269 0.25
270 0.24
271 0.24
272 0.19
273 0.19
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.11
278 0.09
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.14
330 0.16
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.25
335 0.28
336 0.3
337 0.33
338 0.38
339 0.43
340 0.48
341 0.48
342 0.5
343 0.48
344 0.44
345 0.4
346 0.35
347 0.3
348 0.25
349 0.21
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.15
354 0.11
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.04
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.13
375 0.17
376 0.19
377 0.24
378 0.3
379 0.37
380 0.4
381 0.39
382 0.37
383 0.36
384 0.36
385 0.33
386 0.31
387 0.27
388 0.26
389 0.28
390 0.3
391 0.32
392 0.31
393 0.29
394 0.28
395 0.31
396 0.34
397 0.36
398 0.4
399 0.38
400 0.41
401 0.41
402 0.43
403 0.37
404 0.31
405 0.28
406 0.23
407 0.21
408 0.2
409 0.21
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.09
417 0.07
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.12
431 0.1
432 0.14
433 0.15
434 0.16
435 0.15
436 0.16
437 0.24
438 0.29
439 0.29
440 0.35
441 0.43
442 0.48
443 0.57
444 0.65
445 0.63
446 0.68
447 0.73
448 0.66
449 0.64
450 0.62
451 0.52
452 0.47
453 0.4
454 0.3
455 0.25
456 0.21
457 0.15
458 0.11
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.06
473 0.07
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.12
478 0.16
479 0.18
480 0.19
481 0.19
482 0.2
483 0.21
484 0.21
485 0.23
486 0.22
487 0.23
488 0.32
489 0.39
490 0.4
491 0.46
492 0.55
493 0.59
494 0.63
495 0.65
496 0.59
497 0.54
498 0.53
499 0.48
500 0.39
501 0.32
502 0.27
503 0.22
504 0.18
505 0.13
506 0.11
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.08
525 0.12
526 0.15
527 0.2
528 0.28
529 0.37
530 0.47
531 0.57
532 0.64
533 0.7
534 0.78
535 0.82
536 0.85
537 0.85
538 0.86
539 0.85
540 0.87
541 0.87
542 0.87
543 0.89
544 0.9
545 0.91
546 0.91
547 0.91
548 0.91
549 0.91
550 0.91
551 0.89
552 0.86
553 0.78
554 0.73
555 0.71
556 0.62
557 0.56
558 0.51
559 0.49
560 0.48
561 0.55
562 0.57
563 0.57
564 0.63
565 0.67
566 0.73
567 0.76
568 0.8
569 0.8
570 0.82
571 0.84
572 0.85
573 0.87
574 0.87
575 0.85
576 0.83
577 0.83
578 0.8
579 0.72
580 0.73
581 0.73
582 0.71
583 0.66
584 0.59
585 0.51
586 0.5
587 0.54
588 0.5
589 0.46
590 0.39
591 0.41