FuNGI

A0A5C3NDN2

Protein Details

Accession

A0A5C3NDN2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
773-796	LKELQAKEAERKRRQAQNNQGLGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MDEDIDWTDILRDHPIFKAKDETSNASGKAKMSEADLAVSALSKYTQLDPGDDGMSPSGRRQVMAARDGDLIVAAGDELRITSLGESKLNPGMSKSYKTLYTPNLAFEITQLAVNPNGKLLAVAGEYQVAVVVLPKPGFAKLVTPNVDCKSIQVGQFYHASATSIPIAKVEWHPWGEGGSTLLVMTVDGKLREYDVSVDPEEPQQTLLFVPERKKRSYIAQDETERVVASFALGKGKADWGPLTVYAVMKSGDIYAICPYMPINSSVPSDYVHSLDCFVAAKRQQLAQEGDTPESDALDAIYEYQHKYVAALMKQLPSGTVDPTDTRPNSMHPPSTIKVKPARQGPFLMQPAPRELNGSEDPYATDIAYLTFDVPEDFGEADTERLGIVTVAYDDGRVDVCLDVEKIEPKWDTKPKMDRGLPMLAVYETIDLGLLPMLARLSSEGMNDKPSNHPVILTDPVHDDAVYVYHAFGLHALHLGSVLQSLTTALQGDELGMEVAVGKSDAAVVRPMLSTFSGEQKVLNPVISVVIPSDIYLTSGIFVLTSTREIACFSLMLDIDEPQEPSEEKSATIEGPKDLSVSLRKSPEGPPAYVGLLGSDPYEPPEIYSNFSAQPPKDRPAAMRSDMITPDSLRFLGSTIEHFVHQIGAVRLAQRHAETRHELQIQEYQRQQEKLQELVSRCGELKGAQHIATLDKVKRLQDAQKALFRRLDRTLQAMMRKVSPELSQHEKKWFDELKRMKGEVLGATRYDEDSLATRVNLLRREYDRLLPSLKELQAKEAERKRRQAQNNQGLGLTQAFELGERSNEERVRIHALEEEISRLAARLDISLGNPPPLRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.32
3	0.32
4	0.34
5	0.41
6	0.38
7	0.44
8	0.48
9	0.49
10	0.46
11	0.5
12	0.49
13	0.43
14	0.43
15	0.36
16	0.33
17	0.28
18	0.24
19	0.22
20	0.24
21	0.22
22	0.21
23	0.2
24	0.17
25	0.15
26	0.15
27	0.12
28	0.09
29	0.08
30	0.08
31	0.09
32	0.12
33	0.18
34	0.18
35	0.2
36	0.22
37	0.24
38	0.24
39	0.22
40	0.21
41	0.17
42	0.19
43	0.17
44	0.17
45	0.22
46	0.21
47	0.21
48	0.22
49	0.27
50	0.31
51	0.36
52	0.36
53	0.31
54	0.31
55	0.31
56	0.29
57	0.22
58	0.15
59	0.09
60	0.07
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.05
68	0.05
69	0.06
70	0.11
71	0.13
72	0.15
73	0.16
74	0.19
75	0.23
76	0.24
77	0.24
78	0.21
79	0.27
80	0.29
81	0.33
82	0.32
83	0.31
84	0.33
85	0.35
86	0.4
87	0.37
88	0.41
89	0.38
90	0.37
91	0.36
92	0.33
93	0.3
94	0.24
95	0.22
96	0.15
97	0.14
98	0.12
99	0.12
100	0.15
101	0.17
102	0.16
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.12
107	0.11
108	0.1
109	0.09
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.08
116	0.06
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.13
126	0.12
127	0.17
128	0.2
129	0.28
130	0.32
131	0.32
132	0.37
133	0.38
134	0.4
135	0.35
136	0.3
137	0.28
138	0.28
139	0.29
140	0.27
141	0.26
142	0.25
143	0.28
144	0.27
145	0.21
146	0.17
147	0.17
148	0.12
149	0.14
150	0.15
151	0.14
152	0.14
153	0.13
154	0.14
155	0.16
156	0.19
157	0.19
158	0.21
159	0.21
160	0.21
161	0.21
162	0.21
163	0.19
164	0.16
165	0.14
166	0.09
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.06
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.1
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.13
182	0.14
183	0.18
184	0.18
185	0.19
186	0.19
187	0.21
188	0.21
189	0.18
190	0.16
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.14
196	0.16
197	0.23
198	0.3
199	0.35
200	0.37
201	0.39
202	0.39
203	0.45
204	0.52
205	0.53
206	0.52
207	0.55
208	0.56
209	0.56
210	0.55
211	0.46
212	0.36
213	0.27
214	0.2
215	0.12
216	0.09
217	0.1
218	0.09
219	0.12
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.15
224	0.16
225	0.14
226	0.14
227	0.12
228	0.13
229	0.13
230	0.14
231	0.13
232	0.12
233	0.11
234	0.12
235	0.11
236	0.09
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.14
256	0.15
257	0.14
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.14
267	0.14
268	0.17
269	0.18
270	0.2
271	0.21
272	0.25
273	0.28
274	0.24
275	0.29
276	0.28
277	0.27
278	0.24
279	0.24
280	0.19
281	0.16
282	0.13
283	0.07
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.11
296	0.15
297	0.14
298	0.18
299	0.19
300	0.2
301	0.2
302	0.2
303	0.17
304	0.15
305	0.15
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.15
311	0.21
312	0.19
313	0.2
314	0.19
315	0.22
316	0.27
317	0.29
318	0.28
319	0.24
320	0.29
321	0.28
322	0.36
323	0.34
324	0.32
325	0.37
326	0.39
327	0.43
328	0.45
329	0.48
330	0.42
331	0.43
332	0.41
333	0.42
334	0.39
335	0.37
336	0.3
337	0.27
338	0.29
339	0.28
340	0.25
341	0.19
342	0.17
343	0.2
344	0.2
345	0.21
346	0.17
347	0.16
348	0.16
349	0.15
350	0.16
351	0.1
352	0.08
353	0.06
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.08
393	0.07
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.19
398	0.25
399	0.28
400	0.33
401	0.41
402	0.44
403	0.51
404	0.51
405	0.47
406	0.44
407	0.43
408	0.36
409	0.28
410	0.23
411	0.15
412	0.13
413	0.11
414	0.07
415	0.05
416	0.04
417	0.04
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.02
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.05
429	0.05
430	0.06
431	0.08
432	0.08
433	0.13
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.17
438	0.19
439	0.17
440	0.16
441	0.13
442	0.16
443	0.19
444	0.17
445	0.15
446	0.15
447	0.16
448	0.15
449	0.14
450	0.11
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.03
471	0.03
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.09
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.15
508	0.18
509	0.17
510	0.16
511	0.12
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.11
553	0.13
554	0.12
555	0.12
556	0.13
557	0.14
558	0.13
559	0.15
560	0.15
561	0.12
562	0.13
563	0.13
564	0.12
565	0.11
566	0.13
567	0.16
568	0.18
569	0.22
570	0.23
571	0.24
572	0.26
573	0.29
574	0.35
575	0.34
576	0.31
577	0.28
578	0.27
579	0.27
580	0.25
581	0.22
582	0.13
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.07
587	0.06
588	0.08
589	0.1
590	0.09
591	0.1
592	0.15
593	0.16
594	0.18
595	0.19
596	0.19
597	0.19
598	0.22
599	0.26
600	0.21
601	0.29
602	0.31
603	0.33
604	0.35
605	0.35
606	0.35
607	0.37
608	0.42
609	0.36
610	0.35
611	0.33
612	0.33
613	0.33
614	0.31
615	0.26
616	0.2
617	0.19
618	0.17
619	0.15
620	0.12
621	0.11
622	0.1
623	0.11
624	0.1
625	0.11
626	0.13
627	0.14
628	0.14
629	0.14
630	0.14
631	0.12
632	0.12
633	0.14
634	0.11
635	0.13
636	0.14
637	0.16
638	0.17
639	0.17
640	0.19
641	0.17
642	0.22
643	0.22
644	0.27
645	0.3
646	0.33
647	0.39
648	0.39
649	0.38
650	0.34
651	0.4
652	0.37
653	0.38
654	0.37
655	0.36
656	0.39
657	0.41
658	0.4
659	0.4
660	0.4
661	0.37
662	0.37
663	0.37
664	0.34
665	0.38
666	0.38
667	0.32
668	0.29
669	0.27
670	0.23
671	0.2
672	0.2
673	0.21
674	0.23
675	0.22
676	0.22
677	0.22
678	0.23
679	0.25
680	0.28
681	0.23
682	0.25
683	0.28
684	0.29
685	0.32
686	0.36
687	0.4
688	0.42
689	0.5
690	0.5
691	0.54
692	0.56
693	0.55
694	0.56
695	0.5
696	0.46
697	0.43
698	0.43
699	0.38
700	0.4
701	0.42
702	0.42
703	0.45
704	0.45
705	0.42
706	0.39
707	0.38
708	0.34
709	0.31
710	0.29
711	0.29
712	0.3
713	0.37
714	0.4
715	0.42
716	0.5
717	0.5
718	0.48
719	0.52
720	0.54
721	0.49
722	0.53
723	0.57
724	0.59
725	0.62
726	0.62
727	0.53
728	0.48
729	0.47
730	0.42
731	0.38
732	0.31
733	0.25
734	0.26
735	0.26
736	0.25
737	0.23
738	0.17
739	0.14
740	0.14
741	0.16
742	0.15
743	0.14
744	0.16
745	0.19
746	0.23
747	0.27
748	0.27
749	0.32
750	0.34
751	0.42
752	0.43
753	0.47
754	0.46
755	0.45
756	0.46
757	0.39
758	0.4
759	0.4
760	0.4
761	0.4
762	0.37
763	0.39
764	0.43
765	0.46
766	0.51
767	0.53
768	0.59
769	0.61
770	0.69
771	0.72
772	0.75
773	0.81
774	0.82
775	0.84
776	0.85
777	0.83
778	0.75
779	0.66
780	0.56
781	0.48
782	0.38
783	0.28
784	0.17
785	0.11
786	0.09
787	0.09
788	0.11
789	0.1
790	0.11
791	0.14
792	0.17
793	0.23
794	0.25
795	0.27
796	0.28
797	0.31
798	0.37
799	0.34
800	0.32
801	0.3
802	0.3
803	0.31
804	0.3
805	0.29
806	0.21
807	0.21
808	0.19
809	0.15
810	0.14
811	0.12
812	0.12
813	0.1
814	0.12
815	0.13
816	0.14
817	0.21
818	0.22
819	0.26

A0A5C3NDN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer