Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N3N4

Protein Details
Accession A0A5C3N3N4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-347YYKNIERKMMLKKKRQNIHEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-340KK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSVKKSKLDLLVRVRYSNPLPAPPCPPKLLDIPTNPMRYTKPEFINAVADATPLPMIVDAECGMPLDLAKWACLWEEGVDDSELNPDPKNQPQLDPEDQFLLGDPNATPVPTSSSMPLTPHTAHVPWLRKTEYLSREGVSKASLSQETKQLDAPVDISRAAQIRDIEASFVSSNEAFDLSKLRHPNKPHVTAVESYEIFPDADIWANAYDLFRFSERPGERPVDVEDARLNSAILRPMESDGDHFLAYYLTKDDESAIEFTRARGDRSHASVDEEEPTAFHFVRDYEVVKVEQEVPNEFLLVIDDGDTQDASDAGSESRPERRHKGAYYKNIERKMMLKKKRQNIHEAYLDKWHVVKVSHVPMSKEEEDERDETMAEVMDPMYLLSRGDADAEGEVDDTILAPTGPSGSHTGGESIDITGTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.53
3 0.49
4 0.48
5 0.42
6 0.41
7 0.42
8 0.43
9 0.51
10 0.52
11 0.55
12 0.49
13 0.47
14 0.43
15 0.46
16 0.49
17 0.48
18 0.45
19 0.49
20 0.53
21 0.55
22 0.52
23 0.48
24 0.45
25 0.44
26 0.47
27 0.47
28 0.44
29 0.45
30 0.47
31 0.46
32 0.47
33 0.4
34 0.35
35 0.26
36 0.21
37 0.16
38 0.14
39 0.12
40 0.08
41 0.08
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.1
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.15
74 0.18
75 0.23
76 0.31
77 0.3
78 0.32
79 0.36
80 0.44
81 0.46
82 0.45
83 0.41
84 0.35
85 0.33
86 0.29
87 0.24
88 0.18
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.15
101 0.17
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.19
110 0.22
111 0.28
112 0.33
113 0.32
114 0.36
115 0.36
116 0.34
117 0.37
118 0.41
119 0.39
120 0.36
121 0.35
122 0.3
123 0.31
124 0.31
125 0.28
126 0.19
127 0.15
128 0.12
129 0.13
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.23
134 0.23
135 0.24
136 0.24
137 0.23
138 0.2
139 0.18
140 0.18
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.09
166 0.09
167 0.14
168 0.2
169 0.23
170 0.27
171 0.31
172 0.41
173 0.46
174 0.5
175 0.47
176 0.43
177 0.43
178 0.4
179 0.38
180 0.32
181 0.24
182 0.19
183 0.17
184 0.16
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.16
203 0.17
204 0.19
205 0.22
206 0.24
207 0.23
208 0.24
209 0.25
210 0.22
211 0.22
212 0.2
213 0.18
214 0.16
215 0.17
216 0.15
217 0.13
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.22
253 0.23
254 0.27
255 0.3
256 0.24
257 0.26
258 0.26
259 0.26
260 0.23
261 0.2
262 0.16
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.15
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.1
305 0.17
306 0.23
307 0.28
308 0.34
309 0.4
310 0.47
311 0.52
312 0.61
313 0.63
314 0.68
315 0.72
316 0.76
317 0.77
318 0.75
319 0.7
320 0.61
321 0.57
322 0.58
323 0.59
324 0.59
325 0.61
326 0.65
327 0.74
328 0.8
329 0.79
330 0.78
331 0.76
332 0.73
333 0.72
334 0.64
335 0.57
336 0.55
337 0.51
338 0.41
339 0.35
340 0.28
341 0.22
342 0.2
343 0.23
344 0.23
345 0.29
346 0.34
347 0.36
348 0.37
349 0.38
350 0.45
351 0.42
352 0.38
353 0.33
354 0.31
355 0.33
356 0.32
357 0.3
358 0.23
359 0.21
360 0.19
361 0.17
362 0.14
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.12
395 0.13
396 0.15
397 0.16
398 0.17
399 0.16
400 0.18
401 0.16
402 0.13