Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N2U4

Protein Details
Accession A0A5C3N2U4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-87AGDVEKGETKKKDKKKSKSSRKRKNAKDKDGPILEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-85GETKKKDKKKSKSSRKRKNAKDKDGPIL
88-88R
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10, cyto 6, mito 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR041617  TPR_MalT  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF17874  TPR_MalT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MSENASNSSLVDRVQSFVAENRRAVLIGTAAAVVAAAGVAYYASTSSRPPSAGDVEKGETKKKDKKKSKSSRKRKNAKDKDGPILEERKPKTAEVSAEQIAAMSEEEKIKVAASLKAKGNSAYQSRRFSAAADFYTRAIAVSPKPEPVFYSNRAACYVNMSPPKYEQVVEDCDAALKLDSLYVKALNRRAMALEALDRLEDALRDFTAATILDKFQNETSAQSVERVLKKLSTRKATEILANREKRLPSHTFVTAYFAAFRSRPLPTLPENPTQGDETLLKALQALEAADYPHAMTLTNEALEQGISFDDGKAEGLNLSGTFKFLVGDIPGAKEDLLRSVEIVPSYTQSWVKLASVYMEQGDPPKAFEAFEEAIKHNPKDPDIFYHRGQVLFIMNEFTRAADDYTKSTELDSNFVFSHIQLAVAQYKSGALSSSMATFRRTLKAFPQRSEPQNYYGELLLDQQRFQDAVEKFDRAIELERAKAPPMNVLPLVNKGLALYQWKQDITAAERCCDEALEIDPECEAAVATLAQLSLQQGKIDRAVQMFERQSELARSEPELANALTYQFASWAQLDFMKNYPQLAESLSQLALNMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.22
5 0.3
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.3
10 0.29
11 0.28
12 0.23
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.06
21 0.04
22 0.03
23 0.02
24 0.02
25 0.02
26 0.02
27 0.02
28 0.03
29 0.03
30 0.05
31 0.06
32 0.08
33 0.12
34 0.14
35 0.15
36 0.17
37 0.21
38 0.27
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.34
43 0.4
44 0.41
45 0.43
46 0.42
47 0.47
48 0.54
49 0.6
50 0.68
51 0.72
52 0.81
53 0.85
54 0.9
55 0.93
56 0.94
57 0.96
58 0.96
59 0.96
60 0.96
61 0.96
62 0.96
63 0.96
64 0.95
65 0.94
66 0.9
67 0.89
68 0.82
69 0.74
70 0.69
71 0.65
72 0.6
73 0.58
74 0.53
75 0.5
76 0.48
77 0.45
78 0.44
79 0.41
80 0.4
81 0.35
82 0.39
83 0.33
84 0.31
85 0.3
86 0.25
87 0.2
88 0.16
89 0.12
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.13
99 0.17
100 0.2
101 0.26
102 0.3
103 0.33
104 0.33
105 0.32
106 0.34
107 0.34
108 0.38
109 0.41
110 0.43
111 0.46
112 0.47
113 0.48
114 0.45
115 0.4
116 0.37
117 0.34
118 0.29
119 0.28
120 0.27
121 0.24
122 0.25
123 0.23
124 0.18
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.16
129 0.17
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.24
134 0.27
135 0.31
136 0.3
137 0.38
138 0.35
139 0.36
140 0.38
141 0.36
142 0.3
143 0.3
144 0.29
145 0.27
146 0.31
147 0.31
148 0.3
149 0.31
150 0.34
151 0.29
152 0.28
153 0.22
154 0.21
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.11
163 0.07
164 0.05
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.11
170 0.13
171 0.17
172 0.21
173 0.23
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.22
178 0.2
179 0.17
180 0.15
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.18
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.21
216 0.26
217 0.33
218 0.38
219 0.4
220 0.4
221 0.42
222 0.45
223 0.42
224 0.43
225 0.43
226 0.43
227 0.45
228 0.44
229 0.42
230 0.42
231 0.41
232 0.37
233 0.36
234 0.32
235 0.26
236 0.28
237 0.29
238 0.27
239 0.26
240 0.29
241 0.24
242 0.2
243 0.18
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.18
254 0.26
255 0.29
256 0.31
257 0.32
258 0.32
259 0.32
260 0.29
261 0.25
262 0.19
263 0.15
264 0.12
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.04
292 0.03
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.12
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.14
356 0.13
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.22
361 0.24
362 0.25
363 0.24
364 0.24
365 0.24
366 0.25
367 0.25
368 0.28
369 0.32
370 0.36
371 0.32
372 0.37
373 0.37
374 0.33
375 0.32
376 0.26
377 0.2
378 0.16
379 0.16
380 0.12
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.17
397 0.19
398 0.17
399 0.16
400 0.15
401 0.16
402 0.15
403 0.11
404 0.13
405 0.1
406 0.11
407 0.08
408 0.1
409 0.14
410 0.13
411 0.13
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.11
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.17
425 0.19
426 0.24
427 0.25
428 0.24
429 0.32
430 0.41
431 0.46
432 0.46
433 0.52
434 0.53
435 0.58
436 0.64
437 0.56
438 0.51
439 0.48
440 0.47
441 0.39
442 0.32
443 0.27
444 0.19
445 0.2
446 0.22
447 0.2
448 0.19
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.22
454 0.16
455 0.21
456 0.24
457 0.25
458 0.24
459 0.25
460 0.25
461 0.19
462 0.22
463 0.22
464 0.21
465 0.23
466 0.26
467 0.26
468 0.27
469 0.28
470 0.25
471 0.25
472 0.25
473 0.26
474 0.24
475 0.25
476 0.25
477 0.26
478 0.28
479 0.21
480 0.19
481 0.15
482 0.15
483 0.15
484 0.19
485 0.18
486 0.19
487 0.23
488 0.23
489 0.23
490 0.24
491 0.26
492 0.26
493 0.31
494 0.29
495 0.27
496 0.27
497 0.28
498 0.26
499 0.22
500 0.18
501 0.12
502 0.13
503 0.16
504 0.16
505 0.15
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.11
510 0.08
511 0.04
512 0.05
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.08
520 0.11
521 0.12
522 0.14
523 0.16
524 0.18
525 0.22
526 0.23
527 0.24
528 0.21
529 0.24
530 0.24
531 0.3
532 0.31
533 0.29
534 0.31
535 0.28
536 0.29
537 0.29
538 0.29
539 0.24
540 0.23
541 0.24
542 0.26
543 0.26
544 0.26
545 0.25
546 0.23
547 0.22
548 0.2
549 0.18
550 0.14
551 0.13
552 0.11
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.17
560 0.19
561 0.2
562 0.23
563 0.27
564 0.27
565 0.27
566 0.27
567 0.23
568 0.22
569 0.23
570 0.21
571 0.17
572 0.19
573 0.18
574 0.17