Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NHK6

Protein Details
Accession A0A5C3NHK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
734-763AAGHRVRKKALSKRASRMLRWKLVRLRRQWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-46RGKGGRPARNSEARTLKVLTKRKERG
522-534RRAGRIRNGARRR
737-757HRVRKKALSKRASRMLRWKLV
Subcellular Location(s) mito 13, cyto 7.5, cyto_nucl 5, plas 2, nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MACSSSREVCNWSILLSNPSRGKGGRPARNSEARTLKVLTKRKERGGGGGEAVRSENYSDTFTGYPCLDRHPVLSGSLQSLCIGLPEASSSTGNLSRAEKAGQYLAASPFPEKALKLLRIIHKIGYELRPRTYEAVVHQLVKGQRWNLILQVVNLARLHIGRSSIRLLNWRTLALLQLGHYTLLDMTLDAFQRDGLDPNRTTFHLLITGHIRNRDLGKARLYLYKMEQAGIPVDSSTYATVVSVYRSLGPDLAVQTQAMNALPAAEAHIATRILNSLMQFGIDAHDADRVVEVMSMFDQDSWGPQNVAAADGDSMPSIGASDHQTKELPRPLSPNASTAARLISFMSKQRDLPGVLQIFYRMQAAGVVPDARVAAALVRAHVSLGDEATAVRLVADMCPSNVPRSLLIPIGLARDGLPAVPVQLPQSLLTVHVLNALLKGVVKSHRIRGFIYILRIMRIVAIQPDAHTLNILLHYLESTEGVQDTDALRILRSLSGLTPAPTLKLVHKVLKVALRRDSSITRRAGRIRNGARRRPMLSATAATTDPTAGIRARRTAALVMPLIKSLVSRGVRNDAAVYALRIRHDAIKGDMDGARSVLRDMVARGIHPNEYHYSALMAGYAMSGDLSVARGVMREAAAAGVAPNVVLYTILIHGHARHGQMGLALRTFDKMVEAGVKPDFTAVDTLVRASLARHQYDTAKKILLNLWTLVAPFPEEAWHRPLESLVEEFRSLPAAGHRVRKKALSKRASRMLRWKLVRLRRQWELTASQPSPQAMLSQVQPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.27
4 0.33
5 0.32
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.37
10 0.4
11 0.48
12 0.5
13 0.53
14 0.59
15 0.64
16 0.72
17 0.71
18 0.69
19 0.68
20 0.61
21 0.59
22 0.54
23 0.53
24 0.53
25 0.59
26 0.59
27 0.61
28 0.66
29 0.7
30 0.75
31 0.69
32 0.68
33 0.65
34 0.6
35 0.53
36 0.49
37 0.41
38 0.34
39 0.33
40 0.25
41 0.2
42 0.17
43 0.15
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.2
53 0.18
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.25
58 0.27
59 0.27
60 0.26
61 0.28
62 0.24
63 0.24
64 0.24
65 0.23
66 0.18
67 0.17
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.2
83 0.21
84 0.22
85 0.24
86 0.21
87 0.2
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.2
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.16
100 0.19
101 0.25
102 0.27
103 0.3
104 0.36
105 0.41
106 0.45
107 0.47
108 0.44
109 0.38
110 0.38
111 0.4
112 0.4
113 0.41
114 0.38
115 0.4
116 0.39
117 0.4
118 0.41
119 0.37
120 0.32
121 0.27
122 0.32
123 0.31
124 0.3
125 0.28
126 0.3
127 0.3
128 0.3
129 0.32
130 0.24
131 0.26
132 0.27
133 0.28
134 0.25
135 0.27
136 0.25
137 0.21
138 0.26
139 0.22
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.11
147 0.14
148 0.13
149 0.16
150 0.2
151 0.22
152 0.23
153 0.29
154 0.3
155 0.33
156 0.33
157 0.31
158 0.27
159 0.25
160 0.25
161 0.19
162 0.17
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.14
183 0.2
184 0.21
185 0.23
186 0.25
187 0.24
188 0.26
189 0.23
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.2
194 0.23
195 0.27
196 0.26
197 0.28
198 0.27
199 0.25
200 0.27
201 0.31
202 0.3
203 0.29
204 0.3
205 0.32
206 0.33
207 0.36
208 0.35
209 0.32
210 0.3
211 0.32
212 0.29
213 0.26
214 0.24
215 0.2
216 0.2
217 0.17
218 0.14
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.05
307 0.08
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.22
314 0.27
315 0.26
316 0.22
317 0.26
318 0.27
319 0.33
320 0.33
321 0.29
322 0.24
323 0.23
324 0.23
325 0.19
326 0.17
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.15
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.23
338 0.22
339 0.22
340 0.23
341 0.2
342 0.19
343 0.19
344 0.18
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.09
429 0.14
430 0.16
431 0.23
432 0.27
433 0.29
434 0.3
435 0.31
436 0.33
437 0.3
438 0.31
439 0.27
440 0.23
441 0.22
442 0.22
443 0.18
444 0.14
445 0.12
446 0.1
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.1
452 0.11
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.12
491 0.19
492 0.21
493 0.25
494 0.26
495 0.27
496 0.29
497 0.34
498 0.36
499 0.33
500 0.37
501 0.34
502 0.34
503 0.36
504 0.38
505 0.37
506 0.4
507 0.41
508 0.37
509 0.4
510 0.46
511 0.49
512 0.49
513 0.54
514 0.56
515 0.61
516 0.67
517 0.69
518 0.7
519 0.69
520 0.65
521 0.59
522 0.52
523 0.45
524 0.39
525 0.34
526 0.28
527 0.25
528 0.22
529 0.19
530 0.16
531 0.13
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.11
537 0.13
538 0.16
539 0.17
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.18
544 0.19
545 0.18
546 0.18
547 0.17
548 0.16
549 0.15
550 0.13
551 0.12
552 0.09
553 0.16
554 0.15
555 0.17
556 0.19
557 0.24
558 0.25
559 0.25
560 0.25
561 0.17
562 0.18
563 0.16
564 0.15
565 0.13
566 0.15
567 0.15
568 0.15
569 0.16
570 0.18
571 0.2
572 0.21
573 0.2
574 0.21
575 0.21
576 0.23
577 0.23
578 0.19
579 0.18
580 0.16
581 0.15
582 0.12
583 0.12
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.1
588 0.14
589 0.14
590 0.14
591 0.17
592 0.18
593 0.2
594 0.19
595 0.21
596 0.2
597 0.22
598 0.22
599 0.19
600 0.18
601 0.16
602 0.15
603 0.12
604 0.09
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.04
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.08
640 0.09
641 0.13
642 0.17
643 0.17
644 0.17
645 0.17
646 0.16
647 0.19
648 0.22
649 0.2
650 0.17
651 0.17
652 0.16
653 0.17
654 0.17
655 0.14
656 0.11
657 0.09
658 0.1
659 0.14
660 0.15
661 0.16
662 0.18
663 0.18
664 0.17
665 0.17
666 0.16
667 0.12
668 0.13
669 0.11
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.12
674 0.12
675 0.11
676 0.11
677 0.18
678 0.22
679 0.24
680 0.25
681 0.27
682 0.35
683 0.42
684 0.45
685 0.41
686 0.37
687 0.35
688 0.37
689 0.39
690 0.35
691 0.3
692 0.28
693 0.25
694 0.23
695 0.23
696 0.2
697 0.16
698 0.14
699 0.11
700 0.1
701 0.13
702 0.16
703 0.19
704 0.23
705 0.24
706 0.23
707 0.24
708 0.24
709 0.23
710 0.22
711 0.22
712 0.2
713 0.21
714 0.21
715 0.21
716 0.21
717 0.2
718 0.18
719 0.16
720 0.18
721 0.23
722 0.27
723 0.37
724 0.42
725 0.46
726 0.5
727 0.56
728 0.61
729 0.64
730 0.7
731 0.7
732 0.74
733 0.77
734 0.83
735 0.83
736 0.81
737 0.81
738 0.81
739 0.8
740 0.76
741 0.76
742 0.76
743 0.79
744 0.8
745 0.79
746 0.77
747 0.76
748 0.76
749 0.71
750 0.68
751 0.63
752 0.6
753 0.6
754 0.53
755 0.47
756 0.45
757 0.41
758 0.36
759 0.31
760 0.26
761 0.19
762 0.21