Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NDX4

Protein Details
Accession A0A5C3NDX4    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-49DSEPERAETRRKEKENRRVKRQMKGQDTFTHydrophilic
478-503TLNADEPSKKRRKAKTTSPKETVKKVHydrophilic
513-538SVQSGTPKSTRKRKSKATTGQEDDVKHydrophilic
598-621IIYHGAGPDRNQKKRRRRKKSKGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-40RRKEKENRRVKR
311-317PKRKGRR
486-493KKRRKAKT
607-621RNQKKRRRRKKSKGI
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MRPRTVRAADTDAETDIVDDSEPERAETRRKEKENRRVKRQMKGQDTFTKNSNKSIITAAVQLLGRPLHIAAASEVPSISSISLRGPMQLNDVIDDAISSSALSVHIAGSRAVSSVSSFVESEVSLPGPAALSPGTPRPPTQEAQLISQQPRSPGAVSVPSDDEEDIEAADRLSLGRFAHINSSKAVRPMKLAPMISRSMPEGSSGSGTKQNRTKPAHRFVSDFSDAEVAKVTKCVSCDLEWTTRKTSLQKMLHIQTCAKKSGLTDETVKVLVRRQIGKASDEGPGESGASAAADERAETYLEDVLGREAPKRKGRRPEVQRTVKSATDSRNAIMDKARLLLGPSAIGISDGQGASSLPATQSFGPSKFRDTVRDGLAERSASPSSYNTTNEEAPYAVKMRPPAAVVTTSFGSVNEHVPLTPSRANHRRQFDHVSPDLVEAIDLSNMSDDGASFYGMNNDNIMWQDDGALLHFDPSSTLNADEPSKKRRKAKTTSPKETVKKVTECETSSSGSVQSGTPKSTRKRKSKATTGQEDDVKEDKFKEAMRNAIMQDKTLHLRILRYEPIHYDVFVQLAVDQGFPLRGLNPKLMSCLDDLAIIYHGAGPDRNQKKRRRRKKSKGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.2
3 0.14
4 0.12
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.19
13 0.28
14 0.37
15 0.46
16 0.52
17 0.6
18 0.7
19 0.78
20 0.85
21 0.88
22 0.88
23 0.89
24 0.9
25 0.88
26 0.88
27 0.87
28 0.86
29 0.86
30 0.81
31 0.79
32 0.78
33 0.77
34 0.7
35 0.67
36 0.66
37 0.57
38 0.57
39 0.53
40 0.44
41 0.4
42 0.4
43 0.37
44 0.28
45 0.29
46 0.24
47 0.23
48 0.22
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.13
71 0.13
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.22
76 0.24
77 0.23
78 0.2
79 0.21
80 0.17
81 0.14
82 0.13
83 0.1
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.13
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.25
126 0.29
127 0.3
128 0.32
129 0.34
130 0.31
131 0.35
132 0.4
133 0.39
134 0.37
135 0.4
136 0.38
137 0.32
138 0.33
139 0.3
140 0.25
141 0.2
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.23
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.17
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.19
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.25
171 0.25
172 0.3
173 0.32
174 0.24
175 0.25
176 0.28
177 0.32
178 0.34
179 0.33
180 0.29
181 0.31
182 0.32
183 0.29
184 0.26
185 0.21
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.12
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.18
195 0.19
196 0.23
197 0.28
198 0.33
199 0.4
200 0.46
201 0.53
202 0.55
203 0.64
204 0.67
205 0.63
206 0.6
207 0.54
208 0.55
209 0.49
210 0.4
211 0.31
212 0.26
213 0.24
214 0.21
215 0.21
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.19
227 0.27
228 0.28
229 0.31
230 0.31
231 0.31
232 0.33
233 0.33
234 0.36
235 0.37
236 0.38
237 0.39
238 0.42
239 0.46
240 0.47
241 0.45
242 0.42
243 0.38
244 0.37
245 0.35
246 0.29
247 0.24
248 0.21
249 0.27
250 0.25
251 0.21
252 0.22
253 0.21
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.15
258 0.15
259 0.17
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.24
264 0.25
265 0.26
266 0.25
267 0.23
268 0.22
269 0.2
270 0.19
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.1
296 0.14
297 0.2
298 0.28
299 0.34
300 0.4
301 0.49
302 0.56
303 0.63
304 0.68
305 0.74
306 0.77
307 0.79
308 0.76
309 0.71
310 0.67
311 0.58
312 0.5
313 0.43
314 0.36
315 0.31
316 0.29
317 0.24
318 0.24
319 0.23
320 0.22
321 0.2
322 0.17
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.18
353 0.18
354 0.21
355 0.24
356 0.25
357 0.27
358 0.3
359 0.32
360 0.3
361 0.32
362 0.3
363 0.27
364 0.28
365 0.23
366 0.19
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.16
376 0.19
377 0.2
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.16
390 0.15
391 0.14
392 0.15
393 0.14
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.12
406 0.13
407 0.16
408 0.17
409 0.18
410 0.26
411 0.33
412 0.4
413 0.46
414 0.53
415 0.52
416 0.55
417 0.62
418 0.57
419 0.57
420 0.52
421 0.47
422 0.39
423 0.36
424 0.3
425 0.22
426 0.17
427 0.09
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.12
443 0.13
444 0.14
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.1
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.13
468 0.17
469 0.23
470 0.26
471 0.34
472 0.42
473 0.49
474 0.57
475 0.65
476 0.72
477 0.74
478 0.81
479 0.82
480 0.85
481 0.87
482 0.86
483 0.86
484 0.81
485 0.79
486 0.76
487 0.73
488 0.66
489 0.59
490 0.58
491 0.54
492 0.5
493 0.47
494 0.41
495 0.35
496 0.31
497 0.29
498 0.24
499 0.19
500 0.18
501 0.14
502 0.18
503 0.19
504 0.21
505 0.24
506 0.32
507 0.4
508 0.5
509 0.59
510 0.62
511 0.7
512 0.78
513 0.84
514 0.87
515 0.88
516 0.88
517 0.88
518 0.84
519 0.8
520 0.74
521 0.65
522 0.58
523 0.52
524 0.43
525 0.35
526 0.3
527 0.26
528 0.24
529 0.27
530 0.31
531 0.31
532 0.36
533 0.37
534 0.4
535 0.4
536 0.44
537 0.41
538 0.34
539 0.32
540 0.3
541 0.31
542 0.28
543 0.3
544 0.23
545 0.26
546 0.29
547 0.34
548 0.36
549 0.34
550 0.35
551 0.36
552 0.38
553 0.37
554 0.32
555 0.28
556 0.22
557 0.21
558 0.18
559 0.15
560 0.11
561 0.13
562 0.13
563 0.1
564 0.09
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.1
570 0.16
571 0.19
572 0.24
573 0.27
574 0.28
575 0.31
576 0.32
577 0.31
578 0.27
579 0.26
580 0.21
581 0.18
582 0.17
583 0.15
584 0.15
585 0.13
586 0.11
587 0.11
588 0.11
589 0.11
590 0.12
591 0.15
592 0.24
593 0.34
594 0.44
595 0.51
596 0.61
597 0.71
598 0.82
599 0.89
600 0.9
601 0.92