Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MJY2

Protein Details
Accession A0A5C3MJY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-491RGATRARRARGGRRGRGRGRGRGABasic
505-526AVPPPKTRGRGRGRGRGRGRGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
466-490PSRGATRARRARGGRRGRGRGRGRG
508-526PPKTRGRGRGRGRGRGRGG
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MIRTTQSFTFSQSPYFDDRGPHGYAQPLTEHVNPHSRPIVSYYFPKGVGEHHYGQLHPMKPHRLTLTNALVLGYGLDKQIHNIYNPPLATRAELLGYHDDDYIDFLSKVTPQNQTEMKNLVDGFNCGEDCPIFADMYTFCRMSAGGSLAAARKLCAKTTDIAINWSGGLHHAKRGEASGFCYVNDIVLGILELLKYYPRVLYIDIDIHHGDGVEHAFYHSNRVMTVSFHKYNGEFFPGTGKLDDNGTGLGKHFCLNVPLQDGINDEMYVTLFKGVIGGVVGHFNPSAIVLQCGADSLGCDRLGAFNLSIAAHGECVNFVRMQGRPLMIVGGGGYTVKNVSRCWTYETGVLVGATLPDELPATVYDSFFRDSQWKLHPPLTGRVQNQNTAASLQRIQRAVDQKLRYLEHAPSVQMRELPPDLERWLIDELKEEAMIDTREERSILRNEFFDGDGDNDAGDAVPPAPPSRGATRARRARGGRRGRGRGRGRGATTTVAHETGDESEAVPPPKTRGRGRGRGRGRGRGGASVRVEQEPEDNGPEEAAEERAGTEPKRAEGGESARDGESVVPAGTSGIPMDLDVDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.35
4 0.31
5 0.34
6 0.35
7 0.37
8 0.35
9 0.31
10 0.33
11 0.33
12 0.31
13 0.29
14 0.27
15 0.28
16 0.29
17 0.3
18 0.28
19 0.36
20 0.35
21 0.38
22 0.41
23 0.37
24 0.35
25 0.37
26 0.39
27 0.33
28 0.38
29 0.39
30 0.37
31 0.37
32 0.37
33 0.32
34 0.3
35 0.33
36 0.34
37 0.31
38 0.33
39 0.34
40 0.33
41 0.38
42 0.42
43 0.4
44 0.39
45 0.42
46 0.45
47 0.45
48 0.51
49 0.52
50 0.49
51 0.48
52 0.5
53 0.51
54 0.44
55 0.42
56 0.36
57 0.3
58 0.26
59 0.23
60 0.15
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.17
67 0.19
68 0.19
69 0.23
70 0.25
71 0.29
72 0.29
73 0.28
74 0.25
75 0.24
76 0.24
77 0.21
78 0.19
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.17
89 0.15
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.18
96 0.2
97 0.26
98 0.25
99 0.31
100 0.36
101 0.39
102 0.39
103 0.38
104 0.34
105 0.31
106 0.3
107 0.26
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.16
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.09
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.14
124 0.16
125 0.14
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.23
146 0.28
147 0.22
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.19
152 0.17
153 0.13
154 0.1
155 0.14
156 0.13
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.2
163 0.17
164 0.19
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.21
169 0.19
170 0.16
171 0.15
172 0.12
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.2
213 0.23
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.25
219 0.24
220 0.22
221 0.16
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.09
327 0.12
328 0.13
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.21
333 0.22
334 0.2
335 0.18
336 0.17
337 0.12
338 0.09
339 0.08
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.19
359 0.25
360 0.29
361 0.31
362 0.34
363 0.36
364 0.35
365 0.41
366 0.43
367 0.43
368 0.41
369 0.47
370 0.45
371 0.46
372 0.44
373 0.38
374 0.31
375 0.26
376 0.24
377 0.17
378 0.19
379 0.19
380 0.22
381 0.22
382 0.22
383 0.27
384 0.32
385 0.35
386 0.39
387 0.37
388 0.37
389 0.41
390 0.41
391 0.37
392 0.34
393 0.3
394 0.27
395 0.27
396 0.25
397 0.23
398 0.25
399 0.23
400 0.23
401 0.21
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.18
406 0.17
407 0.18
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.17
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.17
416 0.16
417 0.16
418 0.14
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.14
428 0.17
429 0.23
430 0.26
431 0.25
432 0.24
433 0.26
434 0.27
435 0.26
436 0.22
437 0.16
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.1
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.06
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.11
453 0.14
454 0.18
455 0.26
456 0.31
457 0.4
458 0.49
459 0.57
460 0.61
461 0.66
462 0.68
463 0.7
464 0.74
465 0.76
466 0.75
467 0.76
468 0.82
469 0.81
470 0.84
471 0.82
472 0.81
473 0.79
474 0.76
475 0.69
476 0.64
477 0.59
478 0.53
479 0.47
480 0.42
481 0.36
482 0.28
483 0.25
484 0.2
485 0.19
486 0.16
487 0.15
488 0.11
489 0.1
490 0.12
491 0.16
492 0.18
493 0.18
494 0.18
495 0.22
496 0.28
497 0.35
498 0.38
499 0.45
500 0.53
501 0.62
502 0.7
503 0.76
504 0.78
505 0.81
506 0.82
507 0.81
508 0.76
509 0.74
510 0.67
511 0.65
512 0.59
513 0.56
514 0.53
515 0.48
516 0.45
517 0.39
518 0.37
519 0.3
520 0.3
521 0.25
522 0.24
523 0.22
524 0.21
525 0.19
526 0.18
527 0.17
528 0.16
529 0.13
530 0.12
531 0.09
532 0.08
533 0.1
534 0.13
535 0.16
536 0.16
537 0.21
538 0.22
539 0.24
540 0.27
541 0.26
542 0.26
543 0.3
544 0.34
545 0.34
546 0.34
547 0.35
548 0.31
549 0.31
550 0.29
551 0.23
552 0.19
553 0.14
554 0.12
555 0.09
556 0.09
557 0.1
558 0.1
559 0.09
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07