Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MS76

Protein Details
Accession A0A5C3MS76    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-46GPSTNPSKAPPAKRQRKKKDAEAPIPEKREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-49KAPPAKRQRKKKDAEAPIPEKREARF
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MGSKRHLEDYPVMPAAGPSTNPSKAPPAKRQRKKKDAEAPIPEKREARFKSKCPQAILERVDRVAAQRFFMIDRKRDGDELHEEFNVLGSTGNVYTVVIDKRPSCNCPDFGKGNHCKHILFIFMKVLQVPYESSHWYQKALLSTELAEIFAQAPLAPNSVAHPHIRDAYARATGKKLASTSAAPNQKRRMPSEEDDCPICYENMHKEDVKKLAFCESCGNGLHLQCFQQWARSKVKPDCVFCRAEWVVPGPAGAKAGRSAEGYVNLAGVAGLSPQRDTSSYYHGPRRGQRYYGYQNYEELF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.21
4 0.17
5 0.14
6 0.19
7 0.21
8 0.22
9 0.24
10 0.32
11 0.38
12 0.46
13 0.54
14 0.59
15 0.68
16 0.78
17 0.87
18 0.89
19 0.91
20 0.91
21 0.91
22 0.9
23 0.9
24 0.89
25 0.88
26 0.85
27 0.83
28 0.79
29 0.71
30 0.63
31 0.55
32 0.55
33 0.49
34 0.5
35 0.5
36 0.52
37 0.59
38 0.65
39 0.69
40 0.63
41 0.66
42 0.63
43 0.64
44 0.62
45 0.59
46 0.51
47 0.46
48 0.42
49 0.35
50 0.31
51 0.3
52 0.26
53 0.21
54 0.19
55 0.2
56 0.21
57 0.28
58 0.31
59 0.26
60 0.3
61 0.33
62 0.34
63 0.34
64 0.33
65 0.31
66 0.33
67 0.32
68 0.3
69 0.26
70 0.25
71 0.23
72 0.23
73 0.18
74 0.1
75 0.07
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.12
87 0.13
88 0.19
89 0.22
90 0.24
91 0.26
92 0.3
93 0.33
94 0.35
95 0.38
96 0.36
97 0.36
98 0.44
99 0.47
100 0.47
101 0.49
102 0.46
103 0.41
104 0.39
105 0.37
106 0.32
107 0.24
108 0.21
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.18
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.19
157 0.19
158 0.19
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.18
168 0.23
169 0.31
170 0.31
171 0.36
172 0.4
173 0.43
174 0.44
175 0.45
176 0.43
177 0.42
178 0.45
179 0.46
180 0.45
181 0.43
182 0.41
183 0.37
184 0.33
185 0.27
186 0.22
187 0.16
188 0.14
189 0.18
190 0.2
191 0.22
192 0.22
193 0.23
194 0.28
195 0.33
196 0.32
197 0.27
198 0.25
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.29
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.26
207 0.21
208 0.21
209 0.22
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.19
214 0.17
215 0.22
216 0.27
217 0.3
218 0.37
219 0.41
220 0.48
221 0.5
222 0.6
223 0.59
224 0.6
225 0.62
226 0.59
227 0.58
228 0.5
229 0.52
230 0.43
231 0.37
232 0.33
233 0.29
234 0.26
235 0.22
236 0.23
237 0.15
238 0.14
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.1
255 0.08
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.12
264 0.16
265 0.18
266 0.26
267 0.32
268 0.39
269 0.47
270 0.5
271 0.57
272 0.61
273 0.67
274 0.64
275 0.61
276 0.6
277 0.62
278 0.66
279 0.68
280 0.66
281 0.59