Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NH06

Protein Details
Accession A0A5C3NH06    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-38IEERKRLSPEAKRRKVSRNARQAGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-31RKRLSPEAKRRKVSR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
Amino Acid Sequences MPFSNRTSEFREIIEERKRLSPEAKRRKVSRNARQAGPPDSQLPLNKQYLQEAYLILKHVNTLMRMLVAIRKPYLNVDSRQGPFGGPSHASSGLDLFNLDNPESSWSSIRHLSNEERDQIDLQARVVLSRCADRVKDLEEVEKRRHEMEASRTNPLARLLPARLLQSASPSLATSDMVAAHHASITWYLSRRLAEASQTQKEMQEERVKRQMERTKTLGSGAAREVAVMGLSDTSSDDDRYGSGSWLGNASSSFASTLLGAPSTASRANNPSPPLTSTSFHDSDQLSDDDMELTQSQIMQFESENSQILQSMQNTLEAVQVAESRLLEISTLQTELVAHLTRQTELTDQLYEDAIASTGMVEKGNEQLREARRRAKDSRIFILVFLLGASFSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.43
4 0.48
5 0.49
6 0.46
7 0.52
8 0.54
9 0.56
10 0.64
11 0.71
12 0.73
13 0.79
14 0.84
15 0.86
16 0.87
17 0.86
18 0.86
19 0.83
20 0.79
21 0.79
22 0.75
23 0.69
24 0.62
25 0.54
26 0.45
27 0.4
28 0.39
29 0.36
30 0.36
31 0.37
32 0.38
33 0.38
34 0.37
35 0.39
36 0.37
37 0.35
38 0.3
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.22
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.18
55 0.19
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.22
60 0.26
61 0.3
62 0.29
63 0.29
64 0.31
65 0.37
66 0.37
67 0.38
68 0.35
69 0.29
70 0.26
71 0.25
72 0.23
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.17
79 0.17
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.18
95 0.24
96 0.25
97 0.23
98 0.26
99 0.3
100 0.36
101 0.39
102 0.39
103 0.34
104 0.34
105 0.32
106 0.3
107 0.28
108 0.21
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.19
123 0.22
124 0.21
125 0.26
126 0.3
127 0.34
128 0.37
129 0.38
130 0.37
131 0.33
132 0.34
133 0.28
134 0.27
135 0.32
136 0.37
137 0.36
138 0.37
139 0.37
140 0.36
141 0.36
142 0.32
143 0.24
144 0.16
145 0.17
146 0.15
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.18
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.25
192 0.26
193 0.29
194 0.36
195 0.36
196 0.35
197 0.42
198 0.45
199 0.42
200 0.44
201 0.44
202 0.39
203 0.38
204 0.39
205 0.33
206 0.26
207 0.22
208 0.18
209 0.16
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.08
251 0.1
252 0.09
253 0.11
254 0.16
255 0.19
256 0.23
257 0.25
258 0.25
259 0.25
260 0.26
261 0.29
262 0.27
263 0.25
264 0.24
265 0.29
266 0.29
267 0.27
268 0.29
269 0.25
270 0.23
271 0.24
272 0.22
273 0.16
274 0.14
275 0.14
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.12
305 0.11
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.13
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.15
332 0.18
333 0.2
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.15
339 0.14
340 0.11
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.16
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.3
355 0.38
356 0.47
357 0.52
358 0.54
359 0.57
360 0.64
361 0.68
362 0.71
363 0.71
364 0.69
365 0.7
366 0.67
367 0.6
368 0.52
369 0.49
370 0.38
371 0.29
372 0.22
373 0.15
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.05
378 0.05
379 0.06