FuNGI

A0A5C3N042

Protein Details

Accession

A0A5C3N042

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
990-1009	VDRKGNKKATSRTKKEQMTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 4, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MPPRADDSQPGPFADMEGLMKQAPRYTILPTPLPEDARGSAANDFLYPDSPTQDQLAVIEVCLNELLDVPRAKRMFDDLRVKRAGDPLLEPRLYNAMMRGYFDMAEKDVENWEGWVQDAVDVFNTMQSAVEAIRPTAGSYAILFSAWTRFHERLSLRPVDAPRLHLPEPEKLVGLLDEQGISAVDIITDPSIQSPGEAARITDAILTPAVAQNRERLIAELREAQAIAKYSDPFADVPEAMPVLRRKEPQVAVGEVSPTTDDAMEVPFSLDLLRRHLARVKMARQVLPDDVAVRQKVLEDSAIDVARERMVQQVKMLEELGIKDPALRRHGLQLWMWEWHTKLQERLEAEVNALLIEEQAIKEKRGPSTREQQFLGPFLQLLEPETMSLITILELMRLSGSGGVSDGMKMARALLSVGTAIEMEYHARMRKKNNISVPMHPLQPGQLAHYSGQGYEDLYARRIAARKYMEDNEAWSADWSQTLKVRIASFIVDSLIDVATVTRSGIDKETKQLVEEVQPAFFHTYEYVHGHKLGVIKLNSAVAERLATDDVRDTVTPRSLPMLVRPKPWLDYDNGAYLNIKSEWSVMRFKESQEQEVHIREAARQGKIELVFAALDVLGSTPWVVNRAVFDVVLKVWNSGKRFAKIPPAVFEMPEPEKPLDWASNPKSRNVHMIRVKAYHHARGNNHSDRCSVNYKMEIARTFISDVFYLPHNIDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLMKFADAKPLGARGLRWLKIHLANLYGYDKADFDGRVVWTEENLANIVDSAEKPLEGEGWWTKADDPWQCLATCMELNNALKSPDPLTYECSLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDEKGARQVNLDVTDRPSDVYTYVANMVEELLEKEKDTDKYAAMLVGKIARKIVKQTVMTTVYGVTFIGAREQIEKQLRDRSVVPEEEAWGASAYLAKKVLAAIGDLFSGATDIQTWLNMCARLVTRSIPPARVEEASKEYVDRKGNKKATSRTKKEQMTSMIWTSPMNLPIVQPYRKVKRKQIMTAIQSVFISDPNSPAEVNSMKQASAFPPNFIHSLDASHMMKTALRCRDEDITFASVHDSYWTHACDIDRMSAIIRDTFVELHNGEILQRLHDEFMYRYKDYKVPLSTVRSSNIIEKLKAMGVKPPAIVGLLEQIEGTAAKEESEDEAIEAAEPNVDALDDEFSERMNEADDLDAYLQSEEGAQALEDAFELSGETKQKRSRYGGVSPHKIHINVTDLIPPVPKKGDFDVNTTKQSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.22
3	0.15
4	0.14
5	0.15
6	0.14
7	0.15
8	0.16
9	0.18
10	0.18
11	0.2
12	0.2
13	0.24
14	0.29
15	0.32
16	0.36
17	0.34
18	0.37
19	0.38
20	0.38
21	0.35
22	0.32
23	0.29
24	0.28
25	0.27
26	0.24
27	0.21
28	0.21
29	0.2
30	0.16
31	0.17
32	0.14
33	0.15
34	0.15
35	0.15
36	0.17
37	0.18
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.18
42	0.16
43	0.2
44	0.16
45	0.15
46	0.16
47	0.14
48	0.13
49	0.13
50	0.13
51	0.08
52	0.1
53	0.12
54	0.14
55	0.18
56	0.18
57	0.26
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.33
62	0.35
63	0.41
64	0.51
65	0.49
66	0.56
67	0.59
68	0.58
69	0.53
70	0.52
71	0.46
72	0.38
73	0.37
74	0.37
75	0.42
76	0.41
77	0.38
78	0.35
79	0.36
80	0.33
81	0.29
82	0.24
83	0.22
84	0.22
85	0.24
86	0.24
87	0.21
88	0.21
89	0.22
90	0.21
91	0.16
92	0.17
93	0.16
94	0.15
95	0.15
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.14
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.1
107	0.1
108	0.11
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.08
116	0.07
117	0.11
118	0.1
119	0.11
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.1
126	0.1
127	0.12
128	0.1
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.13
133	0.14
134	0.16
135	0.2
136	0.21
137	0.22
138	0.3
139	0.31
140	0.34
141	0.41
142	0.43
143	0.38
144	0.44
145	0.45
146	0.46
147	0.46
148	0.44
149	0.43
150	0.44
151	0.43
152	0.42
153	0.43
154	0.41
155	0.44
156	0.39
157	0.34
158	0.27
159	0.27
160	0.23
161	0.21
162	0.16
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.08
179	0.07
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.12
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.12
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.18
200	0.2
201	0.22
202	0.21
203	0.2
204	0.22
205	0.23
206	0.25
207	0.26
208	0.25
209	0.24
210	0.24
211	0.22
212	0.2
213	0.2
214	0.18
215	0.15
216	0.15
217	0.14
218	0.15
219	0.16
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.14
224	0.13
225	0.14
226	0.14
227	0.12
228	0.16
229	0.18
230	0.2
231	0.25
232	0.27
233	0.29
234	0.38
235	0.4
236	0.41
237	0.42
238	0.39
239	0.35
240	0.34
241	0.31
242	0.23
243	0.21
244	0.16
245	0.11
246	0.09
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.11
258	0.11
259	0.15
260	0.18
261	0.18
262	0.21
263	0.27
264	0.29
265	0.34
266	0.41
267	0.41
268	0.46
269	0.49
270	0.49
271	0.46
272	0.46
273	0.39
274	0.32
275	0.28
276	0.21
277	0.2
278	0.22
279	0.2
280	0.17
281	0.15
282	0.15
283	0.15
284	0.15
285	0.13
286	0.1
287	0.12
288	0.15
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.13
293	0.13
294	0.13
295	0.11
296	0.14
297	0.17
298	0.18
299	0.19
300	0.23
301	0.22
302	0.23
303	0.23
304	0.17
305	0.15
306	0.16
307	0.17
308	0.14
309	0.13
310	0.14
311	0.18
312	0.22
313	0.24
314	0.23
315	0.22
316	0.28
317	0.33
318	0.33
319	0.31
320	0.31
321	0.29
322	0.31
323	0.31
324	0.25
325	0.22
326	0.23
327	0.26
328	0.24
329	0.27
330	0.27
331	0.3
332	0.3
333	0.32
334	0.32
335	0.27
336	0.25
337	0.22
338	0.18
339	0.14
340	0.12
341	0.09
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.17
350	0.21
351	0.27
352	0.33
353	0.38
354	0.38
355	0.48
356	0.53
357	0.53
358	0.51
359	0.48
360	0.43
361	0.41
362	0.36
363	0.25
364	0.19
365	0.15
366	0.15
367	0.11
368	0.11
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.12
414	0.16
415	0.2
416	0.25
417	0.35
418	0.42
419	0.48
420	0.53
421	0.59
422	0.59
423	0.6
424	0.62
425	0.54
426	0.48
427	0.41
428	0.34
429	0.26
430	0.26
431	0.22
432	0.17
433	0.16
434	0.16
435	0.16
436	0.19
437	0.18
438	0.14
439	0.14
440	0.12
441	0.1
442	0.1
443	0.12
444	0.09
445	0.1
446	0.11
447	0.1
448	0.13
449	0.16
450	0.15
451	0.2
452	0.22
453	0.24
454	0.29
455	0.31
456	0.31
457	0.28
458	0.29
459	0.24
460	0.22
461	0.19
462	0.15
463	0.12
464	0.1
465	0.12
466	0.1
467	0.1
468	0.12
469	0.14
470	0.15
471	0.17
472	0.17
473	0.16
474	0.16
475	0.15
476	0.13
477	0.11
478	0.1
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.06
483	0.05
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.06
492	0.09
493	0.12
494	0.13
495	0.17
496	0.22
497	0.21
498	0.21
499	0.21
500	0.19
501	0.19
502	0.22
503	0.19
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.16
508	0.15
509	0.12
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.13
514	0.14
515	0.13
516	0.14
517	0.13
518	0.15
519	0.16
520	0.15
521	0.18
522	0.17
523	0.16
524	0.17
525	0.17
526	0.15
527	0.13
528	0.12
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.09
541	0.1
542	0.12
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.13
547	0.13
548	0.19
549	0.27
550	0.28
551	0.3
552	0.32
553	0.31
554	0.32
555	0.33
556	0.27
557	0.2
558	0.21
559	0.2
560	0.21
561	0.2
562	0.18
563	0.17
564	0.15
565	0.15
566	0.11
567	0.1
568	0.07
569	0.08
570	0.09
571	0.12
572	0.16
573	0.14
574	0.18
575	0.19
576	0.2
577	0.27
578	0.27
579	0.28
580	0.25
581	0.28
582	0.26
583	0.26
584	0.26
585	0.19
586	0.18
587	0.15
588	0.2
589	0.21
590	0.19
591	0.18
592	0.17
593	0.19
594	0.19
595	0.19
596	0.12
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.04
602	0.04
603	0.03
604	0.03
605	0.02
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.07
619	0.07
620	0.09
621	0.08
622	0.07
623	0.09
624	0.13
625	0.14
626	0.19
627	0.22
628	0.22
629	0.24
630	0.25
631	0.32
632	0.33
633	0.33
634	0.29
635	0.32
636	0.3
637	0.29
638	0.27
639	0.22
640	0.2
641	0.2
642	0.19
643	0.14
644	0.14
645	0.15
646	0.16
647	0.13
648	0.12
649	0.19
650	0.21
651	0.28
652	0.28
653	0.31
654	0.32
655	0.31
656	0.4
657	0.35
658	0.39
659	0.38
660	0.42
661	0.4
662	0.41
663	0.41
664	0.39
665	0.38
666	0.36
667	0.34
668	0.36
669	0.35
670	0.39
671	0.47
672	0.47
673	0.46
674	0.4
675	0.38
676	0.34
677	0.35
678	0.33
679	0.27
680	0.21
681	0.21
682	0.22
683	0.22
684	0.24
685	0.2
686	0.18
687	0.17
688	0.16
689	0.16
690	0.14
691	0.14
692	0.11
693	0.11
694	0.09
695	0.1
696	0.1
697	0.09
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.15
705	0.15
706	0.13
707	0.14
708	0.18
709	0.21
710	0.25
711	0.23
712	0.24
713	0.25
714	0.25
715	0.24
716	0.21
717	0.18
718	0.13
719	0.13
720	0.1
721	0.09
722	0.08
723	0.08
724	0.07
725	0.05
726	0.06
727	0.11
728	0.11
729	0.18
730	0.18
731	0.18
732	0.19
733	0.2
734	0.21
735	0.16
736	0.16
737	0.15
738	0.22
739	0.24
740	0.24
741	0.24
742	0.27
743	0.3
744	0.32
745	0.25
746	0.21
747	0.18
748	0.2
749	0.19
750	0.16
751	0.12
752	0.11
753	0.1
754	0.09
755	0.1
756	0.08
757	0.07
758	0.1
759	0.1
760	0.11
761	0.12
762	0.12
763	0.1
764	0.13
765	0.13
766	0.1
767	0.1
768	0.08
769	0.07
770	0.07
771	0.07
772	0.06
773	0.05
774	0.07
775	0.06
776	0.06
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.06
781	0.1
782	0.09
783	0.11
784	0.11
785	0.12
786	0.12
787	0.13
788	0.18
789	0.17
790	0.19
791	0.2
792	0.21
793	0.21
794	0.21
795	0.2
796	0.17
797	0.15
798	0.12
799	0.11
800	0.13
801	0.14
802	0.14
803	0.14
804	0.13
805	0.12
806	0.13
807	0.14
808	0.13
809	0.15
810	0.15
811	0.19
812	0.2
813	0.2
814	0.2
815	0.2
816	0.18
817	0.16
818	0.16
819	0.13
820	0.12
821	0.13
822	0.13
823	0.16
824	0.17
825	0.16
826	0.15
827	0.14
828	0.14
829	0.12
830	0.12
831	0.08
832	0.07
833	0.06
834	0.07
835	0.06
836	0.08
837	0.07
838	0.07
839	0.1
840	0.11
841	0.1
842	0.11
843	0.12
844	0.14
845	0.17
846	0.19
847	0.17
848	0.19
849	0.2
850	0.2
851	0.19
852	0.16
853	0.13
854	0.12
855	0.12
856	0.1
857	0.09
858	0.11
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.09
863	0.07
864	0.08
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.08
869	0.1
870	0.15
871	0.16
872	0.19
873	0.19
874	0.18
875	0.19
876	0.19
877	0.19
878	0.16
879	0.14
880	0.12
881	0.16
882	0.16
883	0.15
884	0.17
885	0.17
886	0.18
887	0.23
888	0.27
889	0.29
890	0.3
891	0.31
892	0.36
893	0.36
894	0.35
895	0.31
896	0.26
897	0.19
898	0.17
899	0.15
900	0.08
901	0.06
902	0.06
903	0.07
904	0.07
905	0.08
906	0.1
907	0.11
908	0.18
909	0.24
910	0.26
911	0.27
912	0.35
913	0.35
914	0.35
915	0.36
916	0.35
917	0.34
918	0.34
919	0.32
920	0.25
921	0.26
922	0.24
923	0.22
924	0.17
925	0.12
926	0.1
927	0.09
928	0.11
929	0.1
930	0.1
931	0.11
932	0.1
933	0.1
934	0.1
935	0.12
936	0.09
937	0.09
938	0.08
939	0.08
940	0.08
941	0.08
942	0.07
943	0.06
944	0.06
945	0.05
946	0.04
947	0.04
948	0.05
949	0.06
950	0.07
951	0.08
952	0.09
953	0.12
954	0.12
955	0.11
956	0.14
957	0.15
958	0.16
959	0.17
960	0.17
961	0.18
962	0.25
963	0.28
964	0.28
965	0.29
966	0.3
967	0.32
968	0.31
969	0.3
970	0.27
971	0.29
972	0.28
973	0.27
974	0.25
975	0.24
976	0.28
977	0.34
978	0.37
979	0.38
980	0.46
981	0.52
982	0.57
983	0.63
984	0.67
985	0.72
986	0.75
987	0.78
988	0.77
989	0.8
990	0.8
991	0.75
992	0.72
993	0.67
994	0.61
995	0.57
996	0.5
997	0.41
998	0.35
999	0.32
1000	0.28
1001	0.24
1002	0.21
1003	0.18
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.22
1007	0.28
1008	0.27
1009	0.3
1010	0.37
1011	0.46
1012	0.55
1013	0.62
1014	0.64
1015	0.67
1016	0.75
1017	0.77
1018	0.79
1019	0.78
1020	0.74
1021	0.75
1022	0.66
1023	0.58
1024	0.49
1025	0.41
1026	0.31
1027	0.23
1028	0.2
1029	0.11
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.2
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.2
1043	0.18
1044	0.26
1045	0.26
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.28
1049	0.28
1050	0.27
1051	0.26
1052	0.17
1053	0.18
1054	0.18
1055	0.21
1056	0.19
1057	0.18
1058	0.19
1059	0.17
1060	0.19
1061	0.2
1062	0.27
1063	0.28
1064	0.3
1065	0.31
1066	0.34
1067	0.41
1068	0.39
1069	0.37
1070	0.33
1071	0.29
1072	0.26
1073	0.26
1074	0.24
1075	0.17
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.13
1079	0.12
1080	0.16
1081	0.17
1082	0.15
1083	0.18
1084	0.18
1085	0.19
1086	0.21
1087	0.22
1088	0.19
1089	0.18
1090	0.19
1091	0.19
1092	0.19
1093	0.17
1094	0.16
1095	0.14
1096	0.14
1097	0.15
1098	0.15
1099	0.16
1100	0.15
1101	0.15
1102	0.16
1103	0.14
1104	0.13
1105	0.17
1106	0.17
1107	0.14
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.16
1111	0.17
1112	0.19
1113	0.16
1114	0.23
1115	0.28
1116	0.27
1117	0.28
1118	0.31
1119	0.34
1120	0.35
1121	0.41
1122	0.38
1123	0.37
1124	0.42
1125	0.47
1126	0.49
1127	0.49
1128	0.47
1129	0.42
1130	0.4
1131	0.41
1132	0.43
1133	0.4
1134	0.34
1135	0.32
1136	0.32
1137	0.33
1138	0.34
1139	0.28
1140	0.27
1141	0.28
1142	0.31
1143	0.29
1144	0.27
1145	0.24
1146	0.22
1147	0.21
1148	0.16
1149	0.16
1150	0.14
1151	0.13
1152	0.13
1153	0.12
1154	0.12
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.08
1158	0.08
1159	0.08
1160	0.09
1161	0.1
1162	0.12
1163	0.13
1164	0.13
1165	0.11
1166	0.11
1167	0.11
1168	0.11
1169	0.11
1170	0.08
1171	0.07
1172	0.07
1173	0.06
1174	0.06
1175	0.06
1176	0.05
1177	0.06
1178	0.08
1179	0.08
1180	0.09
1181	0.09
1182	0.1
1183	0.11
1184	0.11
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.1
1188	0.1
1189	0.11
1190	0.11
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.13
1194	0.12
1195	0.11
1196	0.1
1197	0.08
1198	0.09
1199	0.07
1200	0.06
1201	0.06
1202	0.05
1203	0.06
1204	0.06
1205	0.06
1206	0.06
1207	0.06
1208	0.06
1209	0.05
1210	0.06
1211	0.07
1212	0.11
1213	0.17
1214	0.19
1215	0.26
1216	0.33
1217	0.38
1218	0.45
1219	0.51
1220	0.56
1221	0.57
1222	0.64
1223	0.68
1224	0.71
1225	0.76
1226	0.71
1227	0.7
1228	0.66
1229	0.59
1230	0.52
1231	0.46
1232	0.41
1233	0.33
1234	0.32
1235	0.31
1236	0.27
1237	0.28
1238	0.31
1239	0.27
1240	0.27
1241	0.29
1242	0.29
1243	0.29
1244	0.33
1245	0.42
1246	0.39
1247	0.46
1248	0.52
1249	0.53
1250	0.55
1251	0.53
1252	0.48
1253	0.39

A0A5C3N042

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer