Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NH12

Protein Details
Accession A0A5C3NH12    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-259NTHANVFQPEKKRRKRDGYEEGDYHydrophilic
373-392ETSARNKRAKRRANEVKQRAHydrophilic
492-516LKERDAKYKVKQERKKNKERDEEWGBasic
805-829IEKVMKKGMSTNKKKKELKVVVAKGHydrophilic
847-872MVDSRMKKEVRAHKRREKANKKRKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-250KRRK
378-384NKRAKRR
498-510KYKVKQERKKNKE
584-586QKR
755-782RALDARPIKKVAEAKARKKMKAAQQLAK
810-872KKGMSTNKKKKELKVVVAKGAHKGIKGRPKGVKGRYTMVDSRMKKEVRAHKRREKANKKRKRT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MGKAQKKTGKGRLDKYYKLAKEQGYRARSAFKLIQLNKKYSFLESARCTIDLCAAPGGWLQVASKYMPVNSVIVGVDLVPIKPIPRVTTFAADITTPQCRNLIRSEVKDWKADVVLHDGAPNVGTAWVQDAYSQSELVLMSLKLAVEFLAKGGTFVTKVFRSVDYNNLIWVFSQLFGKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCREFLAPKHIDPKFLDPKHVFKELSASASAVDKGTSANNTHANVFQPEKKRRKRDGYEEGDYTLFKKIGAEEFIRCADPVALLGSANKIAFETEEEKEWLKFESTTAEIRANCEDLKVLGKGDFKALMKWRTALREEIGLDVKTKETEELTEVVEVTEVVDEEEQIQQEFDRIQAETSARNKRAKRRANEVKQRAIQRMQLQMTAPMDIGLEQNDPTLSLGQEDMFDLADTEKRLRRQGGELIDLSSPEGSDDDGGNEEDENDVDILDEEEEQARKVSGLEAELDGLYDAYQERLKERDAKYKVKQERKKNKERDEEWGGIKAAKDSDEESESGSEGGWDKMEEAKAGMGSDSDEESESDEGDAPTASPARKRQRLERGTVAADKGQKRRKLVTDLEGPKTSRSAELWFSRDVFAGMDDLGDLEDDDEAESAQEDNDDAMEVDADAREDNAQSDDDFEVVPQEQDDVAWDVEDEDEDAPRQRMIQEQGLLTAEAMTLAQQLVNRQKTKTDLLNDGFNRYSLNAKDGLPSWFLDDEAQHYKANIPITKEAVDALRAKMRALDARPIKKVAEAKARKKMKAAQQLAKAMKKAEGVNQTVDMTEREKAQQIEKVMKKGMSTNKKKKELKVVVAKGAHKGIKGRPKGVKGRYTMVDSRMKKEVRAHKRREKANKKRKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.75
3 0.76
4 0.69
5 0.66
6 0.66
7 0.62
8 0.62
9 0.66
10 0.68
11 0.62
12 0.62
13 0.57
14 0.57
15 0.5
16 0.49
17 0.45
18 0.42
19 0.47
20 0.51
21 0.59
22 0.59
23 0.65
24 0.61
25 0.6
26 0.55
27 0.48
28 0.48
29 0.41
30 0.44
31 0.42
32 0.43
33 0.41
34 0.4
35 0.38
36 0.31
37 0.34
38 0.26
39 0.24
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.15
71 0.17
72 0.2
73 0.25
74 0.27
75 0.32
76 0.32
77 0.31
78 0.29
79 0.25
80 0.23
81 0.22
82 0.26
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.24
87 0.27
88 0.3
89 0.37
90 0.37
91 0.41
92 0.48
93 0.54
94 0.56
95 0.56
96 0.51
97 0.45
98 0.4
99 0.36
100 0.3
101 0.27
102 0.26
103 0.23
104 0.23
105 0.2
106 0.17
107 0.16
108 0.14
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.15
144 0.13
145 0.15
146 0.17
147 0.19
148 0.23
149 0.24
150 0.31
151 0.3
152 0.3
153 0.3
154 0.29
155 0.26
156 0.22
157 0.21
158 0.15
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.2
168 0.24
169 0.29
170 0.3
171 0.34
172 0.4
173 0.43
174 0.45
175 0.42
176 0.43
177 0.39
178 0.38
179 0.35
180 0.28
181 0.22
182 0.19
183 0.17
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.28
193 0.29
194 0.32
195 0.33
196 0.42
197 0.46
198 0.45
199 0.5
200 0.44
201 0.51
202 0.51
203 0.54
204 0.45
205 0.34
206 0.4
207 0.33
208 0.32
209 0.26
210 0.21
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.12
215 0.1
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.21
226 0.21
227 0.22
228 0.24
229 0.27
230 0.33
231 0.42
232 0.52
233 0.6
234 0.68
235 0.75
236 0.82
237 0.84
238 0.85
239 0.86
240 0.83
241 0.79
242 0.71
243 0.63
244 0.53
245 0.44
246 0.35
247 0.26
248 0.18
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.19
257 0.21
258 0.2
259 0.18
260 0.16
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.17
283 0.15
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.12
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.19
292 0.17
293 0.19
294 0.2
295 0.18
296 0.16
297 0.15
298 0.13
299 0.1
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.15
307 0.18
308 0.16
309 0.2
310 0.25
311 0.25
312 0.24
313 0.26
314 0.27
315 0.28
316 0.3
317 0.27
318 0.23
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.18
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.12
328 0.12
329 0.1
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.09
359 0.1
360 0.14
361 0.2
362 0.27
363 0.3
364 0.37
365 0.42
366 0.49
367 0.59
368 0.63
369 0.62
370 0.66
371 0.72
372 0.76
373 0.82
374 0.79
375 0.77
376 0.73
377 0.72
378 0.65
379 0.56
380 0.5
381 0.44
382 0.43
383 0.36
384 0.32
385 0.29
386 0.27
387 0.25
388 0.21
389 0.16
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.09
416 0.12
417 0.14
418 0.16
419 0.18
420 0.19
421 0.21
422 0.26
423 0.26
424 0.26
425 0.24
426 0.23
427 0.22
428 0.2
429 0.17
430 0.11
431 0.08
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.06
476 0.06
477 0.08
478 0.1
479 0.12
480 0.19
481 0.22
482 0.31
483 0.36
484 0.43
485 0.48
486 0.57
487 0.64
488 0.67
489 0.72
490 0.73
491 0.79
492 0.81
493 0.86
494 0.86
495 0.87
496 0.86
497 0.81
498 0.77
499 0.73
500 0.67
501 0.57
502 0.5
503 0.41
504 0.32
505 0.29
506 0.22
507 0.16
508 0.12
509 0.12
510 0.1
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.1
518 0.09
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.09
551 0.09
552 0.12
553 0.21
554 0.3
555 0.38
556 0.41
557 0.49
558 0.58
559 0.63
560 0.65
561 0.64
562 0.58
563 0.54
564 0.53
565 0.45
566 0.37
567 0.38
568 0.37
569 0.39
570 0.43
571 0.44
572 0.45
573 0.5
574 0.52
575 0.54
576 0.53
577 0.51
578 0.54
579 0.55
580 0.56
581 0.53
582 0.48
583 0.41
584 0.37
585 0.31
586 0.23
587 0.19
588 0.17
589 0.2
590 0.24
591 0.26
592 0.26
593 0.26
594 0.25
595 0.24
596 0.21
597 0.16
598 0.11
599 0.09
600 0.08
601 0.06
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.04
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.07
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.1
662 0.1
663 0.1
664 0.11
665 0.11
666 0.16
667 0.2
668 0.25
669 0.26
670 0.25
671 0.27
672 0.27
673 0.26
674 0.2
675 0.16
676 0.1
677 0.07
678 0.07
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.12
685 0.21
686 0.29
687 0.31
688 0.31
689 0.34
690 0.38
691 0.42
692 0.44
693 0.4
694 0.41
695 0.41
696 0.49
697 0.47
698 0.47
699 0.41
700 0.35
701 0.31
702 0.24
703 0.26
704 0.18
705 0.2
706 0.19
707 0.19
708 0.21
709 0.22
710 0.24
711 0.2
712 0.19
713 0.2
714 0.18
715 0.17
716 0.16
717 0.15
718 0.18
719 0.21
720 0.23
721 0.2
722 0.2
723 0.22
724 0.24
725 0.29
726 0.27
727 0.26
728 0.28
729 0.31
730 0.31
731 0.29
732 0.28
733 0.23
734 0.24
735 0.21
736 0.21
737 0.23
738 0.22
739 0.22
740 0.24
741 0.26
742 0.29
743 0.29
744 0.36
745 0.39
746 0.46
747 0.49
748 0.49
749 0.46
750 0.46
751 0.48
752 0.47
753 0.49
754 0.52
755 0.58
756 0.66
757 0.73
758 0.69
759 0.7
760 0.7
761 0.69
762 0.7
763 0.7
764 0.68
765 0.68
766 0.75
767 0.76
768 0.73
769 0.64
770 0.55
771 0.49
772 0.45
773 0.39
774 0.38
775 0.38
776 0.37
777 0.37
778 0.38
779 0.35
780 0.31
781 0.3
782 0.24
783 0.19
784 0.18
785 0.17
786 0.18
787 0.22
788 0.25
789 0.28
790 0.31
791 0.34
792 0.42
793 0.45
794 0.48
795 0.47
796 0.46
797 0.43
798 0.47
799 0.52
800 0.53
801 0.59
802 0.65
803 0.71
804 0.8
805 0.85
806 0.85
807 0.86
808 0.84
809 0.84
810 0.84
811 0.8
812 0.77
813 0.77
814 0.71
815 0.64
816 0.61
817 0.53
818 0.44
819 0.44
820 0.44
821 0.48
822 0.53
823 0.57
824 0.59
825 0.66
826 0.73
827 0.76
828 0.75
829 0.7
830 0.71
831 0.67
832 0.66
833 0.61
834 0.58
835 0.59
836 0.55
837 0.54
838 0.56
839 0.53
840 0.5
841 0.55
842 0.59
843 0.6
844 0.68
845 0.73
846 0.75
847 0.83
848 0.89
849 0.91
850 0.92
851 0.92
852 0.92