Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NIP1

Protein Details
Accession A0A5C3NIP1    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-190APQASTKRERPKRSSKHAPTEISHydrophilic
298-317ERVRHEEKEKQKQGKRAWYMBasic
339-374GSLAVKKAIEKKQRKISQKEKKSRPFPSRRAEGDNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-23RARPASRRAPAAGVSRAEPK
174-183KRERPKRSSK
344-397KKAIEKKQRKISQKEKKSRPFPSRRAEGDNPGNKRHQALGSREQQGGRPAKRQR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MPRRARPASRRAPAAGVSRAEPKRPNVSRASPEESDSDEQDSENENSESEDETGNVSDAFNEERQDQEDGDAFRVAQWVDEEDLDDLAEEDTSEEEEGEDAEEPPEDAHTMKSIRNDLSSLPFGTLRKAQQKLIEVQALSDTESDSDDDEGPETIAGPSRRETEERQAPQASTKRERPKRSSKHAPTEISSTRPVTRRRTVVEVKKLEARDPRFLPLAGEFDSLRFHQQYGFLSEMHETELKTLRADLKRARKLLVSSPRDIRTERAREVDRLERALKRAESSVNKDKREHVEQAALERVRHEEKEKQKQGKRAWYMKSSDKKDLLMKARYEALASSGGSLAVKKAIEKKQRKISQKEKKSRPFPSRRAEGDNPGNKRHQALGSREQQGGRPAKRQRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.54
3 0.46
4 0.41
5 0.45
6 0.45
7 0.46
8 0.46
9 0.45
10 0.51
11 0.53
12 0.57
13 0.56
14 0.61
15 0.64
16 0.66
17 0.67
18 0.58
19 0.55
20 0.51
21 0.48
22 0.42
23 0.36
24 0.32
25 0.25
26 0.23
27 0.23
28 0.24
29 0.2
30 0.21
31 0.19
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.15
37 0.14
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.15
51 0.17
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.19
56 0.19
57 0.2
58 0.19
59 0.16
60 0.15
61 0.17
62 0.15
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.04
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.21
105 0.24
106 0.24
107 0.21
108 0.18
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.23
113 0.24
114 0.3
115 0.31
116 0.33
117 0.35
118 0.39
119 0.4
120 0.4
121 0.37
122 0.29
123 0.27
124 0.26
125 0.21
126 0.18
127 0.14
128 0.1
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.15
147 0.17
148 0.19
149 0.23
150 0.28
151 0.36
152 0.37
153 0.4
154 0.38
155 0.37
156 0.41
157 0.43
158 0.4
159 0.36
160 0.42
161 0.49
162 0.56
163 0.63
164 0.65
165 0.71
166 0.74
167 0.78
168 0.81
169 0.79
170 0.81
171 0.8
172 0.74
173 0.65
174 0.62
175 0.54
176 0.45
177 0.39
178 0.3
179 0.27
180 0.3
181 0.34
182 0.34
183 0.38
184 0.39
185 0.39
186 0.45
187 0.49
188 0.51
189 0.55
190 0.51
191 0.47
192 0.48
193 0.46
194 0.43
195 0.41
196 0.37
197 0.34
198 0.33
199 0.34
200 0.3
201 0.3
202 0.27
203 0.21
204 0.2
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.09
226 0.11
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.21
232 0.22
233 0.27
234 0.32
235 0.38
236 0.45
237 0.46
238 0.46
239 0.42
240 0.42
241 0.47
242 0.5
243 0.44
244 0.42
245 0.46
246 0.48
247 0.47
248 0.45
249 0.41
250 0.4
251 0.41
252 0.4
253 0.4
254 0.4
255 0.4
256 0.44
257 0.46
258 0.39
259 0.37
260 0.38
261 0.34
262 0.34
263 0.37
264 0.33
265 0.28
266 0.28
267 0.31
268 0.33
269 0.38
270 0.46
271 0.48
272 0.51
273 0.51
274 0.54
275 0.55
276 0.55
277 0.51
278 0.44
279 0.43
280 0.41
281 0.42
282 0.44
283 0.38
284 0.31
285 0.28
286 0.29
287 0.25
288 0.27
289 0.28
290 0.3
291 0.39
292 0.5
293 0.59
294 0.65
295 0.68
296 0.74
297 0.79
298 0.8
299 0.8
300 0.77
301 0.74
302 0.71
303 0.7
304 0.71
305 0.72
306 0.68
307 0.66
308 0.6
309 0.57
310 0.56
311 0.59
312 0.57
313 0.54
314 0.49
315 0.44
316 0.45
317 0.42
318 0.37
319 0.28
320 0.23
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.13
332 0.22
333 0.31
334 0.41
335 0.5
336 0.59
337 0.67
338 0.76
339 0.82
340 0.84
341 0.86
342 0.87
343 0.89
344 0.9
345 0.9
346 0.92
347 0.92
348 0.92
349 0.92
350 0.91
351 0.9
352 0.89
353 0.88
354 0.83
355 0.82
356 0.77
357 0.75
358 0.75
359 0.74
360 0.69
361 0.65
362 0.65
363 0.58
364 0.55
365 0.51
366 0.48
367 0.47
368 0.49
369 0.53
370 0.57
371 0.6
372 0.61
373 0.56
374 0.53
375 0.54
376 0.56
377 0.51
378 0.52