Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3ND00

Protein Details
Accession A0A5C3ND00    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-273RIDLGKAKQNERDRRRRKKAKKKAGKHAAEHEEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-266KAKQNERDRRRRKKAKKKAGKH
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045298  Complex1_LYR_LYRM7  
IPR000352  Pep_chain_release_fac_I  
IPR045853  Pep_chain_release_fac_I_sf  
Gene Ontology GO:0005759  C:mitochondrial matrix  
GO:0003747  F:translation release factor activity  
GO:0034551  P:mitochondrial respiratory chain complex III assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00472  RF-1  
CDD cd20267  Complex1_LYR_LYRM7  
Amino Acid Sequences MSVPPPLQAAARSAYRSLWRASAVTFSGDAPVLQAFRVKMKTEYVQGRSQTDSKLYEEKVQLAKEVADMLRRNLVQARKVGHTEESDKEVWRVRLTEHSELGDNETMLGKPEPPDHVPSDRPSRKCCSETPSSPPPPPLSPSSSNGSIPPRLNYSQLKKAYKDRIIPELKESDLEESFVKGSGPGGQSINKTNNNVQLLHKPTGFRISCQETRSLEQNRKIARKRLLNKLDELYNPGLARIDLGKAKQNERDRRRRKKAKKKAGKHAAEHEEDDQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.31
4 0.31
5 0.29
6 0.28
7 0.26
8 0.26
9 0.27
10 0.23
11 0.22
12 0.2
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.11
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.12
22 0.11
23 0.17
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.27
28 0.3
29 0.35
30 0.43
31 0.42
32 0.45
33 0.45
34 0.46
35 0.45
36 0.44
37 0.38
38 0.34
39 0.31
40 0.29
41 0.32
42 0.31
43 0.33
44 0.33
45 0.36
46 0.36
47 0.34
48 0.32
49 0.27
50 0.25
51 0.19
52 0.21
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.18
57 0.22
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.28
62 0.26
63 0.29
64 0.32
65 0.3
66 0.31
67 0.32
68 0.29
69 0.28
70 0.29
71 0.26
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.25
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.21
80 0.18
81 0.25
82 0.3
83 0.31
84 0.28
85 0.27
86 0.27
87 0.27
88 0.28
89 0.21
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.11
99 0.13
100 0.15
101 0.18
102 0.2
103 0.23
104 0.24
105 0.27
106 0.36
107 0.39
108 0.41
109 0.41
110 0.44
111 0.46
112 0.46
113 0.45
114 0.4
115 0.41
116 0.42
117 0.45
118 0.47
119 0.47
120 0.45
121 0.44
122 0.4
123 0.34
124 0.34
125 0.29
126 0.26
127 0.25
128 0.27
129 0.29
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.26
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.24
140 0.27
141 0.3
142 0.35
143 0.41
144 0.43
145 0.42
146 0.49
147 0.53
148 0.53
149 0.53
150 0.48
151 0.5
152 0.51
153 0.49
154 0.45
155 0.39
156 0.34
157 0.29
158 0.26
159 0.2
160 0.15
161 0.16
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.15
174 0.17
175 0.21
176 0.27
177 0.26
178 0.28
179 0.29
180 0.34
181 0.34
182 0.34
183 0.33
184 0.34
185 0.37
186 0.37
187 0.36
188 0.3
189 0.29
190 0.37
191 0.34
192 0.28
193 0.29
194 0.34
195 0.37
196 0.38
197 0.42
198 0.35
199 0.38
200 0.45
201 0.46
202 0.46
203 0.47
204 0.53
205 0.55
206 0.62
207 0.65
208 0.66
209 0.67
210 0.7
211 0.71
212 0.75
213 0.76
214 0.7
215 0.69
216 0.64
217 0.6
218 0.51
219 0.49
220 0.4
221 0.34
222 0.3
223 0.26
224 0.22
225 0.18
226 0.18
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.17
231 0.25
232 0.28
233 0.33
234 0.41
235 0.49
236 0.57
237 0.64
238 0.73
239 0.77
240 0.84
241 0.91
242 0.93
243 0.95
244 0.95
245 0.96
246 0.97
247 0.97
248 0.96
249 0.96
250 0.96
251 0.93
252 0.89
253 0.88
254 0.85
255 0.78
256 0.71