Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N0F9

Protein Details
Accession A0A5C3N0F9    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132KEENPDQTKKAPKPRPEPRARPTSTSHydrophilic
321-344EGLVEDKQKRKKLRREEEKARTAGBasic
712-734RLGTTKRPFKMRNSKVRQAKIVRHydrophilic
789-809ELIKAEKKKGEKEREKGRLEIBasic
876-905DAGQEERPAKKPRKEKGPKSSDKDESPKKABasic
908-931APNPVGSLIGKKRKQRKLAKKGRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-126KKAPKPRPEPRA
227-232QKRGKA
327-341KQKRKKLRREEEKAR
792-816KAEKKKGEKEREKGRLEILEREREK
862-931KDRLPRRREVSRSEDAGQEERPAKKPRKEKGPKSSDKDESPKKASKAPNPVGSLIGKKRKQRKLAKKGRS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSALGKRKEREEESEKPQFHGSTLFISNLPYTATSTDLQTLFSDTAPVRSAFVVTEKGSGVSKGVGYVSFATKEDGKAAFEKLSQEGIALDGRSLRVSWADSKNKHKEENPDQTKKAPKPRPEPRARPTSTSNDPLAIRTIVISGLPSSIDSKSLWKKIRKFAGAEKVDWPLKKEDGSEDPTGAHAIFTSPSAAQDAVAKLHAHVFKGSLLSVTLKKRLEGLAKATQKRGKAKPEATSAMPSRSSRLIVRNLPFNVTEQDLRAVFLPYGPIYSINLPTTRAEEGEQPRPKGFAFVWMLSKKDAERAMEGANGMKVRAGMAEGLVEDKQKRKKLRREEEKARTAGKVDDGENGEDQEEEQKEKARERVIAVDWALSKDRWEEEKAKIDEDKEGESGGEESASGSEEDEESGSDDEDGGHLGIHEHDGDASDSDEDSSDGDSDMDVDDQKPAKPTLPPPETGTTLFIRNVPYEATEDELRTLFRAFGPLRYARITMDPATGRTRGTGFACFWNKEDADKAIAQSEILRAEAGGDEAVEKPKKNPFKFSSVLTPDPSSALAQNLVIHGRTLDVIRAVTRDEAGKLREAGEKARQKADKRNMYLLREGIILPNSPAAEHLTTVEVEKRTMSYNARKKLLQSNPLLFISKTRLSIRQIPLFVTERMLRRLAAHAIRAFNIEYLHGSRPGLTEDELNDPAGREPAHEQGEDQPEAESRLGTTKRPFKMRNSKVRQAKIVRQAERVDPATGKGRSRGYGFLELDSHANALRMLRWANNNPEVIKLFQEWWKAEIEELIKAEKKKGEKEREKGRLEILEREREKEVKAKGTLIVEFSIENVQVVHRRAARERDTKQGAVSVPVGLLREGKDRLPRRREVSRSEDAGQEERPAKKPRKEKGPKSSDKDESPKKASKAPNPVGSLIGKKRKQRKLAKKGRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.65
3 0.59
4 0.58
5 0.5
6 0.43
7 0.38
8 0.31
9 0.26
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.23
14 0.22
15 0.19
16 0.18
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.21
24 0.2
25 0.21
26 0.19
27 0.21
28 0.19
29 0.18
30 0.2
31 0.16
32 0.18
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.18
38 0.15
39 0.17
40 0.19
41 0.17
42 0.19
43 0.18
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.17
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.22
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.22
67 0.22
68 0.24
69 0.22
70 0.23
71 0.2
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.14
85 0.22
86 0.3
87 0.39
88 0.44
89 0.54
90 0.64
91 0.67
92 0.71
93 0.68
94 0.69
95 0.7
96 0.75
97 0.76
98 0.74
99 0.71
100 0.72
101 0.77
102 0.75
103 0.75
104 0.73
105 0.72
106 0.74
107 0.82
108 0.86
109 0.87
110 0.89
111 0.86
112 0.88
113 0.82
114 0.77
115 0.73
116 0.7
117 0.66
118 0.61
119 0.54
120 0.47
121 0.44
122 0.4
123 0.36
124 0.28
125 0.21
126 0.16
127 0.15
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.19
140 0.26
141 0.35
142 0.42
143 0.48
144 0.56
145 0.64
146 0.73
147 0.7
148 0.67
149 0.68
150 0.71
151 0.66
152 0.6
153 0.54
154 0.51
155 0.5
156 0.45
157 0.39
158 0.33
159 0.32
160 0.31
161 0.3
162 0.28
163 0.3
164 0.35
165 0.33
166 0.29
167 0.27
168 0.26
169 0.25
170 0.2
171 0.14
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.19
189 0.2
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.18
200 0.21
201 0.26
202 0.25
203 0.25
204 0.27
205 0.3
206 0.32
207 0.3
208 0.33
209 0.36
210 0.44
211 0.47
212 0.51
213 0.51
214 0.52
215 0.57
216 0.58
217 0.57
218 0.59
219 0.61
220 0.61
221 0.64
222 0.62
223 0.55
224 0.55
225 0.48
226 0.42
227 0.4
228 0.33
229 0.29
230 0.28
231 0.28
232 0.25
233 0.29
234 0.32
235 0.36
236 0.38
237 0.43
238 0.42
239 0.41
240 0.38
241 0.34
242 0.29
243 0.25
244 0.23
245 0.16
246 0.18
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.14
269 0.2
270 0.25
271 0.33
272 0.37
273 0.37
274 0.36
275 0.37
276 0.36
277 0.31
278 0.26
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.3
283 0.3
284 0.31
285 0.28
286 0.3
287 0.22
288 0.23
289 0.23
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.19
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.16
314 0.23
315 0.29
316 0.39
317 0.47
318 0.57
319 0.66
320 0.76
321 0.81
322 0.84
323 0.88
324 0.89
325 0.86
326 0.8
327 0.7
328 0.6
329 0.5
330 0.41
331 0.33
332 0.26
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.18
339 0.15
340 0.12
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.17
347 0.18
348 0.21
349 0.25
350 0.23
351 0.25
352 0.25
353 0.29
354 0.25
355 0.26
356 0.24
357 0.22
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.13
365 0.14
366 0.17
367 0.2
368 0.23
369 0.33
370 0.33
371 0.33
372 0.32
373 0.31
374 0.3
375 0.27
376 0.24
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.11
381 0.11
382 0.08
383 0.06
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.12
438 0.14
439 0.19
440 0.26
441 0.28
442 0.29
443 0.3
444 0.32
445 0.33
446 0.31
447 0.29
448 0.2
449 0.19
450 0.18
451 0.16
452 0.15
453 0.13
454 0.13
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.07
468 0.06
469 0.11
470 0.11
471 0.12
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.19
476 0.2
477 0.16
478 0.17
479 0.17
480 0.14
481 0.17
482 0.15
483 0.16
484 0.18
485 0.18
486 0.16
487 0.15
488 0.15
489 0.13
490 0.14
491 0.14
492 0.13
493 0.19
494 0.22
495 0.22
496 0.22
497 0.24
498 0.22
499 0.21
500 0.21
501 0.15
502 0.15
503 0.15
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.1
509 0.1
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.05
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.09
522 0.1
523 0.11
524 0.13
525 0.2
526 0.29
527 0.3
528 0.38
529 0.39
530 0.44
531 0.46
532 0.46
533 0.48
534 0.44
535 0.45
536 0.38
537 0.35
538 0.28
539 0.26
540 0.25
541 0.16
542 0.12
543 0.1
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.12
566 0.13
567 0.14
568 0.14
569 0.16
570 0.19
571 0.19
572 0.2
573 0.27
574 0.32
575 0.33
576 0.39
577 0.42
578 0.42
579 0.52
580 0.58
581 0.58
582 0.56
583 0.63
584 0.6
585 0.59
586 0.58
587 0.49
588 0.4
589 0.32
590 0.28
591 0.2
592 0.16
593 0.13
594 0.1
595 0.11
596 0.1
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.14
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.17
613 0.22
614 0.28
615 0.36
616 0.42
617 0.45
618 0.45
619 0.46
620 0.53
621 0.55
622 0.52
623 0.49
624 0.47
625 0.48
626 0.48
627 0.46
628 0.36
629 0.3
630 0.28
631 0.25
632 0.25
633 0.23
634 0.26
635 0.29
636 0.38
637 0.42
638 0.42
639 0.41
640 0.38
641 0.4
642 0.39
643 0.35
644 0.29
645 0.27
646 0.24
647 0.26
648 0.26
649 0.22
650 0.21
651 0.23
652 0.26
653 0.25
654 0.27
655 0.27
656 0.27
657 0.28
658 0.28
659 0.25
660 0.19
661 0.17
662 0.13
663 0.12
664 0.14
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.15
669 0.15
670 0.16
671 0.16
672 0.13
673 0.13
674 0.14
675 0.18
676 0.18
677 0.18
678 0.16
679 0.16
680 0.15
681 0.16
682 0.14
683 0.11
684 0.13
685 0.18
686 0.21
687 0.2
688 0.21
689 0.25
690 0.31
691 0.29
692 0.27
693 0.22
694 0.19
695 0.22
696 0.21
697 0.14
698 0.09
699 0.16
700 0.17
701 0.2
702 0.28
703 0.34
704 0.4
705 0.49
706 0.53
707 0.56
708 0.66
709 0.72
710 0.76
711 0.77
712 0.8
713 0.81
714 0.82
715 0.81
716 0.77
717 0.76
718 0.75
719 0.75
720 0.69
721 0.65
722 0.62
723 0.57
724 0.55
725 0.48
726 0.4
727 0.31
728 0.3
729 0.33
730 0.33
731 0.31
732 0.3
733 0.31
734 0.31
735 0.33
736 0.34
737 0.32
738 0.37
739 0.36
740 0.33
741 0.31
742 0.29
743 0.28
744 0.24
745 0.19
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.13
753 0.17
754 0.23
755 0.28
756 0.35
757 0.39
758 0.4
759 0.38
760 0.4
761 0.38
762 0.33
763 0.3
764 0.24
765 0.23
766 0.24
767 0.29
768 0.26
769 0.26
770 0.27
771 0.25
772 0.23
773 0.24
774 0.22
775 0.19
776 0.19
777 0.22
778 0.24
779 0.25
780 0.29
781 0.3
782 0.34
783 0.41
784 0.5
785 0.57
786 0.63
787 0.71
788 0.77
789 0.82
790 0.81
791 0.74
792 0.68
793 0.65
794 0.57
795 0.58
796 0.53
797 0.53
798 0.51
799 0.52
800 0.5
801 0.45
802 0.45
803 0.42
804 0.41
805 0.39
806 0.4
807 0.39
808 0.38
809 0.4
810 0.39
811 0.33
812 0.28
813 0.21
814 0.19
815 0.18
816 0.16
817 0.13
818 0.11
819 0.09
820 0.11
821 0.16
822 0.18
823 0.23
824 0.25
825 0.29
826 0.35
827 0.44
828 0.5
829 0.55
830 0.56
831 0.61
832 0.63
833 0.61
834 0.56
835 0.52
836 0.44
837 0.37
838 0.35
839 0.25
840 0.19
841 0.19
842 0.19
843 0.14
844 0.15
845 0.14
846 0.18
847 0.2
848 0.24
849 0.32
850 0.41
851 0.51
852 0.57
853 0.63
854 0.65
855 0.73
856 0.76
857 0.74
858 0.74
859 0.72
860 0.69
861 0.63
862 0.6
863 0.54
864 0.5
865 0.42
866 0.4
867 0.38
868 0.38
869 0.43
870 0.48
871 0.54
872 0.6
873 0.69
874 0.72
875 0.77
876 0.83
877 0.87
878 0.88
879 0.9
880 0.91
881 0.9
882 0.9
883 0.86
884 0.83
885 0.83
886 0.82
887 0.79
888 0.77
889 0.76
890 0.7
891 0.71
892 0.72
893 0.71
894 0.72
895 0.72
896 0.72
897 0.68
898 0.66
899 0.61
900 0.56
901 0.55
902 0.53
903 0.55
904 0.53
905 0.58
906 0.68
907 0.74
908 0.81
909 0.83
910 0.85
911 0.86