Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MQ25

Protein Details
Accession A0A5C3MQ25    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-135SGQSHPRKRRNLAKGPKEKPPKVBasic
263-289FQETGEVSKRKRKKKEPKEKEDFYAFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-134PRKRRNLAKGPKEKPPK
270-299SKRKRKKKEPKEKEDFYAFQRREKKRSALL
302-305QKKW
309-311KAK
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_mito 11, nucl 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
Amino Acid Sequences AASSTSKMSDHRHLPPSVAGFTLIPVTYASSTIHILYARRHVGSKRHGAAAIPDGRTLFLVNVPPDATEREIVLFFKQCGTVEQVIFDWEASDLAQDPETSEDEAESAVEPESGQSHPRKRRNLAKGPKEKPPKVISLPEHPLRVLRRTGHSAHVVFLDESSLERALTATQKPRPWPNSPEEPCGLAHYTALYDSLRPPLDVVREHADTWMELFDYEQAKKKQKSEYRKGEAVVDEDGFTLVTRGGAYGQTLGGGVGVASKRFQETGEVSKRKRKKKEPKEKEDFYAFQRREKKRSALLELQKKWEADKAKVEELKASKRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.49
4 0.41
5 0.35
6 0.28
7 0.21
8 0.2
9 0.21
10 0.16
11 0.12
12 0.1
13 0.12
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.15
21 0.14
22 0.15
23 0.18
24 0.25
25 0.26
26 0.27
27 0.3
28 0.33
29 0.4
30 0.47
31 0.53
32 0.49
33 0.49
34 0.48
35 0.45
36 0.44
37 0.44
38 0.42
39 0.33
40 0.3
41 0.26
42 0.26
43 0.26
44 0.22
45 0.15
46 0.11
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.15
67 0.2
68 0.21
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.1
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.07
100 0.07
101 0.11
102 0.17
103 0.26
104 0.35
105 0.43
106 0.5
107 0.56
108 0.66
109 0.72
110 0.77
111 0.78
112 0.79
113 0.82
114 0.78
115 0.8
116 0.8
117 0.72
118 0.68
119 0.62
120 0.57
121 0.5
122 0.53
123 0.47
124 0.45
125 0.49
126 0.44
127 0.41
128 0.35
129 0.35
130 0.3
131 0.3
132 0.26
133 0.23
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.31
139 0.28
140 0.25
141 0.23
142 0.2
143 0.16
144 0.14
145 0.1
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.09
155 0.11
156 0.15
157 0.2
158 0.23
159 0.26
160 0.33
161 0.37
162 0.4
163 0.42
164 0.43
165 0.5
166 0.5
167 0.51
168 0.45
169 0.41
170 0.36
171 0.33
172 0.28
173 0.17
174 0.14
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.18
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.19
205 0.24
206 0.33
207 0.37
208 0.42
209 0.48
210 0.54
211 0.63
212 0.67
213 0.72
214 0.72
215 0.71
216 0.68
217 0.62
218 0.55
219 0.46
220 0.37
221 0.27
222 0.19
223 0.16
224 0.15
225 0.11
226 0.09
227 0.07
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.17
253 0.27
254 0.37
255 0.44
256 0.46
257 0.56
258 0.65
259 0.69
260 0.76
261 0.78
262 0.79
263 0.83
264 0.9
265 0.92
266 0.94
267 0.95
268 0.9
269 0.86
270 0.82
271 0.74
272 0.69
273 0.69
274 0.58
275 0.56
276 0.61
277 0.61
278 0.6
279 0.65
280 0.65
281 0.63
282 0.7
283 0.7
284 0.7
285 0.74
286 0.77
287 0.74
288 0.73
289 0.69
290 0.61
291 0.54
292 0.51
293 0.46
294 0.41
295 0.46
296 0.45
297 0.5
298 0.53
299 0.52
300 0.53
301 0.54
302 0.58
303 0.57
304 0.57