Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MSD8

Protein Details
Accession A0A5C3MSD8    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-96TVYPKSKPTKSTKGKADKGKKRASDHydrophilic
264-289TSKGDMRRHLQCKKHKEPGWLCKRCGBasic
296-320DALKRHWKTRACRRGTRSVKERDGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-93KSKPTKSTKGKADKGKKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010725  DUF1299  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF06975  DUF1299  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MLASTQRSATPGPGSSTLVRRQEPPTVTQQMAMPGHGPSTLAAASHPSTLFGFIRPYTGGKVSRNLELHRQTVYPKSKPTKSTKGKADKGKKRASDDGDEDYAPKEKTSGKQKEKTTEVPQPILAFGFDIADYDLSENEPLVTRMTRSSGNHACTSAVQLEDLEPEADHTQLDEDEDSTDDYYPSGEEQDGSRSPSASGGGSHKRNVSKGKTTAATKEKKEETKKNQTKSAPNSSEPALEPLQVTRDGITEWICPHDGCDQRTTSKGDMRRHLQCKKHKEPGWLCKRCGWSFTRDDALKRHWKTRACRRGTRSVKERDGTPEHDDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.37
4 0.41
5 0.43
6 0.43
7 0.43
8 0.44
9 0.49
10 0.47
11 0.46
12 0.47
13 0.46
14 0.45
15 0.42
16 0.4
17 0.39
18 0.37
19 0.33
20 0.25
21 0.19
22 0.19
23 0.17
24 0.16
25 0.09
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.12
31 0.13
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.14
36 0.17
37 0.17
38 0.15
39 0.17
40 0.15
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.25
48 0.32
49 0.32
50 0.37
51 0.39
52 0.39
53 0.43
54 0.43
55 0.42
56 0.38
57 0.36
58 0.33
59 0.39
60 0.44
61 0.39
62 0.44
63 0.5
64 0.54
65 0.61
66 0.67
67 0.69
68 0.7
69 0.75
70 0.76
71 0.78
72 0.8
73 0.83
74 0.85
75 0.83
76 0.84
77 0.83
78 0.78
79 0.74
80 0.74
81 0.68
82 0.64
83 0.58
84 0.53
85 0.47
86 0.41
87 0.35
88 0.29
89 0.27
90 0.21
91 0.16
92 0.14
93 0.15
94 0.22
95 0.32
96 0.41
97 0.47
98 0.54
99 0.59
100 0.65
101 0.67
102 0.67
103 0.62
104 0.6
105 0.54
106 0.48
107 0.44
108 0.37
109 0.32
110 0.26
111 0.19
112 0.11
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.1
133 0.13
134 0.14
135 0.21
136 0.24
137 0.27
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.22
142 0.23
143 0.16
144 0.11
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.1
185 0.1
186 0.14
187 0.2
188 0.22
189 0.24
190 0.28
191 0.29
192 0.32
193 0.38
194 0.38
195 0.39
196 0.4
197 0.42
198 0.43
199 0.43
200 0.47
201 0.49
202 0.5
203 0.44
204 0.48
205 0.5
206 0.54
207 0.61
208 0.63
209 0.64
210 0.69
211 0.75
212 0.73
213 0.75
214 0.73
215 0.73
216 0.71
217 0.72
218 0.65
219 0.59
220 0.56
221 0.49
222 0.45
223 0.37
224 0.33
225 0.23
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.17
230 0.15
231 0.14
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.15
243 0.22
244 0.26
245 0.26
246 0.3
247 0.3
248 0.32
249 0.36
250 0.38
251 0.34
252 0.36
253 0.41
254 0.44
255 0.5
256 0.54
257 0.61
258 0.65
259 0.7
260 0.72
261 0.75
262 0.78
263 0.79
264 0.83
265 0.79
266 0.8
267 0.82
268 0.84
269 0.85
270 0.82
271 0.75
272 0.72
273 0.74
274 0.65
275 0.6
276 0.53
277 0.49
278 0.48
279 0.5
280 0.52
281 0.47
282 0.49
283 0.49
284 0.54
285 0.56
286 0.55
287 0.58
288 0.56
289 0.61
290 0.68
291 0.74
292 0.76
293 0.74
294 0.8
295 0.79
296 0.83
297 0.85
298 0.85
299 0.83
300 0.83
301 0.83
302 0.77
303 0.73
304 0.7
305 0.67
306 0.62
307 0.58