FuNGI

A0A5C3MSD1

Protein Details

Accession

A0A5C3MSD1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
835-884	PPQMVQQDPRDRRKRNTRDKDTDSNPSVDAPKEKRKRRTGARRATKDESQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
865-878	PKEKRKRRTGARRA
1053-1054	RR

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR001440 TPR_1 IPR013105 TPR_2 IPR019734 TPR_repeat
Pfam	View protein in Pfam PF00515 TPR_1 PF13432 TPR_16 PF07719 TPR_2 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR PS50293 TPR_REGION

Amino Acid Sequences

MSAPPQPHHVNGAIPSTPAPISNGSAHPHGQHQIVSPTHTSPSLPNRSAVPLSIQKLTQANEQTWLLIGAVAEQMGDLEHALSAYENALRHNPMSLTGLTQVAGIARIKENYPKAVEYFQRVLAIQQDSGEVWSALGHCYLMQDDLQKAYAAYQQALYLLPNPKEDPKLWYGIGILYDRYGSLDHAEDAFASVLRMDKNFDKSNEILFRLGIIYKQQGKYNDSLRCFEDILRNPPSPLAHADIWFQIGHVYEQQKDHLHAKDAYEHVVAENPGHAKVLQQLGWLYHQDGSSFQNQDLAIQYLTKSLEADPSDAQSWYLLGRAYMAGQKYNKAYEAYQQAVYRDGRNPTFWCSIGVLYFQINQFHDALDAYSRAIRINPYISEVWFDLGSLYESCNNQISDAIDAYARAAELDPTNPVITQRLQLLKQAQATGSALPAAPGPQDVHPTAYASAVVPPPGPPMSLHMTHHPRPLFRTESRGPPPADGSLSLPPPPQVPPPRTSSPGPFRGGPPPPVVVDESRQISTHTPLARMELDRPAMHGRHSSSMYPPAPETPSRGPAGHQSILLHHPVPQQQYPSEDMRGAGSQPHLHDPYAGRPLRVPSTSTSPPPPGAHGGRPRSPPVPQAYQGYGPSGRSRVGPGQAASQRSPRAYAYDGVPPVERDTAWDRRPAVPSEHRDWERERRVRHSADYSGNPSQQSPMYPPPRGVSPISHRSHTPRDRSPEPGPRPTLHSSNSRYWETKPSGPGSAPGSIHLRHSSPPPMEMSGRRYDPRFDARDAPIARDFEREPAMEYRHDARSYGGSPEGMRGSIRASLPPPPPPLMINPHRGSESPRLPPQMVQQDPRDRRKRNTRDKDTDSNPSVDAPKEKRKRRTGARRATKDESQSGTETPKPFQPGPSGERPTLGHQIPSFKVNTYGPSLGKPPAATPEPGSSNGSGSANRSVQPSPTSASAHPPNRVVDEDYDEGVADALMGLAGYRGGDARAPSANGSNHSPHVSALGRPGASPRVPLSHRGSISSQASPPMPSNGMKRPLSPGPDEMSEMKRSRMEVIKRRGSSPSAGRRTPGPSTRPSPIPFRQQPSSHSPESRQPLDGHAFPPSPTLPAVLPPHPRPIGAGLSSRPSQHMTLPPIATLSPTSTGSPPGDDRMRRDASRSRSRTPPAHLPSRSKISDVMNHPGGSPPGSRMTPLPVQHAPKAEPVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.26
3	0.24
4	0.23
5	0.2
6	0.19
7	0.16
8	0.19
9	0.23
10	0.25
11	0.26
12	0.29
13	0.3
14	0.3
15	0.32
16	0.32
17	0.29
18	0.28
19	0.28
20	0.32
21	0.32
22	0.34
23	0.32
24	0.3
25	0.31
26	0.29
27	0.27
28	0.27
29	0.36
30	0.41
31	0.4
32	0.4
33	0.4
34	0.45
35	0.45
36	0.39
37	0.36
38	0.34
39	0.36
40	0.37
41	0.34
42	0.33
43	0.36
44	0.37
45	0.37
46	0.34
47	0.32
48	0.33
49	0.34
50	0.3
51	0.26
52	0.24
53	0.17
54	0.13
55	0.12
56	0.09
57	0.09
58	0.08
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.05
63	0.06
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.07
72	0.1
73	0.1
74	0.12
75	0.16
76	0.18
77	0.18
78	0.21
79	0.2
80	0.19
81	0.22
82	0.2
83	0.19
84	0.19
85	0.19
86	0.16
87	0.16
88	0.14
89	0.11
90	0.13
91	0.11
92	0.12
93	0.14
94	0.15
95	0.17
96	0.25
97	0.28
98	0.31
99	0.34
100	0.33
101	0.34
102	0.39
103	0.41
104	0.41
105	0.41
106	0.37
107	0.36
108	0.34
109	0.32
110	0.31
111	0.29
112	0.23
113	0.2
114	0.19
115	0.17
116	0.17
117	0.17
118	0.11
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.07
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.13
131	0.14
132	0.15
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.18
138	0.16
139	0.16
140	0.15
141	0.14
142	0.15
143	0.15
144	0.14
145	0.16
146	0.21
147	0.22
148	0.24
149	0.27
150	0.3
151	0.34
152	0.35
153	0.35
154	0.33
155	0.36
156	0.33
157	0.31
158	0.27
159	0.25
160	0.26
161	0.21
162	0.17
163	0.13
164	0.13
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.12
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.09
181	0.1
182	0.11
183	0.13
184	0.18
185	0.25
186	0.3
187	0.31
188	0.34
189	0.35
190	0.42
191	0.43
192	0.4
193	0.34
194	0.28
195	0.28
196	0.24
197	0.23
198	0.16
199	0.14
200	0.19
201	0.25
202	0.28
203	0.32
204	0.34
205	0.38
206	0.42
207	0.47
208	0.47
209	0.43
210	0.44
211	0.41
212	0.4
213	0.37
214	0.34
215	0.36
216	0.35
217	0.38
218	0.4
219	0.39
220	0.37
221	0.38
222	0.36
223	0.29
224	0.27
225	0.25
226	0.22
227	0.22
228	0.23
229	0.21
230	0.22
231	0.19
232	0.16
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.15
237	0.16
238	0.18
239	0.19
240	0.23
241	0.24
242	0.27
243	0.31
244	0.29
245	0.31
246	0.31
247	0.31
248	0.34
249	0.33
250	0.32
251	0.27
252	0.24
253	0.2
254	0.21
255	0.19
256	0.13
257	0.14
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.1
263	0.15
264	0.19
265	0.16
266	0.17
267	0.18
268	0.18
269	0.21
270	0.21
271	0.18
272	0.16
273	0.16
274	0.15
275	0.15
276	0.17
277	0.2
278	0.21
279	0.19
280	0.21
281	0.2
282	0.21
283	0.21
284	0.2
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.15
294	0.15
295	0.17
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.17
300	0.17
301	0.12
302	0.11
303	0.09
304	0.1
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.11
311	0.12
312	0.16
313	0.17
314	0.2
315	0.21
316	0.23
317	0.23
318	0.21
319	0.21
320	0.23
321	0.28
322	0.27
323	0.29
324	0.28
325	0.27
326	0.3
327	0.31
328	0.27
329	0.26
330	0.28
331	0.26
332	0.28
333	0.29
334	0.31
335	0.32
336	0.29
337	0.26
338	0.23
339	0.22
340	0.19
341	0.18
342	0.13
343	0.11
344	0.13
345	0.13
346	0.14
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.13
352	0.11
353	0.11
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.12
363	0.14
364	0.14
365	0.17
366	0.17
367	0.17
368	0.18
369	0.17
370	0.16
371	0.13
372	0.12
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.07
377	0.08
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.14
382	0.14
383	0.12
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.11
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.08
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.11
406	0.12
407	0.15
408	0.18
409	0.18
410	0.22
411	0.25
412	0.26
413	0.27
414	0.26
415	0.22
416	0.19
417	0.2
418	0.16
419	0.13
420	0.1
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.07
428	0.08
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.14
434	0.14
435	0.12
436	0.12
437	0.09
438	0.11
439	0.09
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.09
447	0.12
448	0.16
449	0.18
450	0.19
451	0.24
452	0.31
453	0.33
454	0.38
455	0.36
456	0.33
457	0.34
458	0.38
459	0.36
460	0.31
461	0.36
462	0.34
463	0.41
464	0.44
465	0.47
466	0.43
467	0.37
468	0.38
469	0.31
470	0.28
471	0.21
472	0.19
473	0.16
474	0.16
475	0.16
476	0.15
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.2
481	0.24
482	0.26
483	0.28
484	0.35
485	0.38
486	0.4
487	0.41
488	0.41
489	0.42
490	0.44
491	0.43
492	0.38
493	0.37
494	0.4
495	0.41
496	0.36
497	0.3
498	0.25
499	0.24
500	0.24
501	0.23
502	0.17
503	0.16
504	0.17
505	0.17
506	0.16
507	0.16
508	0.15
509	0.15
510	0.16
511	0.19
512	0.17
513	0.16
514	0.16
515	0.18
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.16
520	0.17
521	0.16
522	0.18
523	0.19
524	0.17
525	0.17
526	0.18
527	0.17
528	0.18
529	0.2
530	0.19
531	0.18
532	0.24
533	0.24
534	0.22
535	0.21
536	0.19
537	0.2
538	0.2
539	0.23
540	0.19
541	0.21
542	0.22
543	0.22
544	0.2
545	0.23
546	0.28
547	0.24
548	0.22
549	0.19
550	0.19
551	0.21
552	0.21
553	0.16
554	0.13
555	0.15
556	0.17
557	0.2
558	0.19
559	0.19
560	0.19
561	0.21
562	0.22
563	0.21
564	0.19
565	0.16
566	0.15
567	0.15
568	0.14
569	0.12
570	0.1
571	0.09
572	0.1
573	0.11
574	0.14
575	0.14
576	0.14
577	0.16
578	0.15
579	0.18
580	0.25
581	0.24
582	0.21
583	0.21
584	0.23
585	0.24
586	0.24
587	0.21
588	0.14
589	0.21
590	0.22
591	0.23
592	0.24
593	0.22
594	0.24
595	0.23
596	0.23
597	0.21
598	0.21
599	0.25
600	0.29
601	0.32
602	0.34
603	0.36
604	0.38
605	0.35
606	0.34
607	0.33
608	0.31
609	0.3
610	0.28
611	0.28
612	0.27
613	0.27
614	0.26
615	0.24
616	0.2
617	0.16
618	0.16
619	0.14
620	0.13
621	0.11
622	0.13
623	0.14
624	0.15
625	0.16
626	0.16
627	0.21
628	0.23
629	0.25
630	0.24
631	0.25
632	0.25
633	0.23
634	0.24
635	0.19
636	0.18
637	0.17
638	0.17
639	0.16
640	0.19
641	0.19
642	0.18
643	0.18
644	0.16
645	0.16
646	0.15
647	0.12
648	0.11
649	0.16
650	0.22
651	0.23
652	0.26
653	0.27
654	0.3
655	0.33
656	0.32
657	0.33
658	0.34
659	0.38
660	0.39
661	0.44
662	0.42
663	0.42
664	0.44
665	0.48
666	0.5
667	0.5
668	0.49
669	0.47
670	0.53
671	0.53
672	0.52
673	0.47
674	0.41
675	0.4
676	0.4
677	0.39
678	0.35
679	0.34
680	0.31
681	0.27
682	0.23
683	0.2
684	0.18
685	0.17
686	0.23
687	0.26
688	0.27
689	0.28
690	0.27
691	0.28
692	0.3
693	0.27
694	0.23
695	0.25
696	0.35
697	0.35
698	0.35
699	0.35
700	0.38
701	0.46
702	0.48
703	0.48
704	0.45
705	0.5
706	0.52
707	0.56
708	0.58
709	0.58
710	0.57
711	0.57
712	0.54
713	0.48
714	0.51
715	0.49
716	0.45
717	0.38
718	0.4
719	0.39
720	0.41
721	0.45
722	0.42
723	0.4
724	0.38
725	0.43
726	0.4
727	0.39
728	0.36
729	0.34
730	0.33
731	0.31
732	0.32
733	0.26
734	0.25
735	0.21
736	0.19
737	0.2
738	0.19
739	0.21
740	0.19
741	0.18
742	0.16
743	0.19
744	0.23
745	0.21
746	0.22
747	0.22
748	0.22
749	0.24
750	0.25
751	0.27
752	0.26
753	0.29
754	0.29
755	0.29
756	0.29
757	0.32
758	0.36
759	0.35
760	0.33
761	0.36
762	0.36
763	0.42
764	0.4
765	0.39
766	0.35
767	0.33
768	0.3
769	0.28
770	0.26
771	0.21
772	0.22
773	0.19
774	0.19
775	0.2
776	0.22
777	0.2
778	0.22
779	0.23
780	0.25
781	0.25
782	0.22
783	0.2
784	0.21
785	0.22
786	0.21
787	0.18
788	0.15
789	0.15
790	0.17
791	0.16
792	0.13
793	0.11
794	0.1
795	0.1
796	0.13
797	0.13
798	0.13
799	0.14
800	0.2
801	0.23
802	0.28
803	0.3
804	0.28
805	0.28
806	0.28
807	0.3
808	0.32
809	0.34
810	0.38
811	0.36
812	0.36
813	0.36
814	0.35
815	0.37
816	0.37
817	0.38
818	0.36
819	0.39
820	0.41
821	0.4
822	0.41
823	0.44
824	0.45
825	0.42
826	0.4
827	0.43
828	0.5
829	0.57
830	0.66
831	0.68
832	0.64
833	0.7
834	0.77
835	0.8
836	0.81
837	0.85
838	0.85
839	0.85
840	0.88
841	0.87
842	0.81
843	0.78
844	0.7
845	0.6
846	0.5
847	0.42
848	0.36
849	0.29
850	0.31
851	0.29
852	0.37
853	0.45
854	0.53
855	0.61
856	0.68
857	0.76
858	0.8
859	0.85
860	0.86
861	0.87
862	0.9
863	0.88
864	0.87
865	0.83
866	0.77
867	0.7
868	0.65
869	0.56
870	0.48
871	0.42
872	0.35
873	0.33
874	0.33
875	0.3
876	0.27
877	0.27
878	0.29
879	0.29
880	0.3
881	0.32
882	0.33
883	0.37
884	0.45
885	0.45
886	0.4
887	0.42
888	0.41
889	0.4
890	0.41
891	0.35
892	0.29
893	0.26
894	0.32
895	0.31
896	0.32
897	0.28
898	0.21
899	0.24
900	0.22
901	0.23
902	0.22
903	0.25
904	0.22
905	0.23
906	0.26
907	0.24
908	0.25
909	0.22
910	0.19
911	0.21
912	0.23
913	0.22
914	0.22
915	0.25
916	0.26
917	0.28
918	0.29
919	0.24
920	0.22
921	0.23
922	0.22
923	0.17
924	0.17
925	0.2
926	0.19
927	0.2
928	0.22
929	0.21
930	0.22
931	0.23
932	0.23
933	0.2
934	0.21
935	0.24
936	0.21
937	0.28
938	0.35
939	0.37
940	0.38
941	0.39
942	0.38
943	0.37
944	0.38
945	0.33
946	0.27
947	0.28
948	0.26
949	0.24
950	0.22
951	0.19
952	0.17
953	0.15
954	0.12
955	0.06
956	0.04
957	0.03
958	0.03
959	0.02
960	0.02
961	0.02
962	0.03
963	0.03
964	0.03
965	0.04
966	0.04
967	0.06
968	0.07
969	0.1
970	0.12
971	0.13
972	0.14
973	0.19
974	0.2
975	0.21
976	0.25
977	0.26
978	0.26
979	0.28
980	0.27
981	0.22
982	0.25
983	0.23
984	0.2
985	0.21
986	0.23
987	0.21
988	0.21
989	0.24
990	0.24
991	0.23
992	0.25
993	0.23
994	0.26
995	0.27
996	0.34
997	0.38
998	0.41
999	0.41
1000	0.42
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.43
1004	0.4
1005	0.33
1006	0.29
1007	0.29
1008	0.28
1009	0.27
1010	0.24
1011	0.24
1012	0.23
1013	0.28
1014	0.33
1015	0.4
1016	0.39
1017	0.4
1018	0.42
1019	0.45
1020	0.47
1021	0.44
1022	0.4
1023	0.36
1024	0.36
1025	0.38
1026	0.35
1027	0.34
1028	0.36
1029	0.34
1030	0.33
1031	0.31
1032	0.31
1033	0.34
1034	0.39
1035	0.45
1036	0.47
1037	0.56
1038	0.63
1039	0.63
1040	0.65
1041	0.63
1042	0.58
1043	0.55
1044	0.55
1045	0.56
1046	0.54
1047	0.53
1048	0.52
1049	0.52
1050	0.54
1051	0.55
1052	0.52
1053	0.47
1054	0.47
1055	0.51
1056	0.56
1057	0.58
1058	0.56
1059	0.56
1060	0.55
1061	0.61
1062	0.61
1063	0.63
1064	0.65
1065	0.61
1066	0.64
1067	0.64
1068	0.65
1069	0.6
1070	0.56
1071	0.53
1072	0.53
1073	0.58
1074	0.55
1075	0.5
1076	0.43
1077	0.44
1078	0.45
1079	0.44
1080	0.37
1081	0.34
1082	0.32
1083	0.29
1084	0.32
1085	0.26
1086	0.22
1087	0.2
1088	0.2
1089	0.15
1090	0.21
1091	0.26
1092	0.29
1093	0.36
1094	0.37
1095	0.45
1096	0.44
1097	0.43
1098	0.39
1099	0.38
1100	0.37
1101	0.33
1102	0.34
1103	0.28
1104	0.33
1105	0.35
1106	0.34
1107	0.32
1108	0.29
1109	0.28
1110	0.3
1111	0.35
1112	0.35
1113	0.4
1114	0.4
1115	0.37
1116	0.36
1117	0.34
1118	0.29
1119	0.23
1120	0.2
1121	0.16
1122	0.17
1123	0.19
1124	0.19
1125	0.23
1126	0.23
1127	0.25
1128	0.24
1129	0.29
1130	0.35
1131	0.37
1132	0.41
1133	0.46
1134	0.52
1135	0.49
1136	0.53
1137	0.54
1138	0.56
1139	0.64
1140	0.65
1141	0.62
1142	0.65
1143	0.72
1144	0.72
1145	0.71
1146	0.72
1147	0.69
1148	0.73
1149	0.73
1150	0.72
1151	0.72
1152	0.74
1153	0.67
1154	0.59
1155	0.55
1156	0.51
1157	0.53
1158	0.5
1159	0.51
1160	0.47
1161	0.46
1162	0.44
1163	0.43
1164	0.38
1165	0.32
1166	0.28
1167	0.24
1168	0.25
1169	0.25
1170	0.26
1171	0.25
1172	0.3
1173	0.34
1174	0.35
1175	0.39
1176	0.4
1177	0.45
1178	0.48
1179	0.51
1180	0.47

A0A5C3MSD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer