Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MT36

Protein Details
Accession A0A5C3MT36    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-62HESPQVKLPKVRKRALRRCRRSRDRRKYQSTAADTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-53LPKVRKRALRRCRRSRDRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR027370  Znf-RING_euk  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF00076  RRM_1  
PF13445  zf-RING_UBOX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS51873  TRIAD  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MLAEQTNDTLLQPSTMSLENLDFSTTHESPQVKLPKVRKRALRRCRRSRDRRKYQSTAADTIDDTQVFPVQELSGPCRGSDFAATAVGLPDISKGLDGHINVVLRSKVDPPLPDRWGKPSDVPAKPYAKSPDALKDKPRDSKYVSVSVRDVGTSMTNGRVTSKHVEPRRSSLPHQIPSSEPSRVYYVDEASDVHDMMVFNSTKVSFGPGFHVVGVVTGFESRWVILSNIPRGTDEGSVRDILSPFGQVIETWRHLDRNHHTTMSIRARFADTKQATEAVAALNGAEVLGTTIHARLPPNNMKSGRAEIQDTCIRFTWDAPGWTGYAGYETLTAAEKAMDLARRDKKWGKAIVPSIHEGIPTLGPVTVAFRCMPNDLKLAYLRNFGRPEDTMQQASKTAPVGLVSNAIRQVLQDFGDKVTFRQSPGPYIDGKVHLHAYFLDSSSAAAARDLFVEPPEAIRSIKNASLSVEHMQSISYSLGSEIFNVMKGDVDELRRKFEALHPDNTIVESQENLTSVVELHATDLKSLGDLKQGFERILRGEVLKENGQYVWDTFFSTAAGFAFLSELQQQNPAVQIQSSKRTHKITLHGSASARLKVRTGILEQVETLRECKTLCIPIPRRLVGPFLKMRLRLLQEQIGYENLRVDFASPSVLVRGDKALELVRVAVQEALHSRVTSRTGDVAKCPICLDEPTRPIVLRCGHAWCKACLTNYFTAATESRTFPMTCLGDEGACSCGIPVAVAREVLGSDEFDELAASALTAHVRTHPDEYRWCPGPDCEEIYRIGPADTVLTCPRCLRRVCVHCHIEHHEGMTCAEFKEGLEPEFARWRAGKNVKHCPKCRTAIEKVDGCNHMTCVVCQVHICWVCLKIFEKGEAVYDHMRWKHGGIGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.22
12 0.21
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.36
18 0.42
19 0.39
20 0.47
21 0.56
22 0.6
23 0.69
24 0.75
25 0.77
26 0.79
27 0.84
28 0.87
29 0.89
30 0.9
31 0.91
32 0.95
33 0.96
34 0.96
35 0.96
36 0.97
37 0.97
38 0.97
39 0.95
40 0.92
41 0.9
42 0.89
43 0.84
44 0.77
45 0.68
46 0.59
47 0.5
48 0.44
49 0.38
50 0.28
51 0.21
52 0.17
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.12
58 0.15
59 0.17
60 0.2
61 0.23
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.22
68 0.19
69 0.15
70 0.15
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.1
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.09
83 0.13
84 0.13
85 0.15
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.2
90 0.19
91 0.16
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.23
96 0.27
97 0.3
98 0.37
99 0.41
100 0.45
101 0.44
102 0.46
103 0.46
104 0.45
105 0.43
106 0.45
107 0.49
108 0.49
109 0.51
110 0.51
111 0.53
112 0.51
113 0.53
114 0.5
115 0.44
116 0.42
117 0.41
118 0.44
119 0.47
120 0.51
121 0.53
122 0.55
123 0.59
124 0.66
125 0.66
126 0.62
127 0.6
128 0.63
129 0.61
130 0.61
131 0.56
132 0.5
133 0.48
134 0.44
135 0.39
136 0.3
137 0.25
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.24
149 0.3
150 0.36
151 0.41
152 0.5
153 0.51
154 0.57
155 0.61
156 0.6
157 0.57
158 0.59
159 0.61
160 0.59
161 0.58
162 0.53
163 0.46
164 0.45
165 0.46
166 0.38
167 0.29
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.26
172 0.24
173 0.21
174 0.19
175 0.19
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.13
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.12
190 0.12
191 0.16
192 0.12
193 0.13
194 0.17
195 0.18
196 0.19
197 0.18
198 0.18
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.12
213 0.17
214 0.22
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.21
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.17
228 0.14
229 0.13
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.1
236 0.14
237 0.15
238 0.18
239 0.19
240 0.21
241 0.22
242 0.3
243 0.34
244 0.36
245 0.37
246 0.35
247 0.34
248 0.34
249 0.42
250 0.43
251 0.38
252 0.32
253 0.3
254 0.33
255 0.35
256 0.34
257 0.36
258 0.27
259 0.27
260 0.27
261 0.27
262 0.23
263 0.22
264 0.21
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.02
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.08
281 0.09
282 0.11
283 0.19
284 0.26
285 0.28
286 0.35
287 0.36
288 0.36
289 0.38
290 0.41
291 0.36
292 0.31
293 0.31
294 0.24
295 0.28
296 0.3
297 0.28
298 0.25
299 0.22
300 0.21
301 0.19
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.1
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.08
325 0.1
326 0.11
327 0.19
328 0.25
329 0.26
330 0.32
331 0.37
332 0.41
333 0.46
334 0.5
335 0.45
336 0.45
337 0.51
338 0.5
339 0.47
340 0.43
341 0.37
342 0.31
343 0.28
344 0.22
345 0.16
346 0.12
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.08
353 0.07
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.12
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.17
365 0.19
366 0.18
367 0.22
368 0.21
369 0.24
370 0.25
371 0.24
372 0.25
373 0.22
374 0.25
375 0.24
376 0.25
377 0.22
378 0.21
379 0.21
380 0.2
381 0.19
382 0.16
383 0.12
384 0.1
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.15
406 0.15
407 0.15
408 0.2
409 0.2
410 0.22
411 0.23
412 0.25
413 0.2
414 0.21
415 0.22
416 0.18
417 0.18
418 0.16
419 0.16
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.1
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.15
454 0.15
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.08
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.11
478 0.17
479 0.17
480 0.21
481 0.2
482 0.21
483 0.21
484 0.23
485 0.31
486 0.29
487 0.32
488 0.3
489 0.31
490 0.31
491 0.31
492 0.26
493 0.16
494 0.12
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.08
508 0.09
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.11
516 0.11
517 0.13
518 0.16
519 0.17
520 0.16
521 0.16
522 0.17
523 0.13
524 0.14
525 0.14
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.16
530 0.16
531 0.15
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.13
536 0.11
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.08
553 0.09
554 0.08
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.1
561 0.09
562 0.14
563 0.15
564 0.24
565 0.28
566 0.31
567 0.35
568 0.38
569 0.42
570 0.42
571 0.47
572 0.45
573 0.48
574 0.45
575 0.44
576 0.41
577 0.42
578 0.39
579 0.35
580 0.3
581 0.23
582 0.21
583 0.2
584 0.21
585 0.19
586 0.18
587 0.19
588 0.19
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.18
593 0.16
594 0.16
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.12
599 0.14
600 0.17
601 0.2
602 0.29
603 0.34
604 0.41
605 0.47
606 0.47
607 0.45
608 0.41
609 0.44
610 0.36
611 0.38
612 0.34
613 0.33
614 0.35
615 0.35
616 0.36
617 0.36
618 0.37
619 0.34
620 0.34
621 0.34
622 0.31
623 0.31
624 0.3
625 0.27
626 0.23
627 0.19
628 0.18
629 0.14
630 0.13
631 0.12
632 0.12
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.11
640 0.09
641 0.1
642 0.11
643 0.1
644 0.1
645 0.11
646 0.12
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.08
655 0.1
656 0.11
657 0.14
658 0.13
659 0.13
660 0.14
661 0.15
662 0.18
663 0.17
664 0.17
665 0.19
666 0.23
667 0.24
668 0.26
669 0.31
670 0.29
671 0.29
672 0.28
673 0.23
674 0.21
675 0.22
676 0.24
677 0.25
678 0.26
679 0.28
680 0.3
681 0.29
682 0.28
683 0.31
684 0.3
685 0.25
686 0.25
687 0.29
688 0.32
689 0.37
690 0.39
691 0.35
692 0.37
693 0.38
694 0.38
695 0.34
696 0.36
697 0.33
698 0.32
699 0.32
700 0.27
701 0.26
702 0.25
703 0.25
704 0.22
705 0.2
706 0.19
707 0.21
708 0.21
709 0.18
710 0.24
711 0.22
712 0.19
713 0.2
714 0.19
715 0.17
716 0.17
717 0.17
718 0.12
719 0.1
720 0.1
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.09
727 0.1
728 0.1
729 0.11
730 0.1
731 0.1
732 0.11
733 0.11
734 0.08
735 0.08
736 0.09
737 0.08
738 0.08
739 0.08
740 0.07
741 0.07
742 0.06
743 0.05
744 0.04
745 0.05
746 0.06
747 0.06
748 0.07
749 0.1
750 0.14
751 0.16
752 0.22
753 0.26
754 0.3
755 0.37
756 0.42
757 0.46
758 0.47
759 0.46
760 0.42
761 0.41
762 0.41
763 0.38
764 0.38
765 0.33
766 0.3
767 0.31
768 0.3
769 0.29
770 0.24
771 0.2
772 0.14
773 0.12
774 0.13
775 0.12
776 0.15
777 0.19
778 0.2
779 0.21
780 0.26
781 0.3
782 0.34
783 0.36
784 0.4
785 0.45
786 0.52
787 0.59
788 0.64
789 0.65
790 0.61
791 0.66
792 0.65
793 0.6
794 0.52
795 0.46
796 0.39
797 0.34
798 0.32
799 0.28
800 0.22
801 0.17
802 0.16
803 0.14
804 0.12
805 0.17
806 0.18
807 0.16
808 0.19
809 0.2
810 0.22
811 0.31
812 0.31
813 0.28
814 0.28
815 0.31
816 0.37
817 0.45
818 0.49
819 0.5
820 0.61
821 0.68
822 0.76
823 0.8
824 0.78
825 0.78
826 0.79
827 0.79
828 0.76
829 0.75
830 0.74
831 0.76
832 0.73
833 0.68
834 0.67
835 0.6
836 0.54
837 0.47
838 0.38
839 0.33
840 0.29
841 0.25
842 0.24
843 0.24
844 0.22
845 0.21
846 0.21
847 0.27
848 0.28
849 0.29
850 0.25
851 0.26
852 0.26
853 0.3
854 0.31
855 0.29
856 0.28
857 0.29
858 0.29
859 0.27
860 0.3
861 0.27
862 0.29
863 0.26
864 0.27
865 0.32
866 0.32
867 0.34
868 0.31
869 0.31