Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NCS8

Protein Details
Accession A0A5C3NCS8    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-276IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-51PKKGKVSKA
200-206KKKGPRK
256-267GFRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MKKAGAVKNEKKKAESSDSDSSSSSSESESEKEEETLAAKSSPKKGKVSKAKSPSPSSSSASSSSSSESEDEDEKPALKKGKALKTKSPSPSSSSSSSSEEEEEQEEEEPAAKKSKASKTKHSSSSSSSSSDSDSDSPSKARTKKLTSSAEEEGEEQTAVTKKRRTDEDGAAVPTAVSSNERSESPPGAGNGNGNGSGEKKKGPRKSNVPFSRIKSDHVKFVDERLRDNTYDGKGGPQNDYGERASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYRGGEITMESHSIKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.61
3 0.57
4 0.58
5 0.57
6 0.56
7 0.51
8 0.44
9 0.36
10 0.3
11 0.23
12 0.15
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.19
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.14
25 0.14
26 0.17
27 0.21
28 0.3
29 0.37
30 0.41
31 0.48
32 0.54
33 0.62
34 0.7
35 0.73
36 0.74
37 0.75
38 0.79
39 0.78
40 0.77
41 0.73
42 0.66
43 0.62
44 0.56
45 0.5
46 0.44
47 0.39
48 0.34
49 0.29
50 0.25
51 0.22
52 0.2
53 0.18
54 0.16
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.2
64 0.23
65 0.21
66 0.26
67 0.32
68 0.41
69 0.49
70 0.53
71 0.59
72 0.61
73 0.69
74 0.71
75 0.68
76 0.6
77 0.57
78 0.56
79 0.51
80 0.47
81 0.41
82 0.36
83 0.34
84 0.32
85 0.28
86 0.25
87 0.21
88 0.19
89 0.17
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.21
102 0.31
103 0.38
104 0.42
105 0.52
106 0.57
107 0.65
108 0.7
109 0.67
110 0.6
111 0.55
112 0.55
113 0.47
114 0.41
115 0.34
116 0.27
117 0.24
118 0.21
119 0.18
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.2
127 0.22
128 0.26
129 0.3
130 0.34
131 0.39
132 0.47
133 0.5
134 0.47
135 0.48
136 0.45
137 0.41
138 0.36
139 0.31
140 0.23
141 0.17
142 0.14
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.14
148 0.18
149 0.2
150 0.25
151 0.29
152 0.33
153 0.36
154 0.4
155 0.42
156 0.41
157 0.4
158 0.35
159 0.31
160 0.24
161 0.18
162 0.13
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.17
187 0.23
188 0.32
189 0.4
190 0.47
191 0.54
192 0.62
193 0.7
194 0.77
195 0.77
196 0.75
197 0.72
198 0.7
199 0.71
200 0.62
201 0.57
202 0.56
203 0.5
204 0.52
205 0.47
206 0.47
207 0.37
208 0.43
209 0.46
210 0.37
211 0.39
212 0.36
213 0.38
214 0.34
215 0.35
216 0.33
217 0.28
218 0.3
219 0.27
220 0.27
221 0.27
222 0.29
223 0.29
224 0.27
225 0.28
226 0.27
227 0.31
228 0.27
229 0.29
230 0.28
231 0.27
232 0.25
233 0.23
234 0.23
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.21
241 0.2
242 0.24
243 0.26
244 0.33
245 0.42
246 0.52
247 0.61
248 0.67
249 0.76
250 0.81
251 0.88
252 0.9
253 0.9
254 0.9
255 0.87
256 0.86
257 0.85
258 0.78
259 0.68
260 0.58
261 0.49
262 0.4
263 0.35
264 0.26
265 0.17