Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NJG6

Protein Details
Accession A0A5C3NJG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSSFKRKTVSKQPHATQHGTRHydrophilic
434-456QVVPTPRKSAKAKKKVAFRSDAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
440-448RKSAKAKKK
Subcellular Location(s) mito 24, cyto 1.5, cyto_nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
CDD cd19494  Elp4  
Amino Acid Sequences MSSFKRKTVSKQPHATQHGTRSSPSSAATIITSTGIPSLDDILGGGLPLSCSSVILAPDVHSAYGELVAKYFVAQGLAVKQRILVVGDSAQEFASECMWTHGDVASAPSTSGLPGDEEEEEKASDHDSKVRIAWRYEQMKQFQTTVNSSNSSADEFCATFDLTCRIPAQVIAQAAEAQILSFIPVSHTGDSSPSDSVLKRVADVLQRNGPTPQATRICVPFFGSAEWGDLTPQDAIWFHYRLRRLLREYANSCAMICPVSYLCEDRWGGPGWLQKLAWVSDACVTLSAFGGDPSLSAIFPSHHGMVHIHSLPAPHTLLPPSDRFSALRGVSASASSAGGVGENNLAFKCMRKRLIFETLHLDVEGGVGERRTTPSTTFSAVEAGRPDDGPAEQPSGVGGETSQIGSDAAAVQVGIEDLSVPQTRAGSHSGTKGQVVPTPRKSAKAKKKVAFRSDAPDLYDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.76
4 0.74
5 0.72
6 0.64
7 0.58
8 0.52
9 0.47
10 0.43
11 0.37
12 0.3
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.16
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.15
64 0.2
65 0.2
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.14
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.17
114 0.17
115 0.18
116 0.21
117 0.26
118 0.28
119 0.27
120 0.32
121 0.36
122 0.41
123 0.45
124 0.48
125 0.48
126 0.49
127 0.49
128 0.45
129 0.39
130 0.37
131 0.34
132 0.32
133 0.29
134 0.26
135 0.25
136 0.25
137 0.22
138 0.2
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.11
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.08
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.18
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.24
196 0.23
197 0.19
198 0.18
199 0.21
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.15
227 0.18
228 0.21
229 0.26
230 0.28
231 0.3
232 0.37
233 0.4
234 0.43
235 0.43
236 0.43
237 0.4
238 0.35
239 0.31
240 0.24
241 0.19
242 0.12
243 0.1
244 0.08
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.17
257 0.2
258 0.17
259 0.19
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.17
264 0.17
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.08
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.17
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.16
300 0.15
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.16
306 0.18
307 0.19
308 0.2
309 0.2
310 0.2
311 0.2
312 0.25
313 0.22
314 0.22
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.1
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.13
335 0.2
336 0.25
337 0.32
338 0.34
339 0.39
340 0.44
341 0.54
342 0.51
343 0.46
344 0.46
345 0.41
346 0.39
347 0.35
348 0.28
349 0.18
350 0.17
351 0.14
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.11
358 0.13
359 0.15
360 0.16
361 0.2
362 0.22
363 0.25
364 0.24
365 0.22
366 0.25
367 0.23
368 0.23
369 0.21
370 0.2
371 0.18
372 0.17
373 0.17
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.14
384 0.11
385 0.08
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.16
412 0.19
413 0.19
414 0.22
415 0.27
416 0.3
417 0.31
418 0.32
419 0.33
420 0.32
421 0.32
422 0.36
423 0.39
424 0.41
425 0.5
426 0.5
427 0.55
428 0.61
429 0.68
430 0.73
431 0.75
432 0.78
433 0.76
434 0.84
435 0.87
436 0.87
437 0.83
438 0.77
439 0.74
440 0.72
441 0.67