Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NA25

Protein Details
Accession A0A5C3NA25    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-116ETADSSNKRKRRRLPDPAFESADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-105RKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022042  snRNA-activating_su3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12251  SNAPC3  
Amino Acid Sequences MSHSHESHFGPPSAPINMASFVQTAKEANLFSQSSEAVGAKNHWPVLTEEQRQTVALECGVSDLKSTLTNALDDPVLAANLFKSHDATVSAIHETADSSNKRKRRRLPDPAFESADILALRDKLDNIQLKSWQLSLDAALFMRAPKNSDQNTLHHIKTSSEAVTNTEQAILTVTVHNRVPWGPGYFTRSSQHAVLSSQTLGDLFEAIPCTSNELPAETLLEGTVVGYDAQSPPTPSPGCVICIEGLAYGDGQNEPDYADKLLEFLEKSPDSKRPSIKKGPSVYDTKFSSLTLRLNEPYWLLHQGNCEHFLVIDQIRLLHPEDLVSGYPLTVQITPALLDLCRACSKVPAVLSVIGDIRLGESPCVLCGPCWRNMGDPQDESVMVVPLPKHEMGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.21
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.17
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.16
14 0.14
15 0.14
16 0.2
17 0.19
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.16
22 0.17
23 0.17
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.17
28 0.21
29 0.22
30 0.2
31 0.21
32 0.24
33 0.32
34 0.38
35 0.4
36 0.39
37 0.41
38 0.42
39 0.4
40 0.37
41 0.31
42 0.23
43 0.18
44 0.15
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.13
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.17
84 0.18
85 0.23
86 0.29
87 0.36
88 0.45
89 0.53
90 0.62
91 0.66
92 0.74
93 0.8
94 0.83
95 0.87
96 0.85
97 0.81
98 0.74
99 0.63
100 0.53
101 0.42
102 0.34
103 0.23
104 0.16
105 0.12
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.15
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.25
116 0.26
117 0.27
118 0.26
119 0.2
120 0.15
121 0.14
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.09
131 0.11
132 0.13
133 0.21
134 0.22
135 0.29
136 0.3
137 0.31
138 0.37
139 0.39
140 0.36
141 0.31
142 0.3
143 0.24
144 0.23
145 0.23
146 0.18
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.12
170 0.14
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.14
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.15
227 0.16
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.25
257 0.29
258 0.35
259 0.43
260 0.45
261 0.54
262 0.62
263 0.66
264 0.68
265 0.69
266 0.68
267 0.65
268 0.63
269 0.56
270 0.53
271 0.47
272 0.41
273 0.35
274 0.3
275 0.28
276 0.25
277 0.26
278 0.23
279 0.24
280 0.24
281 0.24
282 0.24
283 0.22
284 0.2
285 0.19
286 0.22
287 0.19
288 0.19
289 0.22
290 0.26
291 0.28
292 0.29
293 0.27
294 0.21
295 0.2
296 0.19
297 0.2
298 0.16
299 0.14
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.22
336 0.23
337 0.24
338 0.24
339 0.22
340 0.21
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.12
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.16
352 0.14
353 0.12
354 0.21
355 0.25
356 0.29
357 0.32
358 0.33
359 0.35
360 0.42
361 0.48
362 0.45
363 0.43
364 0.39
365 0.39
366 0.37
367 0.34
368 0.28
369 0.22
370 0.15
371 0.16
372 0.14
373 0.14
374 0.19