FuNGI

A0A5C3NGQ3

Protein Details

Accession

A0A5C3NGQ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
458-481	GEERSPSKSKSKTSRKEKDSESDS	Hydrophilic
507-537	KEAKKARKAAVKAERRTRRVEKKNAKEEFSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-283	KKRRKK
505-556	ESKEAKKARKAAVKAERRTRRVEKKNAKEEFSSEVRKQERGIAQKGNARVRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPKKKSIFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLINDPEASQHVLKAFERENVEKGKSRADLEASLSPSDLVHDLERANIGEASLYGVYYDDTEYDYMQHLKQAGVAEEGVDSMLIEAPTPQSKGKGKNKAPIELKEDLSLPAEALPSTSELPRNYAYERQQAVPSAIAGFQPDLDPHLRQTLEALEDDAFVDESIEDDFFAELVAEGERDEDEEFEYEFDEDGVEEGEFDEEEEGGEESWEARFKQFKAARSAADAASDFDEEDEEDRDTVSGLPQISVLGGKKRRKKTSDASGYSMSSSSMYRNEHLSVLDERFDAIEHEYDEYFEDPEEDSDGDEDEAPDLLTSRADFSAMLDEFLTDYEILGRKMKPRLEGDTAAEKLDTLRRAIGQPINLRQEGDEEEEEGLEEHPWFREEEKEDRWDCETILTTYSNLENHPRLISSRSTKPVPKIRLDPRTGLPTVGEERSPSKSKSKTSRKEKDSESDSDLTETERTAAAATARVTVARSKDESKEAKKARKAAVKAERRTRRVEKKNAKEEFSSEVRKQERGIAQKGNARVRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.69
3	0.63
4	0.63
5	0.61
6	0.61
7	0.61
8	0.6
9	0.6
10	0.59
11	0.63
12	0.61
13	0.55
14	0.56
15	0.54
16	0.49
17	0.47
18	0.45
19	0.4
20	0.35
21	0.35
22	0.28
23	0.21
24	0.21
25	0.24
26	0.24
27	0.26
28	0.26
29	0.28
30	0.33
31	0.34
32	0.37
33	0.39
34	0.43
35	0.44
36	0.43
37	0.44
38	0.42
39	0.41
40	0.4
41	0.37
42	0.35
43	0.34
44	0.37
45	0.33
46	0.3
47	0.28
48	0.24
49	0.2
50	0.19
51	0.16
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.12
56	0.14
57	0.15
58	0.14
59	0.15
60	0.13
61	0.12
62	0.1
63	0.1
64	0.11
65	0.1
66	0.09
67	0.07
68	0.07
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.06
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.1
77	0.12
78	0.14
79	0.14
80	0.16
81	0.16
82	0.15
83	0.18
84	0.19
85	0.17
86	0.16
87	0.16
88	0.13
89	0.12
90	0.12
91	0.09
92	0.07
93	0.06
94	0.04
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.06
99	0.09
100	0.11
101	0.13
102	0.13
103	0.18
104	0.24
105	0.35
106	0.44
107	0.52
108	0.56
109	0.63
110	0.67
111	0.7
112	0.7
113	0.65
114	0.62
115	0.55
116	0.51
117	0.44
118	0.4
119	0.32
120	0.27
121	0.21
122	0.15
123	0.12
124	0.11
125	0.09
126	0.09
127	0.08
128	0.08
129	0.1
130	0.11
131	0.14
132	0.14
133	0.18
134	0.2
135	0.22
136	0.22
137	0.28
138	0.3
139	0.35
140	0.37
141	0.35
142	0.35
143	0.34
144	0.32
145	0.26
146	0.22
147	0.15
148	0.13
149	0.11
150	0.1
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.16
160	0.16
161	0.15
162	0.16
163	0.16
164	0.15
165	0.15
166	0.15
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.08
172	0.06
173	0.06
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.03
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.03
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.08
225	0.12
226	0.12
227	0.22
228	0.26
229	0.3
230	0.36
231	0.38
232	0.37
233	0.37
234	0.38
235	0.29
236	0.26
237	0.21
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.08
261	0.08
262	0.12
263	0.19
264	0.26
265	0.34
266	0.43
267	0.5
268	0.53
269	0.59
270	0.62
271	0.65
272	0.69
273	0.64
274	0.6
275	0.54
276	0.51
277	0.44
278	0.35
279	0.25
280	0.15
281	0.12
282	0.09
283	0.11
284	0.12
285	0.12
286	0.14
287	0.15
288	0.15
289	0.14
290	0.16
291	0.15
292	0.14
293	0.14
294	0.12
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.09
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.12
334	0.11
335	0.12
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.05
342	0.05
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.12
347	0.14
348	0.18
349	0.24
350	0.27
351	0.3
352	0.32
353	0.37
354	0.39
355	0.4
356	0.39
357	0.4
358	0.38
359	0.33
360	0.29
361	0.23
362	0.19
363	0.21
364	0.18
365	0.12
366	0.13
367	0.14
368	0.16
369	0.21
370	0.22
371	0.23
372	0.28
373	0.33
374	0.36
375	0.35
376	0.34
377	0.3
378	0.29
379	0.26
380	0.25
381	0.19
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.12
387	0.11
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.07
392	0.08
393	0.09
394	0.09
395	0.15
396	0.19
397	0.25
398	0.29
399	0.36
400	0.37
401	0.39
402	0.4
403	0.35
404	0.31
405	0.27
406	0.24
407	0.18
408	0.18
409	0.17
410	0.14
411	0.15
412	0.16
413	0.15
414	0.14
415	0.18
416	0.18
417	0.19
418	0.2
419	0.19
420	0.19
421	0.22
422	0.27
423	0.28
424	0.34
425	0.38
426	0.42
427	0.47
428	0.54
429	0.6
430	0.6
431	0.6
432	0.62
433	0.66
434	0.7
435	0.69
436	0.66
437	0.61
438	0.61
439	0.55
440	0.46
441	0.36
442	0.31
443	0.31
444	0.28
445	0.24
446	0.19
447	0.22
448	0.27
449	0.31
450	0.3
451	0.34
452	0.39
453	0.47
454	0.57
455	0.65
456	0.69
457	0.76
458	0.83
459	0.82
460	0.85
461	0.82
462	0.8
463	0.75
464	0.69
465	0.65
466	0.57
467	0.5
468	0.43
469	0.37
470	0.29
471	0.24
472	0.19
473	0.14
474	0.11
475	0.11
476	0.1
477	0.11
478	0.1
479	0.12
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.15
485	0.18
486	0.2
487	0.22
488	0.25
489	0.27
490	0.32
491	0.4
492	0.47
493	0.5
494	0.57
495	0.61
496	0.67
497	0.7
498	0.74
499	0.75
500	0.75
501	0.73
502	0.73
503	0.75
504	0.75
505	0.77
506	0.8
507	0.81
508	0.76
509	0.81
510	0.81
511	0.82
512	0.82
513	0.84
514	0.84
515	0.85
516	0.91
517	0.89
518	0.83
519	0.75
520	0.67
521	0.63
522	0.59
523	0.56
524	0.49
525	0.5
526	0.49
527	0.48
528	0.46
529	0.48
530	0.49
531	0.49
532	0.54
533	0.53
534	0.55
535	0.59
536	0.66
537	0.67

A0A5C3NGQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer