Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NDJ3

Protein Details
Accession A0A5C3NDJ3    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-434ITPSPSPTKSRGKRRKAAVLVPETHydrophilic
452-471SLSLAERVKKRRRVTILAKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-426KSRGKRRK
460-467KKRRRVTI
469-470AK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR012904  OGG_N  
Gene Ontology GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008534  F:oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
PF07934  OGG_N  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSCPIPAGFHALPLPIVQLSLAAVLKCGQSFRWSIFPLSSGPVPPSHPTHEYRLCLRDRVVCLRQSPDTLYYSTVLPTRDQHASSTIFEEEKVRKETLDWIRDYFQLDVDLLHLYNDWSQRDPVFKSFRDRFEGIRMLRQDPWENLISFICSSNNNISRITKMVTSLCEHFSPPLLSLPPPELYSDSSASSLLSPPATPLSERPLSQSQQQEDMSTERSLRTYHPFPSPAALASSSVASILRSLGFGYRAEYVQKTAQMLSEAHPPKSEDDDSAERYLRTLRDMSTGEAREALLGFMGVGRKVADCVLLMSLDKKEVVPVDTHVHQIAMRYYGVSSGSKARSNGKIPMTPKIYDQVNAKLAEVWGDYAGWAHSVLFTADLKSFSTYGLDIPTPVPASSVSDLFTGLPTPPITPSPSPTKSRGKRRKAAVLVPETSISAKEESTDEIIQDDSSLSLAERVKKRRRVTILAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.12
3 0.12
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.11
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.13
16 0.16
17 0.18
18 0.21
19 0.28
20 0.28
21 0.29
22 0.29
23 0.3
24 0.28
25 0.29
26 0.28
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.24
31 0.27
32 0.29
33 0.31
34 0.34
35 0.36
36 0.43
37 0.48
38 0.49
39 0.51
40 0.54
41 0.51
42 0.5
43 0.49
44 0.48
45 0.46
46 0.51
47 0.51
48 0.47
49 0.48
50 0.49
51 0.48
52 0.43
53 0.41
54 0.36
55 0.33
56 0.3
57 0.28
58 0.24
59 0.22
60 0.22
61 0.21
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.22
66 0.25
67 0.25
68 0.25
69 0.26
70 0.28
71 0.27
72 0.27
73 0.24
74 0.21
75 0.2
76 0.24
77 0.24
78 0.27
79 0.29
80 0.27
81 0.25
82 0.26
83 0.35
84 0.39
85 0.42
86 0.39
87 0.38
88 0.4
89 0.41
90 0.42
91 0.33
92 0.24
93 0.18
94 0.16
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.11
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.23
109 0.25
110 0.29
111 0.32
112 0.33
113 0.4
114 0.45
115 0.47
116 0.5
117 0.49
118 0.44
119 0.44
120 0.5
121 0.42
122 0.42
123 0.41
124 0.37
125 0.38
126 0.39
127 0.36
128 0.29
129 0.32
130 0.28
131 0.25
132 0.24
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.16
137 0.13
138 0.1
139 0.13
140 0.19
141 0.23
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.25
146 0.26
147 0.25
148 0.18
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.14
188 0.16
189 0.16
190 0.21
191 0.24
192 0.25
193 0.3
194 0.34
195 0.29
196 0.32
197 0.32
198 0.28
199 0.24
200 0.24
201 0.21
202 0.17
203 0.16
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.18
209 0.19
210 0.21
211 0.24
212 0.25
213 0.25
214 0.26
215 0.24
216 0.18
217 0.16
218 0.13
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.2
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.21
253 0.21
254 0.25
255 0.24
256 0.15
257 0.18
258 0.22
259 0.24
260 0.25
261 0.25
262 0.2
263 0.2
264 0.22
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.13
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.23
273 0.23
274 0.21
275 0.2
276 0.19
277 0.15
278 0.14
279 0.12
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.13
307 0.16
308 0.17
309 0.19
310 0.17
311 0.17
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.11
322 0.11
323 0.16
324 0.19
325 0.21
326 0.23
327 0.28
328 0.32
329 0.35
330 0.4
331 0.38
332 0.41
333 0.4
334 0.47
335 0.46
336 0.41
337 0.38
338 0.37
339 0.33
340 0.31
341 0.33
342 0.31
343 0.31
344 0.31
345 0.3
346 0.26
347 0.25
348 0.23
349 0.19
350 0.14
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.13
372 0.12
373 0.11
374 0.14
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.11
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.11
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.15
398 0.2
399 0.21
400 0.26
401 0.33
402 0.38
403 0.43
404 0.48
405 0.57
406 0.61
407 0.7
408 0.76
409 0.77
410 0.8
411 0.84
412 0.87
413 0.84
414 0.83
415 0.81
416 0.78
417 0.7
418 0.63
419 0.55
420 0.45
421 0.38
422 0.3
423 0.23
424 0.16
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.16
429 0.19
430 0.19
431 0.17
432 0.17
433 0.18
434 0.16
435 0.15
436 0.13
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.07
441 0.11
442 0.15
443 0.24
444 0.32
445 0.42
446 0.52
447 0.61
448 0.67
449 0.73
450 0.77
451 0.79