Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NFT0

Protein Details
Accession A0A5C3NFT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-63AVSSTRRQKDLRQRKEKRVLKEVRKLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-62QKDLRQRKEKRVLKEVRKLK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto_nucl 7.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
Amino Acid Sequences MTISSLYRAYLREARRLPHEYLRLFFRLKARDDVEAVSSTRRQKDLRQRKEKRVLKEVRKLKAASSGDRTAFLHVLDLAYGRKGKLKWELLHPLLENSGGPVPDPIIAGVDKSRPPSYSPQIAALLTSQYARAVKALAPKNLVTPPVLPAQADPSSEEARLLGPFSKRREVNIRHRYFKEQTDRIYPPLQVVVHERGKDTGSSSHDTLKQAGIRGTAMQDAGIFEEVLDLAGSGHEPPPAGAFNSSLPTRFIRRRYRELLGKLPILTYNHAPASRGSGRYEVSLAPRALISSVPRTAKGIPSVDADDLAWLESSSNEKDAAKSNSGEHAAQQKQDNVAKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.51
3 0.55
4 0.54
5 0.55
6 0.6
7 0.54
8 0.53
9 0.54
10 0.5
11 0.47
12 0.46
13 0.44
14 0.43
15 0.44
16 0.47
17 0.44
18 0.43
19 0.43
20 0.41
21 0.36
22 0.32
23 0.29
24 0.25
25 0.28
26 0.31
27 0.34
28 0.37
29 0.36
30 0.44
31 0.54
32 0.61
33 0.68
34 0.72
35 0.77
36 0.84
37 0.92
38 0.89
39 0.86
40 0.86
41 0.85
42 0.84
43 0.84
44 0.82
45 0.77
46 0.77
47 0.69
48 0.6
49 0.59
50 0.53
51 0.48
52 0.47
53 0.46
54 0.4
55 0.41
56 0.4
57 0.33
58 0.3
59 0.24
60 0.18
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.16
71 0.2
72 0.28
73 0.36
74 0.37
75 0.43
76 0.51
77 0.48
78 0.51
79 0.47
80 0.39
81 0.31
82 0.28
83 0.2
84 0.14
85 0.14
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.12
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.2
103 0.26
104 0.31
105 0.34
106 0.34
107 0.33
108 0.33
109 0.32
110 0.29
111 0.23
112 0.17
113 0.11
114 0.1
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.18
123 0.22
124 0.23
125 0.25
126 0.25
127 0.27
128 0.28
129 0.27
130 0.19
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.13
136 0.12
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.11
151 0.16
152 0.2
153 0.25
154 0.25
155 0.28
156 0.37
157 0.42
158 0.5
159 0.56
160 0.58
161 0.58
162 0.6
163 0.64
164 0.57
165 0.57
166 0.55
167 0.48
168 0.45
169 0.46
170 0.45
171 0.42
172 0.41
173 0.33
174 0.25
175 0.25
176 0.22
177 0.16
178 0.18
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.17
188 0.17
189 0.2
190 0.2
191 0.23
192 0.26
193 0.26
194 0.26
195 0.24
196 0.22
197 0.2
198 0.2
199 0.17
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.23
237 0.28
238 0.36
239 0.43
240 0.5
241 0.58
242 0.62
243 0.67
244 0.69
245 0.69
246 0.68
247 0.62
248 0.57
249 0.49
250 0.43
251 0.39
252 0.32
253 0.29
254 0.23
255 0.22
256 0.23
257 0.23
258 0.23
259 0.2
260 0.26
261 0.29
262 0.28
263 0.27
264 0.27
265 0.27
266 0.28
267 0.29
268 0.23
269 0.23
270 0.27
271 0.25
272 0.22
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.23
280 0.24
281 0.25
282 0.27
283 0.29
284 0.31
285 0.34
286 0.31
287 0.27
288 0.29
289 0.31
290 0.28
291 0.27
292 0.22
293 0.17
294 0.15
295 0.14
296 0.1
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.18
306 0.25
307 0.3
308 0.3
309 0.3
310 0.31
311 0.35
312 0.38
313 0.36
314 0.33
315 0.37
316 0.37
317 0.39
318 0.42
319 0.39
320 0.43