Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N7L6

Protein Details
Accession A0A5C3N7L6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-271VEKLNRDIDKKRKFSRKRANEDEGDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-141KKKARKARR
255-263KKRKFSRKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDIANKVAHTVSNVAEAAEVFTEKMTDAQVEAAEQDAAASSSAEGKKLTVEERQAKLEQLRNKMRSSAVANRQSLVEESQKQKLGAKEQARLDRQRKLAETLRLKADAEERGEDVERQKNWEYTIEENDEWEKKKARKARRADFEFHDDAHAARRKYKKDLDYIKPNLEAYNRQKEIALGLAPGTLVKQGEGSSTSTESVPKMHHNVQLVPTTEEQRRAAEMLYRDANTLLYADNKPSEEAIDRVVEKLNRDIDKKRKFSRKRANEDEGDITYINERNRVFNKKIARFYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.12
6 0.11
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.21
36 0.19
37 0.27
38 0.35
39 0.37
40 0.42
41 0.41
42 0.42
43 0.45
44 0.47
45 0.45
46 0.47
47 0.53
48 0.52
49 0.53
50 0.52
51 0.47
52 0.45
53 0.45
54 0.45
55 0.45
56 0.49
57 0.48
58 0.46
59 0.45
60 0.41
61 0.36
62 0.29
63 0.26
64 0.24
65 0.27
66 0.31
67 0.33
68 0.33
69 0.36
70 0.36
71 0.36
72 0.39
73 0.4
74 0.41
75 0.45
76 0.53
77 0.54
78 0.59
79 0.57
80 0.56
81 0.56
82 0.54
83 0.5
84 0.48
85 0.49
86 0.49
87 0.5
88 0.47
89 0.45
90 0.42
91 0.4
92 0.35
93 0.32
94 0.27
95 0.23
96 0.2
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.21
103 0.19
104 0.22
105 0.24
106 0.24
107 0.24
108 0.27
109 0.25
110 0.22
111 0.26
112 0.26
113 0.23
114 0.23
115 0.24
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.24
120 0.24
121 0.31
122 0.38
123 0.46
124 0.53
125 0.61
126 0.68
127 0.72
128 0.74
129 0.72
130 0.67
131 0.64
132 0.55
133 0.46
134 0.37
135 0.26
136 0.21
137 0.23
138 0.24
139 0.18
140 0.23
141 0.28
142 0.3
143 0.37
144 0.43
145 0.41
146 0.46
147 0.54
148 0.56
149 0.6
150 0.61
151 0.57
152 0.51
153 0.47
154 0.4
155 0.32
156 0.32
157 0.29
158 0.35
159 0.33
160 0.32
161 0.32
162 0.3
163 0.29
164 0.24
165 0.18
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.19
190 0.23
191 0.26
192 0.27
193 0.29
194 0.31
195 0.34
196 0.32
197 0.29
198 0.26
199 0.27
200 0.27
201 0.28
202 0.26
203 0.23
204 0.22
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.22
211 0.21
212 0.21
213 0.2
214 0.2
215 0.15
216 0.14
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.16
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.3
237 0.3
238 0.34
239 0.42
240 0.48
241 0.57
242 0.63
243 0.68
244 0.72
245 0.77
246 0.85
247 0.87
248 0.88
249 0.88
250 0.89
251 0.88
252 0.81
253 0.76
254 0.7
255 0.6
256 0.51
257 0.41
258 0.32
259 0.27
260 0.26
261 0.22
262 0.22
263 0.22
264 0.26
265 0.33
266 0.41
267 0.41
268 0.45
269 0.55
270 0.58
271 0.66
272 0.67
273 0.69
274 0.64
275 0.67
276 0.7
277 0.61
278 0.56
279 0.5
280 0.47
281 0.41
282 0.4
283 0.37
284 0.32
285 0.34
286 0.3