Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NIU9

Protein Details
Accession A0A5C3NIU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-164IEAHKARRLDHKKKTRYTNPLKMKFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-167KARRLDHKKKTRYTNPLKMKFKAKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12246  RRM1_U1A_like  
cd12247  RRM2_U1A_like  
Amino Acid Sequences MADVEPVPAPAPAAPDAMEGVVATEEPTTNGTDGDAAAAPQPAATETLYIQNLNEKIKIPVLKASLRGLFKSYGEVLDVVAHANLRMRGQAFVSFPSADIAAKALKEVRGFPLYGKPMQISFARTPSDAVVQKMSPNDIEAHKARRLDHKKKTRYTNPLKMKFKAKRMASEMDAAATAPAARRPHIQMPDEYLPPNKILFLQNLPESVTKDQLLALFSQYPNLYEVRLIPTKKDIAFVEYMDEGSATVAKDALHNYKLDGENKIKITFARK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.13
5 0.12
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.14
38 0.18
39 0.21
40 0.22
41 0.23
42 0.19
43 0.2
44 0.25
45 0.27
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.29
50 0.3
51 0.32
52 0.33
53 0.32
54 0.31
55 0.29
56 0.26
57 0.24
58 0.24
59 0.21
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.19
113 0.17
114 0.21
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.14
127 0.14
128 0.18
129 0.2
130 0.22
131 0.23
132 0.31
133 0.41
134 0.46
135 0.54
136 0.61
137 0.67
138 0.73
139 0.81
140 0.79
141 0.8
142 0.81
143 0.81
144 0.81
145 0.82
146 0.8
147 0.74
148 0.75
149 0.71
150 0.69
151 0.67
152 0.59
153 0.56
154 0.55
155 0.55
156 0.47
157 0.44
158 0.35
159 0.27
160 0.25
161 0.18
162 0.13
163 0.09
164 0.07
165 0.05
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.13
170 0.18
171 0.25
172 0.31
173 0.33
174 0.3
175 0.37
176 0.39
177 0.38
178 0.35
179 0.3
180 0.26
181 0.24
182 0.23
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.2
190 0.21
191 0.23
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.12
212 0.14
213 0.17
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.28
218 0.33
219 0.33
220 0.35
221 0.3
222 0.28
223 0.3
224 0.28
225 0.26
226 0.21
227 0.21
228 0.17
229 0.15
230 0.11
231 0.09
232 0.11
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.15
239 0.2
240 0.2
241 0.2
242 0.22
243 0.28
244 0.33
245 0.34
246 0.37
247 0.36
248 0.41
249 0.44
250 0.43
251 0.37