Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NGV7

Protein Details
Accession A0A5C3NGV7    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-132AKPAGEKDQEKKQRKRRVGRRGSKAPRGEBasic
153-177GTEVAKPKKKKKSSGKKRAAKKAAABasic
193-218EGAPKREPRAKKPRTPRPRRAPGEEPBasic
252-272VVSARIIRKRRKSQGYGFVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-130KDQEKKQRKRRVGRRGSKAPR
158-176KPKKKKKSSGKKRAAKKAA
194-215GAPKREPRAKKPRTPRPRRAPG
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.833, nucl 9.5, mito_nucl 7.666, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVSENGVPPATQDKVEEEVPGFKVFAGNLSYSTTDEGLRTFFAPVESEIVTAHVILRGTRSKGYGFVSLTSAEAAEKAVELLNKQELDGRSVIVEVAKPAGEKDQEKKQRKRRVGRRGSKAPRGEVTDAEASGEATEKAEGAVAEGTEVAKPKKKKKSSGKKRAAKKAAAALNGEAADGEATAEGEGAPKREPRAKKPRTPRPRRAPGEEPAGEPSKNMLFVANLGFSVDDEALATLFKEAGIEVVSARIIRKRRKSQGYGFVDVGNEDEQKKAIEALDGKDVGGRAIAVKVAVNTPPPAEETEGEKSENVPSTEAPVVETSVAGDATPEAVVLAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.2
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.2
16 0.16
17 0.17
18 0.15
19 0.17
20 0.15
21 0.13
22 0.14
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.18
27 0.16
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.13
51 0.17
52 0.19
53 0.21
54 0.22
55 0.21
56 0.25
57 0.27
58 0.28
59 0.24
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.21
64 0.17
65 0.14
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.1
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.18
80 0.17
81 0.2
82 0.2
83 0.18
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.1
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.11
95 0.13
96 0.16
97 0.2
98 0.3
99 0.4
100 0.5
101 0.6
102 0.66
103 0.73
104 0.8
105 0.87
106 0.87
107 0.88
108 0.89
109 0.89
110 0.89
111 0.9
112 0.88
113 0.86
114 0.79
115 0.71
116 0.63
117 0.58
118 0.5
119 0.39
120 0.35
121 0.27
122 0.23
123 0.2
124 0.17
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.07
143 0.07
144 0.13
145 0.18
146 0.27
147 0.37
148 0.44
149 0.53
150 0.63
151 0.74
152 0.8
153 0.86
154 0.88
155 0.86
156 0.89
157 0.89
158 0.84
159 0.75
160 0.66
161 0.62
162 0.55
163 0.49
164 0.4
165 0.29
166 0.24
167 0.22
168 0.19
169 0.11
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.02
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.19
186 0.23
187 0.32
188 0.43
189 0.51
190 0.58
191 0.68
192 0.76
193 0.81
194 0.88
195 0.88
196 0.88
197 0.9
198 0.87
199 0.84
200 0.79
201 0.72
202 0.71
203 0.61
204 0.51
205 0.44
206 0.41
207 0.33
208 0.27
209 0.24
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.1
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.13
244 0.2
245 0.29
246 0.39
247 0.49
248 0.59
249 0.68
250 0.75
251 0.79
252 0.82
253 0.8
254 0.74
255 0.65
256 0.56
257 0.47
258 0.38
259 0.31
260 0.22
261 0.16
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.13
270 0.16
271 0.17
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.22
276 0.21
277 0.17
278 0.14
279 0.12
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.22
297 0.27
298 0.28
299 0.28
300 0.27
301 0.26
302 0.28
303 0.31
304 0.26
305 0.22
306 0.2
307 0.24
308 0.26
309 0.25
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.07