Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NIR6

Protein Details
Accession A0A5C3NIR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-100SAPYSKSHVRRLKRKSREKIAGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-96VRRLKRKSREK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MPKERRQRVGAHAKSAKLAGGSPSTSGLEQTIIEDAAEPLINDVSASANVDEMQGNLTKKEKQYLKRELFLQRLEAGSAPYSKSHVRRLKRKSREKIAGGLDELHTAIASVEEAIPVAVKNSVQDTTQDESPSDPSVKVKPQLGQIGEGNAAPLSQAQRKKALRVEQIRHPLILSNPDYVSNPFEAIRKHAQNTLVKRQEAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.51
3 0.42
4 0.31
5 0.28
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.17
46 0.19
47 0.27
48 0.33
49 0.38
50 0.47
51 0.56
52 0.59
53 0.59
54 0.63
55 0.61
56 0.59
57 0.52
58 0.44
59 0.35
60 0.3
61 0.27
62 0.21
63 0.16
64 0.12
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.15
70 0.17
71 0.26
72 0.33
73 0.4
74 0.49
75 0.59
76 0.67
77 0.74
78 0.82
79 0.81
80 0.83
81 0.83
82 0.76
83 0.72
84 0.65
85 0.55
86 0.45
87 0.37
88 0.28
89 0.19
90 0.17
91 0.1
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.13
113 0.16
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.16
121 0.13
122 0.14
123 0.17
124 0.21
125 0.23
126 0.25
127 0.25
128 0.29
129 0.35
130 0.33
131 0.32
132 0.29
133 0.27
134 0.25
135 0.22
136 0.17
137 0.11
138 0.1
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.16
143 0.2
144 0.22
145 0.32
146 0.34
147 0.4
148 0.45
149 0.51
150 0.54
151 0.6
152 0.63
153 0.63
154 0.7
155 0.66
156 0.59
157 0.51
158 0.44
159 0.36
160 0.38
161 0.31
162 0.25
163 0.24
164 0.25
165 0.27
166 0.26
167 0.26
168 0.2
169 0.19
170 0.17
171 0.19
172 0.2
173 0.24
174 0.32
175 0.34
176 0.36
177 0.39
178 0.45
179 0.51
180 0.58
181 0.63
182 0.61