Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3N8F2

Protein Details
Accession A0A5C3N8F2    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-68QENEERTKQGKRPRKGHKQDLPKPTELBasic
177-198EAIRAEKKAQKKAEKEKARVELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-34KARKRD
38-38K
45-59EERTKQGKRPRKGHK
180-193RAEKKAQKKAEKEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MAEKTGAQGSKVPTADFRKKWDKEEYAEKARKRDQEEKERMQENEERTKQGKRPRKGHKQDLPKPTELMKQRETPLDLDKNLGKTMVVQNSSGRGPGVPGFYCEACKRTYKDSSAYLDHINGRAHLRALGQTTRIARSTVEQVRARIAYLREKTKEASSAKSFDFEQRLAQVREKEEAIRAEKKAQKKAEKEKARVELAQETAADDDMMKMMGFGGFGTSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.48
3 0.47
4 0.52
5 0.56
6 0.58
7 0.63
8 0.66
9 0.63
10 0.6
11 0.66
12 0.66
13 0.67
14 0.71
15 0.68
16 0.67
17 0.68
18 0.68
19 0.66
20 0.67
21 0.67
22 0.7
23 0.76
24 0.77
25 0.78
26 0.75
27 0.68
28 0.63
29 0.59
30 0.53
31 0.54
32 0.48
33 0.45
34 0.43
35 0.49
36 0.51
37 0.55
38 0.59
39 0.58
40 0.66
41 0.72
42 0.8
43 0.84
44 0.88
45 0.87
46 0.88
47 0.88
48 0.88
49 0.83
50 0.74
51 0.65
52 0.57
53 0.55
54 0.51
55 0.48
56 0.42
57 0.41
58 0.41
59 0.42
60 0.41
61 0.37
62 0.37
63 0.35
64 0.31
65 0.28
66 0.28
67 0.26
68 0.25
69 0.22
70 0.15
71 0.14
72 0.18
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.19
77 0.21
78 0.21
79 0.18
80 0.13
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.21
96 0.25
97 0.25
98 0.28
99 0.3
100 0.32
101 0.31
102 0.31
103 0.26
104 0.23
105 0.22
106 0.21
107 0.17
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.16
123 0.14
124 0.15
125 0.22
126 0.23
127 0.29
128 0.29
129 0.29
130 0.32
131 0.31
132 0.3
133 0.25
134 0.23
135 0.25
136 0.28
137 0.34
138 0.33
139 0.35
140 0.37
141 0.35
142 0.4
143 0.34
144 0.35
145 0.32
146 0.34
147 0.32
148 0.32
149 0.31
150 0.29
151 0.3
152 0.24
153 0.23
154 0.24
155 0.29
156 0.3
157 0.33
158 0.33
159 0.31
160 0.33
161 0.33
162 0.3
163 0.28
164 0.31
165 0.32
166 0.33
167 0.33
168 0.39
169 0.44
170 0.5
171 0.55
172 0.59
173 0.62
174 0.67
175 0.76
176 0.78
177 0.82
178 0.81
179 0.81
180 0.79
181 0.75
182 0.67
183 0.59
184 0.54
185 0.46
186 0.42
187 0.33
188 0.26
189 0.22
190 0.2
191 0.17
192 0.11
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.08