Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NGD8

Protein Details
Accession A0A5C3NGD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-487LDSSEPRKREKRSRPAKSQLKSKTATLNSSREKTRKPRAARDHKPSNQKENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-481RKRPASPEPALDSSEPRKREKRSRPAKSQLKSKTATLNSSREKTRKPRAARDHKP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027329  TPX2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005856  C:cytoskeleton  
Pfam View protein in Pfam  
PF06886  TPX2  
Amino Acid Sequences MPELFSSRERCQFASSFVYWRARPSGLLHAANWETKYCGFAGEDRPGPNEYTVTWTQRVALQSHGRGCSLRPLASPTTSIVCSSQQESCILSIKHITAQASNRHNFQIMPPHSIAELSLRHLPDLSLSHLPDVSDNSFQIPAAASTDYLLAEPSNDFLADEDTIDTSAVPTGTLDDIHLRESTSRPNTHETANSAPEEKLTIHMVSRPSKTKSKAKPMEVREASTSAPHLATKAESGIRPDKNTSPTGQAHPRVDRPVKKADGDKLGPTRGSTVGHSGVREGSSTSGRGDSPVARTTNPAARALDVPDASLPEKGASQDVKVERESVLPAQRQTESANRELLDLSLADVTMDAAIGGAAGRLLMYSQSVMPVTRIGAQSTVSTAAHVPTTTTSPITRDDPLTLTEPSPRKEEAGSPQEPISPMRLSRKRPASPEPALDSSEPRKREKRSRPAKSQLKSKTATLNSSREKTRKPRAARDHKPSNQKENLSASGSRKEVGNEPYQVRRSARQLDKQARKENDCQTSGSGLGLLPIADRPNNLPPASKPTRPIEFHFKSELRLDVRKAQHEENPKSTLKRSASRYVNPIPDFKAGQATLAARRERPTRLVPVPFEFSTTIRAREREKFEEGRRAREQELQRQMEERRRVKEMEEEKEIQELRRRAVPKANPVPDWYADAPKKKGGSVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.37
4 0.4
5 0.45
6 0.4
7 0.43
8 0.43
9 0.36
10 0.36
11 0.35
12 0.39
13 0.4
14 0.42
15 0.38
16 0.4
17 0.41
18 0.42
19 0.39
20 0.3
21 0.25
22 0.23
23 0.24
24 0.18
25 0.17
26 0.15
27 0.2
28 0.25
29 0.29
30 0.34
31 0.33
32 0.36
33 0.36
34 0.36
35 0.32
36 0.27
37 0.21
38 0.23
39 0.27
40 0.29
41 0.29
42 0.28
43 0.28
44 0.31
45 0.33
46 0.27
47 0.3
48 0.32
49 0.36
50 0.42
51 0.42
52 0.4
53 0.37
54 0.37
55 0.39
56 0.36
57 0.32
58 0.28
59 0.32
60 0.34
61 0.35
62 0.36
63 0.28
64 0.28
65 0.26
66 0.26
67 0.21
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.25
77 0.23
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.23
85 0.29
86 0.36
87 0.41
88 0.42
89 0.42
90 0.41
91 0.41
92 0.36
93 0.34
94 0.37
95 0.31
96 0.35
97 0.33
98 0.32
99 0.31
100 0.3
101 0.26
102 0.21
103 0.19
104 0.16
105 0.21
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.18
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.19
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.12
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.15
169 0.23
170 0.26
171 0.29
172 0.3
173 0.36
174 0.37
175 0.38
176 0.39
177 0.35
178 0.33
179 0.33
180 0.31
181 0.27
182 0.25
183 0.22
184 0.21
185 0.17
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.16
191 0.2
192 0.24
193 0.28
194 0.31
195 0.34
196 0.4
197 0.46
198 0.53
199 0.57
200 0.63
201 0.67
202 0.71
203 0.75
204 0.73
205 0.77
206 0.69
207 0.63
208 0.54
209 0.47
210 0.38
211 0.3
212 0.26
213 0.16
214 0.15
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.17
224 0.24
225 0.25
226 0.27
227 0.29
228 0.31
229 0.33
230 0.35
231 0.32
232 0.3
233 0.31
234 0.35
235 0.38
236 0.39
237 0.4
238 0.41
239 0.43
240 0.44
241 0.48
242 0.49
243 0.46
244 0.49
245 0.48
246 0.47
247 0.48
248 0.46
249 0.46
250 0.42
251 0.42
252 0.37
253 0.36
254 0.33
255 0.29
256 0.26
257 0.2
258 0.19
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.18
263 0.18
264 0.16
265 0.16
266 0.15
267 0.14
268 0.11
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.17
280 0.18
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.23
285 0.23
286 0.22
287 0.18
288 0.18
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.14
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.14
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.19
321 0.22
322 0.2
323 0.2
324 0.22
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.17
329 0.12
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.03
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.13
382 0.15
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.18
389 0.16
390 0.15
391 0.2
392 0.22
393 0.22
394 0.24
395 0.23
396 0.21
397 0.21
398 0.25
399 0.26
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.29
404 0.29
405 0.29
406 0.26
407 0.21
408 0.15
409 0.16
410 0.25
411 0.3
412 0.34
413 0.42
414 0.5
415 0.51
416 0.55
417 0.6
418 0.59
419 0.57
420 0.56
421 0.53
422 0.45
423 0.43
424 0.38
425 0.35
426 0.33
427 0.34
428 0.33
429 0.33
430 0.38
431 0.44
432 0.54
433 0.61
434 0.66
435 0.71
436 0.78
437 0.83
438 0.87
439 0.89
440 0.84
441 0.83
442 0.8
443 0.77
444 0.69
445 0.61
446 0.59
447 0.52
448 0.52
449 0.48
450 0.48
451 0.46
452 0.49
453 0.52
454 0.48
455 0.53
456 0.56
457 0.61
458 0.62
459 0.64
460 0.7
461 0.76
462 0.82
463 0.84
464 0.85
465 0.85
466 0.83
467 0.86
468 0.82
469 0.8
470 0.76
471 0.68
472 0.63
473 0.57
474 0.53
475 0.45
476 0.43
477 0.37
478 0.34
479 0.33
480 0.29
481 0.25
482 0.24
483 0.25
484 0.26
485 0.28
486 0.29
487 0.31
488 0.38
489 0.39
490 0.41
491 0.38
492 0.38
493 0.39
494 0.44
495 0.49
496 0.5
497 0.58
498 0.65
499 0.73
500 0.77
501 0.8
502 0.76
503 0.74
504 0.74
505 0.72
506 0.69
507 0.6
508 0.53
509 0.46
510 0.41
511 0.35
512 0.28
513 0.19
514 0.12
515 0.1
516 0.09
517 0.07
518 0.06
519 0.07
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.13
524 0.19
525 0.23
526 0.24
527 0.25
528 0.25
529 0.34
530 0.4
531 0.39
532 0.39
533 0.4
534 0.48
535 0.49
536 0.52
537 0.54
538 0.52
539 0.53
540 0.55
541 0.49
542 0.44
543 0.43
544 0.43
545 0.38
546 0.38
547 0.37
548 0.39
549 0.43
550 0.48
551 0.5
552 0.48
553 0.5
554 0.56
555 0.59
556 0.55
557 0.56
558 0.52
559 0.51
560 0.5
561 0.52
562 0.48
563 0.49
564 0.5
565 0.54
566 0.58
567 0.6
568 0.65
569 0.64
570 0.66
571 0.61
572 0.57
573 0.52
574 0.48
575 0.43
576 0.36
577 0.36
578 0.27
579 0.25
580 0.25
581 0.24
582 0.26
583 0.32
584 0.33
585 0.29
586 0.34
587 0.38
588 0.39
589 0.42
590 0.42
591 0.45
592 0.5
593 0.54
594 0.54
595 0.54
596 0.56
597 0.5
598 0.46
599 0.39
600 0.33
601 0.33
602 0.32
603 0.32
604 0.31
605 0.34
606 0.37
607 0.44
608 0.51
609 0.5
610 0.55
611 0.58
612 0.6
613 0.68
614 0.65
615 0.65
616 0.64
617 0.63
618 0.58
619 0.58
620 0.59
621 0.59
622 0.66
623 0.61
624 0.56
625 0.57
626 0.61
627 0.61
628 0.64
629 0.6
630 0.56
631 0.56
632 0.56
633 0.53
634 0.57
635 0.56
636 0.54
637 0.54
638 0.52
639 0.48
640 0.53
641 0.52
642 0.46
643 0.46
644 0.42
645 0.38
646 0.43
647 0.44
648 0.43
649 0.51
650 0.55
651 0.57
652 0.64
653 0.67
654 0.61
655 0.63
656 0.63
657 0.55
658 0.53
659 0.45
660 0.45
661 0.45
662 0.5
663 0.49
664 0.5
665 0.5
666 0.48