Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3NBV1

Protein Details
Accession A0A5C3NBV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-62SKEKSKAKPVAAAKKRKREEEEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-74KEKSKAKPVAAAKKRKREEEEGAVPRRQSTRLRR
87-114RRKEEEERRRKEEEERLEAEERAREARR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.333, cyto 11, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPKTAYELEREANIAKNKALLEELDLKGAVADLGLPSFVSKEKSKAKPVAAAKKRKREEEEGAVPRRQSTRLRRGAVVDPDETPEERRKEEEERRRKEEEERLEAEERAREARRPRHQDLDLGTLLDGEEPEELAALEATLQEVTKTSYVKRVAAQDAFLFGKDEGEEEERELADLKKRMQKMKVVARAKVTQDRVYSATYHPEVRKDIILFGDKHGQLGIWDARAARDEDEESEGDNAGDGRYWRMQVHWPATSKSSISTVKLDPLDSNNVYTSAYDCTIRRLDLPTGVSQEVHAAEGALISSIDLPPTGHEMWVSDALGGVSHLDLREAPSRARWYGLSDTKIGCVSANPANPHYLLTASNSRALRLWDARKLQRAGGALLTPPPSSPVSSRRGADAASPEEHGAEEVETFVKSKAGKGCLRAEWVHGKSVSSAYWDPRGRSIVSTSYDDTLRIWDIRPSVLDKSTTLPSFRPFTQIRHNCQTGKWLTILKAQWTPNPDVYPHFTIGNMDHSLNIYSCKGDLVAKLSDRQKISAVQAVTCSHPSIVERAASGNASGRCVLWALPERSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.3
4 0.29
5 0.28
6 0.28
7 0.21
8 0.21
9 0.27
10 0.27
11 0.25
12 0.25
13 0.23
14 0.21
15 0.21
16 0.15
17 0.06
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.13
27 0.15
28 0.23
29 0.33
30 0.41
31 0.49
32 0.55
33 0.57
34 0.62
35 0.69
36 0.72
37 0.72
38 0.76
39 0.77
40 0.81
41 0.83
42 0.84
43 0.81
44 0.79
45 0.77
46 0.76
47 0.76
48 0.75
49 0.74
50 0.68
51 0.61
52 0.57
53 0.51
54 0.46
55 0.46
56 0.47
57 0.52
58 0.58
59 0.62
60 0.61
61 0.63
62 0.65
63 0.64
64 0.57
65 0.48
66 0.4
67 0.38
68 0.38
69 0.34
70 0.3
71 0.3
72 0.29
73 0.29
74 0.31
75 0.33
76 0.4
77 0.5
78 0.57
79 0.6
80 0.65
81 0.7
82 0.72
83 0.7
84 0.69
85 0.67
86 0.65
87 0.63
88 0.57
89 0.56
90 0.54
91 0.52
92 0.46
93 0.39
94 0.31
95 0.29
96 0.27
97 0.28
98 0.34
99 0.43
100 0.52
101 0.58
102 0.62
103 0.65
104 0.65
105 0.66
106 0.61
107 0.57
108 0.47
109 0.39
110 0.33
111 0.24
112 0.22
113 0.16
114 0.12
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.07
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.19
136 0.21
137 0.23
138 0.26
139 0.3
140 0.33
141 0.33
142 0.33
143 0.26
144 0.27
145 0.25
146 0.22
147 0.18
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.15
162 0.18
163 0.22
164 0.28
165 0.33
166 0.39
167 0.42
168 0.47
169 0.5
170 0.57
171 0.61
172 0.59
173 0.57
174 0.56
175 0.57
176 0.55
177 0.53
178 0.47
179 0.41
180 0.38
181 0.37
182 0.34
183 0.31
184 0.29
185 0.22
186 0.24
187 0.21
188 0.26
189 0.24
190 0.25
191 0.26
192 0.25
193 0.27
194 0.22
195 0.22
196 0.19
197 0.22
198 0.2
199 0.2
200 0.26
201 0.23
202 0.22
203 0.21
204 0.18
205 0.14
206 0.17
207 0.16
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.17
235 0.21
236 0.25
237 0.27
238 0.27
239 0.27
240 0.29
241 0.28
242 0.23
243 0.19
244 0.19
245 0.17
246 0.17
247 0.19
248 0.18
249 0.2
250 0.21
251 0.2
252 0.17
253 0.17
254 0.2
255 0.17
256 0.17
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.15
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.13
279 0.14
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.07
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.16
320 0.2
321 0.2
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.25
326 0.29
327 0.27
328 0.26
329 0.26
330 0.26
331 0.26
332 0.21
333 0.14
334 0.1
335 0.12
336 0.14
337 0.17
338 0.17
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.2
343 0.17
344 0.13
345 0.11
346 0.13
347 0.17
348 0.16
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.23
355 0.25
356 0.28
357 0.29
358 0.36
359 0.4
360 0.46
361 0.46
362 0.42
363 0.39
364 0.37
365 0.31
366 0.26
367 0.22
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.14
372 0.12
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.2
378 0.24
379 0.27
380 0.28
381 0.28
382 0.28
383 0.27
384 0.26
385 0.24
386 0.23
387 0.2
388 0.21
389 0.19
390 0.18
391 0.17
392 0.15
393 0.1
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.09
402 0.09
403 0.14
404 0.19
405 0.25
406 0.28
407 0.32
408 0.38
409 0.38
410 0.42
411 0.39
412 0.38
413 0.4
414 0.38
415 0.38
416 0.33
417 0.31
418 0.27
419 0.28
420 0.24
421 0.2
422 0.2
423 0.19
424 0.27
425 0.29
426 0.29
427 0.31
428 0.34
429 0.3
430 0.3
431 0.3
432 0.27
433 0.28
434 0.3
435 0.28
436 0.27
437 0.26
438 0.25
439 0.22
440 0.19
441 0.18
442 0.15
443 0.15
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.19
448 0.21
449 0.22
450 0.23
451 0.24
452 0.21
453 0.24
454 0.28
455 0.28
456 0.26
457 0.25
458 0.27
459 0.3
460 0.3
461 0.34
462 0.3
463 0.34
464 0.43
465 0.5
466 0.54
467 0.58
468 0.62
469 0.56
470 0.55
471 0.59
472 0.51
473 0.45
474 0.4
475 0.35
476 0.32
477 0.37
478 0.38
479 0.34
480 0.38
481 0.37
482 0.38
483 0.4
484 0.43
485 0.4
486 0.4
487 0.37
488 0.35
489 0.39
490 0.39
491 0.36
492 0.31
493 0.26
494 0.26
495 0.26
496 0.27
497 0.23
498 0.19
499 0.18
500 0.18
501 0.2
502 0.18
503 0.19
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.16
511 0.18
512 0.22
513 0.24
514 0.31
515 0.35
516 0.4
517 0.39
518 0.39
519 0.38
520 0.37
521 0.39
522 0.38
523 0.34
524 0.29
525 0.31
526 0.31
527 0.31
528 0.29
529 0.26
530 0.2
531 0.2
532 0.21
533 0.21
534 0.22
535 0.2
536 0.19
537 0.2
538 0.21
539 0.2
540 0.19
541 0.22
542 0.2
543 0.21
544 0.21
545 0.19
546 0.18
547 0.18
548 0.18
549 0.19
550 0.27