Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MKA8

Protein Details
Accession A0A5C3MKA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-71ELHEYRGRKRKEFEERIRRTRGNIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-60RKRKEF
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.833, nucl 9.5, cyto_mito 8.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MQDERAPRVKNRAPAAIQITAEQILREAQERQESQFRAPKQRIEDFEELHEYRGRKRKEFEERIRRTRGNIKEWLQYANWEASQNEFARSRSVFERALDVDPRSVQLWLSYTEMELKARNVQHARNLFDRAVTLLPRIDQLWYKYVYLEELLQNIPGARQVFERWMQWEPDDKAWQAYIKMEERYDELDRASAIYERWVAVRPEPRVWVKWGKFEEERGKLDKAREVFQTALEFFGDDSEQVEKAQAVFGAFARMETRLKEYERARVIYKFALERLPRSKSNSLYAAYTKFEKQHGNRTTLESTVLGKRRIQYEEELAHDGRNYDVWFDYARLEEGALKDLREDGATPDEEEKATGRVREVYERAVAQVPPGMEKRHWRRYIFLWLDYALFEEIETKDYERTRQIYQTALSLVPHKQFTFAKLWLMFAKFELRRLNLGAARKTLGTAIGMCPKEALFKGYIQLELDLREFDRVRTLYEKYLEYDPTNSAAWIKFAELETQLEDFARTRAIFELGVSQSPLSMPELLWKAYIDFEIEEGEREKARALFERLVALSGHVKVWLSYATFEAEPIPVPRAQREEEEDEEEEAEVPMMPGDPALARSVYERGYRDQKAKGLKDERFALLKHWKEFEENQGSPSDVAKVQAMMPIATKKRRMDNETGQMEEVWEMVFPDDEREANPTSFKFLQRAHAWKMQQAKQGGGGPAKAAPAPEPAASSGDVTMADGDDAAEELSSSDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.55
4 0.49
5 0.42
6 0.39
7 0.31
8 0.29
9 0.21
10 0.16
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.18
16 0.27
17 0.29
18 0.33
19 0.4
20 0.41
21 0.45
22 0.5
23 0.53
24 0.55
25 0.59
26 0.6
27 0.6
28 0.66
29 0.64
30 0.64
31 0.64
32 0.55
33 0.55
34 0.56
35 0.49
36 0.43
37 0.42
38 0.36
39 0.39
40 0.46
41 0.47
42 0.46
43 0.52
44 0.6
45 0.67
46 0.76
47 0.78
48 0.8
49 0.84
50 0.86
51 0.88
52 0.8
53 0.75
54 0.74
55 0.72
56 0.68
57 0.67
58 0.62
59 0.61
60 0.61
61 0.58
62 0.49
63 0.43
64 0.38
65 0.33
66 0.3
67 0.25
68 0.23
69 0.23
70 0.28
71 0.26
72 0.27
73 0.25
74 0.24
75 0.27
76 0.28
77 0.28
78 0.26
79 0.29
80 0.28
81 0.26
82 0.31
83 0.29
84 0.32
85 0.32
86 0.3
87 0.28
88 0.26
89 0.27
90 0.23
91 0.2
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.18
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.23
105 0.25
106 0.32
107 0.32
108 0.34
109 0.41
110 0.46
111 0.48
112 0.45
113 0.47
114 0.4
115 0.36
116 0.33
117 0.27
118 0.24
119 0.2
120 0.18
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.22
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.18
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.31
156 0.3
157 0.33
158 0.34
159 0.32
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.22
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.26
172 0.26
173 0.22
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.11
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.15
187 0.2
188 0.26
189 0.27
190 0.29
191 0.34
192 0.36
193 0.35
194 0.4
195 0.44
196 0.4
197 0.45
198 0.44
199 0.45
200 0.43
201 0.48
202 0.51
203 0.47
204 0.48
205 0.44
206 0.45
207 0.42
208 0.43
209 0.4
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.28
214 0.26
215 0.24
216 0.25
217 0.2
218 0.18
219 0.15
220 0.13
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.15
245 0.16
246 0.18
247 0.25
248 0.26
249 0.32
250 0.35
251 0.36
252 0.35
253 0.33
254 0.33
255 0.29
256 0.29
257 0.23
258 0.2
259 0.24
260 0.23
261 0.26
262 0.3
263 0.33
264 0.33
265 0.38
266 0.42
267 0.37
268 0.41
269 0.39
270 0.35
271 0.32
272 0.32
273 0.27
274 0.24
275 0.24
276 0.21
277 0.2
278 0.22
279 0.27
280 0.27
281 0.36
282 0.39
283 0.41
284 0.41
285 0.43
286 0.41
287 0.34
288 0.32
289 0.23
290 0.21
291 0.23
292 0.25
293 0.22
294 0.23
295 0.25
296 0.27
297 0.29
298 0.28
299 0.25
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.28
304 0.24
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.12
345 0.14
346 0.17
347 0.18
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.11
355 0.12
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.21
362 0.29
363 0.37
364 0.42
365 0.41
366 0.43
367 0.46
368 0.55
369 0.49
370 0.41
371 0.32
372 0.28
373 0.27
374 0.24
375 0.21
376 0.1
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.11
386 0.14
387 0.15
388 0.18
389 0.19
390 0.22
391 0.22
392 0.21
393 0.21
394 0.21
395 0.19
396 0.16
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.14
403 0.16
404 0.16
405 0.19
406 0.21
407 0.2
408 0.21
409 0.2
410 0.22
411 0.21
412 0.21
413 0.18
414 0.14
415 0.21
416 0.17
417 0.21
418 0.23
419 0.22
420 0.23
421 0.24
422 0.26
423 0.22
424 0.27
425 0.25
426 0.23
427 0.22
428 0.21
429 0.2
430 0.16
431 0.13
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.15
439 0.15
440 0.17
441 0.16
442 0.16
443 0.1
444 0.11
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.13
449 0.14
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.1
454 0.09
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.16
459 0.15
460 0.17
461 0.2
462 0.22
463 0.22
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.25
468 0.25
469 0.22
470 0.22
471 0.19
472 0.19
473 0.18
474 0.15
475 0.14
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.12
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.16
500 0.14
501 0.15
502 0.14
503 0.13
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.12
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.1
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.13
529 0.13
530 0.15
531 0.19
532 0.22
533 0.24
534 0.24
535 0.27
536 0.26
537 0.25
538 0.22
539 0.19
540 0.16
541 0.14
542 0.14
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.11
547 0.11
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.13
559 0.13
560 0.14
561 0.17
562 0.21
563 0.23
564 0.25
565 0.3
566 0.33
567 0.34
568 0.37
569 0.35
570 0.32
571 0.3
572 0.26
573 0.21
574 0.15
575 0.12
576 0.07
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.04
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.1
589 0.13
590 0.15
591 0.19
592 0.21
593 0.25
594 0.33
595 0.38
596 0.41
597 0.43
598 0.46
599 0.51
600 0.54
601 0.58
602 0.59
603 0.58
604 0.58
605 0.58
606 0.55
607 0.49
608 0.45
609 0.42
610 0.42
611 0.44
612 0.42
613 0.41
614 0.39
615 0.41
616 0.43
617 0.46
618 0.46
619 0.41
620 0.39
621 0.37
622 0.36
623 0.32
624 0.3
625 0.23
626 0.14
627 0.15
628 0.14
629 0.14
630 0.14
631 0.15
632 0.15
633 0.13
634 0.15
635 0.21
636 0.27
637 0.32
638 0.38
639 0.41
640 0.49
641 0.57
642 0.62
643 0.64
644 0.67
645 0.71
646 0.69
647 0.66
648 0.58
649 0.49
650 0.43
651 0.33
652 0.23
653 0.13
654 0.09
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.13
663 0.16
664 0.19
665 0.19
666 0.22
667 0.2
668 0.25
669 0.29
670 0.31
671 0.33
672 0.33
673 0.4
674 0.45
675 0.52
676 0.52
677 0.55
678 0.54
679 0.54
680 0.6
681 0.58
682 0.57
683 0.53
684 0.48
685 0.45
686 0.49
687 0.48
688 0.42
689 0.35
690 0.3
691 0.29
692 0.28
693 0.24
694 0.19
695 0.16
696 0.18
697 0.2
698 0.19
699 0.2
700 0.2
701 0.21
702 0.21
703 0.2
704 0.16
705 0.14
706 0.13
707 0.12
708 0.11
709 0.09
710 0.08
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.05
717 0.05
718 0.05