Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q7P7

Protein Details
Accession A0A5C3Q7P7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24PDGGGKGKKSHHPNPPAFRSEBasic
258-277RLPFHRTKHLRNPWNHDREVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-335GGGGRRRRGR
Subcellular Location(s) mito 8, cyto 8, cyto_mito 8, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MRTPDGGGKGKKSHHPNPPAFRSEWVMWVGNVPSDSTHDELWQFFTRPEEVADQNDRGEGTSGGKPGAGIFLISRSSCAFVNLASEEQLDAAIFSFNGLSLRPHDPRVPKLVCRVRRREDDMRAGVGGQRGIGLHAKWLKEQQAMTRQDAAEPQRPRTISATSDTTTDDTNSSFLERYFPKRYFILKSLTQYDLDLSVTKGLWATQKHNEGVLDKAFRTSHDVYLIFGVNKSGEFYGCARPAGEWGESFRIEWIKTERLPFHRTKHLRNPWNHDREVKVSRDGTELEPTVGEALLREWDRFSAEVAGKQPAADGEGPSEGGGGGGGGGGRRRRGRGTND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.73
3 0.77
4 0.8
5 0.82
6 0.79
7 0.71
8 0.65
9 0.61
10 0.52
11 0.46
12 0.4
13 0.33
14 0.27
15 0.28
16 0.26
17 0.21
18 0.19
19 0.16
20 0.13
21 0.15
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.19
27 0.19
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.21
32 0.23
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.22
37 0.21
38 0.26
39 0.29
40 0.28
41 0.26
42 0.27
43 0.24
44 0.2
45 0.2
46 0.15
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.14
55 0.1
56 0.07
57 0.06
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.1
88 0.16
89 0.17
90 0.2
91 0.26
92 0.3
93 0.33
94 0.41
95 0.41
96 0.38
97 0.47
98 0.53
99 0.56
100 0.61
101 0.66
102 0.65
103 0.69
104 0.74
105 0.72
106 0.7
107 0.69
108 0.62
109 0.55
110 0.48
111 0.4
112 0.34
113 0.27
114 0.2
115 0.11
116 0.09
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.08
121 0.11
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.24
130 0.3
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.31
135 0.29
136 0.32
137 0.31
138 0.29
139 0.28
140 0.28
141 0.29
142 0.29
143 0.3
144 0.29
145 0.26
146 0.2
147 0.21
148 0.22
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.11
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.1
163 0.12
164 0.18
165 0.23
166 0.24
167 0.25
168 0.28
169 0.31
170 0.31
171 0.33
172 0.32
173 0.29
174 0.31
175 0.33
176 0.32
177 0.28
178 0.24
179 0.21
180 0.17
181 0.14
182 0.12
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.11
190 0.12
191 0.16
192 0.21
193 0.26
194 0.26
195 0.27
196 0.27
197 0.24
198 0.24
199 0.24
200 0.2
201 0.16
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.2
211 0.22
212 0.23
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.11
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.18
229 0.19
230 0.18
231 0.12
232 0.14
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.19
240 0.21
241 0.23
242 0.25
243 0.3
244 0.34
245 0.38
246 0.44
247 0.47
248 0.48
249 0.54
250 0.58
251 0.61
252 0.66
253 0.71
254 0.74
255 0.76
256 0.79
257 0.79
258 0.81
259 0.75
260 0.69
261 0.63
262 0.61
263 0.6
264 0.53
265 0.49
266 0.43
267 0.41
268 0.39
269 0.37
270 0.32
271 0.31
272 0.28
273 0.23
274 0.2
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.12
279 0.07
280 0.07
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.17
287 0.17
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.24
292 0.25
293 0.28
294 0.26
295 0.25
296 0.24
297 0.17
298 0.19
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.1
315 0.14
316 0.21
317 0.26
318 0.31
319 0.38