Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q0X0

Protein Details
Accession A0A5C3Q0X0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-85FSSSTKPKKHIPRPPNAFILHydrophilic
158-178KAQRNGKKRGKTSRGRRRGARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-181AQRNGKKRGKTSRGRRRGARVKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.333, cyto 6.5, cyto_mito 5.666, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSYSPPPNATHSWTAAERAGLPDSLVAPSSTLMASSSGMTFGVAGPSTLTENKESDAAATELPTDFSSSTKPKKHIPRPPNAFILSKKAHGLTPVAAGLAWRSELAAVHLKYETLAAEALAQHKLDHPNYVYRPQKRAKIEKKAKIDDGENTLFTDAKAQRNGKKRGKTSRGRRRGARVKKVIDEPTPSVSPSIAPSSIFASSSRTFSPPADVLTPATSISSIPDTASPVPFNEWAGPAQDDFVSPSPPSGPFTYQAPFPQHVGAAADFNSEYFNPVLPVAFDFMGSASDPNQTWGYNVEQMVSSGNVSLYPDSHYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.3
4 0.26
5 0.23
6 0.23
7 0.18
8 0.17
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.11
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.09
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.09
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.15
55 0.21
56 0.29
57 0.35
58 0.38
59 0.45
60 0.56
61 0.65
62 0.71
63 0.73
64 0.76
65 0.78
66 0.8
67 0.77
68 0.69
69 0.63
70 0.54
71 0.53
72 0.44
73 0.37
74 0.34
75 0.29
76 0.26
77 0.24
78 0.24
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.08
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.11
111 0.16
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.23
116 0.25
117 0.33
118 0.37
119 0.38
120 0.44
121 0.46
122 0.52
123 0.53
124 0.62
125 0.63
126 0.67
127 0.72
128 0.73
129 0.77
130 0.74
131 0.69
132 0.61
133 0.53
134 0.45
135 0.4
136 0.33
137 0.25
138 0.21
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.18
143 0.15
144 0.17
145 0.22
146 0.25
147 0.31
148 0.4
149 0.5
150 0.51
151 0.56
152 0.6
153 0.66
154 0.72
155 0.76
156 0.78
157 0.79
158 0.82
159 0.81
160 0.78
161 0.78
162 0.79
163 0.8
164 0.78
165 0.75
166 0.69
167 0.68
168 0.68
169 0.62
170 0.55
171 0.49
172 0.4
173 0.36
174 0.33
175 0.28
176 0.23
177 0.18
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.1
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.21
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.12
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.12
226 0.13
227 0.12
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.21
241 0.22
242 0.23
243 0.26
244 0.28
245 0.27
246 0.27
247 0.26
248 0.23
249 0.22
250 0.22
251 0.18
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.17
283 0.2
284 0.22
285 0.22
286 0.2
287 0.19
288 0.19
289 0.21
290 0.19
291 0.15
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.11