Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q542

Protein Details
Accession A0A5C3Q542    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
568-595RLYVEPGKSRKGRGRRKRWMMYGLPYHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
574-585GKSRKGRGRRKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00989  PAS  
PF13426  PAS_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
Amino Acid Sequences MISSDNWDRDQSSLGSNNTNATTASSSSSSSFSSSFPLSSIAPSNTTTNLSSRNNNLGDQSRLLPLPPQPGLPARMSNYDDPPPNTFAHPPPPPPTGNMNAIRSLSDSNIVVTQPSPSLSLPLYSATGFDLLSILARVAIRPRPQIRLGPIDMSTSFTVVDVRKPDCPIIYCSPSFCTLTGFTEEEVVGRNCRFLQSPQANTKKGEKRLYTNDEEVAKIRRASAVGKEVQANLINYKKNGEAFVNHVTVIPITGGRREGIAGNLGGGSVLGDGEDEIVYSIGFQVDLNAQPAEIMRRLERGTYKPKDAVEVTISLAEINALRISAGLPIAGAASVARPVAADHPSSMMGGTSAGGGVGSGLSSAARKGHSMSNDSISKPFRTLLLSDTAFLLSFPPPTAVSPLPPPSSSSSLTPQEIASRDRDCNASHTISSVLLSALPDTLLVLTLKGGFAFVSRVIATMLGWTPEELVGRSVGDLCHPADLVPLLRELKDSATTTSNHPASSSSGSSSNNNSNSNSNSNSNSNSNSNSNDDSTPESTDHAQPRTVDLLFRARTKAGAYVWMECRGRLYVEPGKSRKGRGRRKRWMMYGLPYHGLGRSSLSALQTRCAPCWGTTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.31
4 0.33
5 0.3
6 0.29
7 0.23
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.19
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.19
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.18
25 0.16
26 0.18
27 0.22
28 0.2
29 0.21
30 0.22
31 0.24
32 0.23
33 0.25
34 0.24
35 0.22
36 0.28
37 0.3
38 0.34
39 0.36
40 0.42
41 0.41
42 0.41
43 0.43
44 0.4
45 0.4
46 0.37
47 0.35
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.26
52 0.25
53 0.29
54 0.27
55 0.26
56 0.26
57 0.3
58 0.33
59 0.32
60 0.33
61 0.29
62 0.34
63 0.37
64 0.38
65 0.38
66 0.41
67 0.43
68 0.41
69 0.42
70 0.39
71 0.37
72 0.36
73 0.35
74 0.33
75 0.37
76 0.39
77 0.4
78 0.42
79 0.45
80 0.44
81 0.43
82 0.45
83 0.41
84 0.44
85 0.45
86 0.42
87 0.4
88 0.4
89 0.36
90 0.32
91 0.28
92 0.21
93 0.18
94 0.15
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.11
126 0.17
127 0.21
128 0.29
129 0.33
130 0.37
131 0.41
132 0.45
133 0.46
134 0.48
135 0.46
136 0.4
137 0.37
138 0.34
139 0.31
140 0.29
141 0.24
142 0.17
143 0.15
144 0.12
145 0.14
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.19
150 0.22
151 0.24
152 0.25
153 0.24
154 0.26
155 0.28
156 0.3
157 0.33
158 0.31
159 0.3
160 0.31
161 0.31
162 0.3
163 0.24
164 0.2
165 0.16
166 0.18
167 0.2
168 0.18
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.13
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.23
183 0.28
184 0.35
185 0.43
186 0.5
187 0.51
188 0.51
189 0.59
190 0.57
191 0.58
192 0.59
193 0.53
194 0.53
195 0.6
196 0.64
197 0.6
198 0.54
199 0.5
200 0.43
201 0.41
202 0.35
203 0.3
204 0.25
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.21
212 0.21
213 0.23
214 0.23
215 0.22
216 0.23
217 0.23
218 0.2
219 0.17
220 0.19
221 0.19
222 0.18
223 0.2
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.17
228 0.14
229 0.17
230 0.21
231 0.2
232 0.19
233 0.18
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.04
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.14
286 0.17
287 0.21
288 0.29
289 0.31
290 0.33
291 0.34
292 0.34
293 0.34
294 0.32
295 0.28
296 0.2
297 0.17
298 0.15
299 0.12
300 0.12
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.02
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.07
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.03
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.13
356 0.15
357 0.19
358 0.2
359 0.24
360 0.26
361 0.26
362 0.28
363 0.27
364 0.25
365 0.22
366 0.21
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.18
372 0.18
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.13
386 0.12
387 0.13
388 0.17
389 0.21
390 0.22
391 0.21
392 0.23
393 0.23
394 0.27
395 0.26
396 0.25
397 0.26
398 0.27
399 0.28
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.23
404 0.23
405 0.21
406 0.21
407 0.22
408 0.22
409 0.24
410 0.21
411 0.23
412 0.25
413 0.23
414 0.2
415 0.2
416 0.19
417 0.17
418 0.17
419 0.13
420 0.09
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.06
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.1
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.18
479 0.19
480 0.18
481 0.2
482 0.21
483 0.24
484 0.31
485 0.31
486 0.26
487 0.25
488 0.24
489 0.25
490 0.27
491 0.25
492 0.19
493 0.21
494 0.23
495 0.25
496 0.29
497 0.33
498 0.33
499 0.34
500 0.34
501 0.34
502 0.37
503 0.39
504 0.37
505 0.33
506 0.33
507 0.34
508 0.36
509 0.35
510 0.35
511 0.33
512 0.33
513 0.33
514 0.32
515 0.33
516 0.32
517 0.32
518 0.29
519 0.28
520 0.29
521 0.27
522 0.27
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.29
527 0.34
528 0.31
529 0.32
530 0.3
531 0.33
532 0.35
533 0.32
534 0.26
535 0.24
536 0.3
537 0.31
538 0.33
539 0.32
540 0.29
541 0.29
542 0.3
543 0.31
544 0.23
545 0.28
546 0.27
547 0.31
548 0.34
549 0.4
550 0.39
551 0.34
552 0.36
553 0.3
554 0.3
555 0.25
556 0.29
557 0.29
558 0.37
559 0.46
560 0.47
561 0.55
562 0.57
563 0.63
564 0.65
565 0.68
566 0.72
567 0.73
568 0.81
569 0.83
570 0.9
571 0.92
572 0.9
573 0.89
574 0.84
575 0.83
576 0.8
577 0.73
578 0.65
579 0.56
580 0.49
581 0.41
582 0.35
583 0.26
584 0.21
585 0.18
586 0.18
587 0.2
588 0.22
589 0.26
590 0.25
591 0.28
592 0.32
593 0.33
594 0.32
595 0.33
596 0.32