FuNGI

A0A5C3R033

Protein Details

Accession

A0A5C3R033

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
110-129	EPQQSQSKQKKKGESLQLRD	Hydrophilic
490-509	SKEDKKARKDAVKEEQRARR	Basic
520-541	AAEYKRQKKAIVNKEKPQLRKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
490-541	SKEDKKARKDAVKEEQRARRAEKKSTKEQFAAEYKRQKKAIVNKEKPQLRKL

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSIFRQPGVQHFELVHRSQRDPLINDPDAPQHVLKPITRENLKKGKSKQELEQHLSPKDVEQDRKRNVGEASAYGVYFDDTEYDYMQHLKPYGVEEEGVDSVLIEAEPQQSQSKQKKKGESLQLRDLPPESLASTSELPQSVVYESHRSVATSLVGFQPDMNPHLRQTLEALEDDAFVDDDAEDDFFGSLVQDGERDETESLDYEFDEYGVSHEDGIAGDQDHDDSWEARFAKFKKEQRRPSSSDVDSDERSEGQDTVRGLPEMSVIGGKRRGRKGTSDASGYSMSSSSMFRTEALLTLDERFDQMMIAGYDEESEDTPSEISDSDEEAPELITSRVDFENMMDDFLGEYEILGRKMKRKLAGDTGADKLDTIRRTMGIDERVQVVDGDEKEEDDSDIPMPYDIDEKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARDVNATPKIRLDRRTGLPTVAKEAAPLPHVAEGESDEEEEGQEHEGTIIRPRDESKEDKKARKDAVKEEQRARRAEKKSTKEQFAAEYKRQKKAIVNKEKPQLRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.49
3	0.46
4	0.44
5	0.42
6	0.38
7	0.39
8	0.42
9	0.47
10	0.47
11	0.45
12	0.5
13	0.51
14	0.48
15	0.48
16	0.45
17	0.43
18	0.39
19	0.39
20	0.32
21	0.25
22	0.28
23	0.31
24	0.31
25	0.33
26	0.37
27	0.43
28	0.49
29	0.52
30	0.57
31	0.62
32	0.66
33	0.68
34	0.7
35	0.71
36	0.74
37	0.74
38	0.73
39	0.73
40	0.77
41	0.75
42	0.75
43	0.7
44	0.62
45	0.59
46	0.5
47	0.42
48	0.41
49	0.41
50	0.43
51	0.47
52	0.55
53	0.58
54	0.65
55	0.64
56	0.59
57	0.53
58	0.49
59	0.42
60	0.33
61	0.32
62	0.26
63	0.25
64	0.21
65	0.2
66	0.15
67	0.12
68	0.11
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.11
75	0.14
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.15
80	0.15
81	0.18
82	0.19
83	0.16
84	0.16
85	0.14
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.11
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.04
95	0.05
96	0.07
97	0.08
98	0.1
99	0.13
100	0.15
101	0.25
102	0.35
103	0.43
104	0.51
105	0.58
106	0.66
107	0.71
108	0.78
109	0.8
110	0.8
111	0.78
112	0.78
113	0.77
114	0.68
115	0.62
116	0.54
117	0.43
118	0.33
119	0.27
120	0.18
121	0.12
122	0.12
123	0.13
124	0.13
125	0.14
126	0.15
127	0.14
128	0.14
129	0.14
130	0.14
131	0.12
132	0.12
133	0.14
134	0.16
135	0.16
136	0.18
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.15
142	0.11
143	0.12
144	0.11
145	0.12
146	0.11
147	0.11
148	0.13
149	0.12
150	0.15
151	0.16
152	0.16
153	0.16
154	0.19
155	0.19
156	0.17
157	0.17
158	0.18
159	0.16
160	0.16
161	0.16
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.11
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.06
198	0.05
199	0.06
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.17
221	0.17
222	0.25
223	0.33
224	0.4
225	0.47
226	0.57
227	0.66
228	0.7
229	0.77
230	0.74
231	0.72
232	0.73
233	0.63
234	0.56
235	0.49
236	0.44
237	0.36
238	0.31
239	0.26
240	0.18
241	0.17
242	0.15
243	0.11
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.12
249	0.11
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.08
258	0.13
259	0.16
260	0.22
261	0.26
262	0.3
263	0.3
264	0.34
265	0.39
266	0.4
267	0.4
268	0.36
269	0.32
270	0.31
271	0.29
272	0.25
273	0.19
274	0.13
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.07
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.04
339	0.04
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.11
344	0.13
345	0.18
346	0.24
347	0.29
348	0.33
349	0.36
350	0.4
351	0.46
352	0.5
353	0.47
354	0.45
355	0.43
356	0.37
357	0.33
358	0.28
359	0.21
360	0.2
361	0.17
362	0.16
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.18
367	0.22
368	0.21
369	0.22
370	0.22
371	0.23
372	0.22
373	0.21
374	0.19
375	0.15
376	0.15
377	0.14
378	0.15
379	0.12
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.09
385	0.1
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.13
393	0.12
394	0.17
395	0.21
396	0.22
397	0.3
398	0.36
399	0.37
400	0.36
401	0.39
402	0.34
403	0.36
404	0.39
405	0.32
406	0.28
407	0.28
408	0.24
409	0.21
410	0.22
411	0.17
412	0.14
413	0.19
414	0.19
415	0.22
416	0.24
417	0.25
418	0.26
419	0.29
420	0.35
421	0.34
422	0.37
423	0.39
424	0.4
425	0.44
426	0.5
427	0.49
428	0.43
429	0.43
430	0.47
431	0.47
432	0.48
433	0.48
434	0.48
435	0.52
436	0.58
437	0.54
438	0.51
439	0.51
440	0.47
441	0.46
442	0.4
443	0.33
444	0.28
445	0.28
446	0.26
447	0.22
448	0.21
449	0.16
450	0.17
451	0.17
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.15
456	0.15
457	0.14
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.11
462	0.1
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.18
470	0.21
471	0.2
472	0.22
473	0.25
474	0.31
475	0.35
476	0.43
477	0.45
478	0.52
479	0.6
480	0.67
481	0.73
482	0.75
483	0.79
484	0.79
485	0.77
486	0.76
487	0.78
488	0.79
489	0.79
490	0.8
491	0.8
492	0.78
493	0.77
494	0.74
495	0.73
496	0.69
497	0.72
498	0.72
499	0.72
500	0.77
501	0.8
502	0.8
503	0.74
504	0.7
505	0.68
506	0.67
507	0.67
508	0.65
509	0.66
510	0.66
511	0.7
512	0.69
513	0.65
514	0.65
515	0.67
516	0.69
517	0.7
518	0.73
519	0.73
520	0.81
521	0.84

A0A5C3R033

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer