Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QNC6

Protein Details
Accession A0A5C3QNC6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-292MGENPKKKRKKDGPGVTAKNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-283PKKKRKKD
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MSKDTTPSQPATSQWAIDPALQQISAATAGHTANQAYYGYPSYYYQQPQQAQPQATRASTPAVASTSTAAPKSAGGGALDSSDINTLSDAIGSAGIDLRAEEESLQKPHDSSISYRQYHSDRTHTQPQNLSFNSHFLGTTVRAIAADTHKLGKPISDDTVNYLALALRTRLQDLIKGMIAASHHRTDSAYDHATSLYEGTDIPMWDVTVRRDVAKQLAVLERIEKEDELKTRRDRKERADMAAAQLAALQASGSGSSSLGSYGGGGDMDDDMGENPKKKRKKDGPGVTAKNMSEDVRKQMSNLVANQAIGGKKYSWMTASNASAAPRSAKAPEKTASASSPATSTPRSTWSKPYVSATVKTGKDAGDAGTPTEEDTKTRVTMRDAMFVVEKERGHGGGRGAALGWT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.28
4 0.27
5 0.27
6 0.22
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.15
28 0.16
29 0.18
30 0.24
31 0.27
32 0.31
33 0.37
34 0.4
35 0.45
36 0.52
37 0.56
38 0.53
39 0.52
40 0.53
41 0.49
42 0.45
43 0.41
44 0.33
45 0.29
46 0.26
47 0.24
48 0.2
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.1
90 0.14
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.19
97 0.17
98 0.18
99 0.26
100 0.34
101 0.35
102 0.36
103 0.39
104 0.39
105 0.44
106 0.44
107 0.42
108 0.39
109 0.44
110 0.54
111 0.54
112 0.56
113 0.55
114 0.55
115 0.54
116 0.5
117 0.47
118 0.36
119 0.34
120 0.3
121 0.25
122 0.2
123 0.13
124 0.14
125 0.11
126 0.12
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.18
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.15
175 0.17
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.18
215 0.2
216 0.25
217 0.31
218 0.41
219 0.48
220 0.55
221 0.57
222 0.6
223 0.67
224 0.66
225 0.62
226 0.57
227 0.5
228 0.44
229 0.41
230 0.33
231 0.22
232 0.18
233 0.14
234 0.09
235 0.08
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.08
260 0.1
261 0.14
262 0.18
263 0.27
264 0.34
265 0.38
266 0.49
267 0.56
268 0.65
269 0.72
270 0.78
271 0.8
272 0.83
273 0.85
274 0.77
275 0.71
276 0.6
277 0.51
278 0.42
279 0.33
280 0.28
281 0.25
282 0.27
283 0.27
284 0.27
285 0.26
286 0.29
287 0.32
288 0.31
289 0.3
290 0.28
291 0.25
292 0.25
293 0.24
294 0.23
295 0.19
296 0.16
297 0.16
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.16
304 0.19
305 0.23
306 0.24
307 0.23
308 0.24
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.2
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.26
317 0.27
318 0.32
319 0.33
320 0.35
321 0.36
322 0.37
323 0.34
324 0.3
325 0.29
326 0.24
327 0.23
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.22
332 0.2
333 0.27
334 0.33
335 0.35
336 0.42
337 0.46
338 0.49
339 0.5
340 0.53
341 0.53
342 0.51
343 0.5
344 0.47
345 0.47
346 0.43
347 0.41
348 0.38
349 0.3
350 0.28
351 0.26
352 0.23
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.21
360 0.19
361 0.16
362 0.19
363 0.21
364 0.23
365 0.27
366 0.28
367 0.28
368 0.36
369 0.37
370 0.41
371 0.38
372 0.37
373 0.36
374 0.34
375 0.32
376 0.29
377 0.27
378 0.22
379 0.24
380 0.22
381 0.22
382 0.24
383 0.24
384 0.23
385 0.24
386 0.22