Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QHH0

Protein Details
Accession A0A5C3QHH0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-133NPEQKEIDRKERRAKRRSGRRGSKAVPBasic
153-181GTEDANKSKKKKKSSKRKSKRKTEGGEGVBasic
251-270ARVARMRWGRHPRKSRGFGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-130DRKERRAKRRSGRRGSK
159-175KSKKKKKSSKRKSKRKT
196-208KKARKPRAERTPR
Subcellular Location(s) cyto 20, cyto_nucl 13.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSDAQAATIQTGVATVVAQEPKIDETPGHKVFVGNLAYSVNDDGLKALFEPFKSDILSVQVITHGPKKSSGYGFVSLSTPEAAQKAIDSLHNKEVDGRPLVVQSAKNPEQKEIDRKERRAKRRSGRRGSKAVPGEVTDAEANGDAPKADAAPGTEDANKSKKKKKSSKRKSKRKTEGGEGVATPGEETAAVDATQKKARKPRAERTPRAPGEAPVGELSKTGVFVANLGFSVDEAALQTLFTDAGFKVETARVARMRWGRHPRKSRGFGFVQLTSEEEQKKAITALNGKTIGDREIVVKVAVNREDDEDDKPEDAAAGAAAATPAAAAPAAANPAVPAAAATTPAPAAAAPTAAPAATATPAAAAATAAAPPVSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.1
4 0.12
5 0.12
6 0.12
7 0.14
8 0.17
9 0.19
10 0.19
11 0.15
12 0.19
13 0.29
14 0.31
15 0.31
16 0.28
17 0.27
18 0.28
19 0.33
20 0.3
21 0.21
22 0.19
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.13
36 0.13
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.18
43 0.2
44 0.21
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.22
51 0.21
52 0.2
53 0.23
54 0.26
55 0.31
56 0.32
57 0.35
58 0.34
59 0.35
60 0.35
61 0.32
62 0.3
63 0.24
64 0.22
65 0.18
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.14
75 0.16
76 0.19
77 0.25
78 0.26
79 0.26
80 0.3
81 0.32
82 0.32
83 0.31
84 0.28
85 0.23
86 0.22
87 0.24
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.25
92 0.29
93 0.34
94 0.34
95 0.36
96 0.39
97 0.43
98 0.49
99 0.48
100 0.53
101 0.57
102 0.63
103 0.7
104 0.74
105 0.79
106 0.79
107 0.81
108 0.81
109 0.84
110 0.88
111 0.89
112 0.89
113 0.87
114 0.87
115 0.8
116 0.77
117 0.69
118 0.6
119 0.5
120 0.41
121 0.35
122 0.26
123 0.24
124 0.16
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.15
144 0.22
145 0.27
146 0.31
147 0.38
148 0.44
149 0.53
150 0.63
151 0.71
152 0.75
153 0.81
154 0.87
155 0.9
156 0.94
157 0.94
158 0.95
159 0.95
160 0.93
161 0.87
162 0.83
163 0.79
164 0.7
165 0.61
166 0.5
167 0.4
168 0.3
169 0.24
170 0.16
171 0.08
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.09
181 0.14
182 0.16
183 0.19
184 0.27
185 0.35
186 0.44
187 0.52
188 0.59
189 0.66
190 0.75
191 0.77
192 0.76
193 0.79
194 0.7
195 0.66
196 0.57
197 0.46
198 0.41
199 0.35
200 0.29
201 0.19
202 0.19
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.24
242 0.28
243 0.31
244 0.38
245 0.48
246 0.53
247 0.61
248 0.71
249 0.74
250 0.79
251 0.83
252 0.77
253 0.73
254 0.67
255 0.63
256 0.57
257 0.5
258 0.41
259 0.33
260 0.31
261 0.25
262 0.27
263 0.22
264 0.18
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.2
272 0.22
273 0.28
274 0.29
275 0.28
276 0.28
277 0.27
278 0.24
279 0.19
280 0.17
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.2
291 0.22
292 0.25
293 0.24
294 0.25
295 0.23
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.18
300 0.15
301 0.13
302 0.1
303 0.07
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.07
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06