Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3R180

Protein Details
Accession A0A5C3R180    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-213GEGKSKDKDMRGKKRKKGKQGPDNRARVRRIBasic
556-584EDRKGDLTRDWRRRWREAGKVSRRRGKGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-211GKSKDKDMRGKKRKKGKQGPDNRARVR
566-584WRRRWREAGKVSRRRGKGA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSAPAPAPSDALTTTRLHISGLSSTSTLTAADLTRRFSAFGTVSNVDGFDSLNGLGERRGYGYLTFTGKKADLSRCVASLSGATWKGAKVRIGDAKPDFRERIAKENAAQSTDVPKRTRRPGKYSAVESDSMEPITLEALTAPGASQTHPHWKVTPMGRVVRVMKMRPGKGLPPTLLEEHALGEGKSKDKDMRGKKRKKGKQGPDNRARVRRIDPTLWGSTLLKGMFLENVDIEELRAQKAVQPAEEEGSDSDDSEEEVVEVAETVLPPAVPVQASAPASPSPPPPDEHSASPARSPSPAPSIRAETSASLALLSTLFPSSSAWSAPPAELDSDIEIDAADEHVRRNVGNGDGEDVEEVPLQRDDDEDSSSEEEQQDDNDDDDSSSDSSSSSSEDDEDESKAPAPAPTSTSLKDLFAPRPSNPSFSLLGHLDLDLSSDELDPELDFLLSAPAQALLAQEEPPLLPTPVQHIAVSTLPSYDPSYPLFFPHPSTIDSLSSLTPLQASLNASNAHLARPNNANTKQPDVLSTLITRGLDWRSAGFYRSESDADIQQRWEDRKGDLTRDWRRRWREAGKVSRRRGKGAGGGEEGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.14
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.17
19 0.19
20 0.22
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.23
25 0.28
26 0.23
27 0.24
28 0.27
29 0.25
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.19
34 0.18
35 0.14
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.14
47 0.12
48 0.13
49 0.16
50 0.19
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.26
55 0.25
56 0.28
57 0.31
58 0.33
59 0.34
60 0.39
61 0.4
62 0.37
63 0.37
64 0.34
65 0.28
66 0.22
67 0.17
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.21
74 0.23
75 0.25
76 0.21
77 0.28
78 0.36
79 0.37
80 0.43
81 0.45
82 0.5
83 0.5
84 0.54
85 0.48
86 0.42
87 0.49
88 0.44
89 0.47
90 0.45
91 0.44
92 0.41
93 0.47
94 0.46
95 0.4
96 0.37
97 0.3
98 0.33
99 0.35
100 0.37
101 0.34
102 0.39
103 0.44
104 0.55
105 0.64
106 0.63
107 0.66
108 0.69
109 0.76
110 0.77
111 0.74
112 0.7
113 0.64
114 0.57
115 0.5
116 0.44
117 0.35
118 0.27
119 0.22
120 0.15
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.09
134 0.12
135 0.22
136 0.24
137 0.26
138 0.27
139 0.29
140 0.36
141 0.39
142 0.42
143 0.38
144 0.4
145 0.4
146 0.43
147 0.43
148 0.42
149 0.41
150 0.36
151 0.38
152 0.41
153 0.41
154 0.4
155 0.41
156 0.39
157 0.4
158 0.43
159 0.37
160 0.32
161 0.34
162 0.31
163 0.29
164 0.25
165 0.2
166 0.16
167 0.16
168 0.13
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.23
177 0.33
178 0.4
179 0.5
180 0.58
181 0.68
182 0.74
183 0.82
184 0.85
185 0.88
186 0.88
187 0.87
188 0.87
189 0.88
190 0.9
191 0.89
192 0.9
193 0.86
194 0.83
195 0.74
196 0.68
197 0.62
198 0.58
199 0.54
200 0.46
201 0.42
202 0.4
203 0.4
204 0.35
205 0.32
206 0.25
207 0.21
208 0.21
209 0.17
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.15
228 0.16
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.14
235 0.09
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.16
272 0.18
273 0.23
274 0.25
275 0.25
276 0.28
277 0.27
278 0.26
279 0.26
280 0.23
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.14
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.22
289 0.26
290 0.25
291 0.26
292 0.24
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.13
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.12
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.13
394 0.16
395 0.19
396 0.19
397 0.21
398 0.21
399 0.2
400 0.23
401 0.24
402 0.25
403 0.28
404 0.31
405 0.29
406 0.36
407 0.37
408 0.37
409 0.34
410 0.34
411 0.29
412 0.27
413 0.29
414 0.22
415 0.22
416 0.19
417 0.17
418 0.13
419 0.11
420 0.11
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.15
454 0.19
455 0.21
456 0.19
457 0.18
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.16
462 0.13
463 0.11
464 0.13
465 0.15
466 0.14
467 0.14
468 0.16
469 0.19
470 0.19
471 0.22
472 0.24
473 0.22
474 0.25
475 0.27
476 0.27
477 0.24
478 0.27
479 0.27
480 0.24
481 0.24
482 0.22
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.13
487 0.11
488 0.1
489 0.09
490 0.1
491 0.14
492 0.13
493 0.17
494 0.17
495 0.17
496 0.21
497 0.2
498 0.19
499 0.21
500 0.21
501 0.21
502 0.27
503 0.33
504 0.38
505 0.4
506 0.46
507 0.45
508 0.51
509 0.49
510 0.44
511 0.4
512 0.34
513 0.33
514 0.29
515 0.26
516 0.2
517 0.2
518 0.2
519 0.18
520 0.18
521 0.19
522 0.18
523 0.18
524 0.18
525 0.21
526 0.22
527 0.23
528 0.21
529 0.2
530 0.21
531 0.23
532 0.23
533 0.2
534 0.21
535 0.26
536 0.28
537 0.29
538 0.28
539 0.29
540 0.34
541 0.36
542 0.39
543 0.35
544 0.33
545 0.4
546 0.44
547 0.46
548 0.47
549 0.54
550 0.6
551 0.68
552 0.74
553 0.75
554 0.78
555 0.8
556 0.82
557 0.82
558 0.82
559 0.82
560 0.84
561 0.85
562 0.88
563 0.89
564 0.89
565 0.83
566 0.78
567 0.71
568 0.67
569 0.64
570 0.61
571 0.58