FuNGI

A0A5C3QJ95

Protein Details

Accession

A0A5C3QJ95

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-55	DGDGDKGARRRKCKKMEVDLQDVS	Hydrophilic
548-570	TNSESTKKKSKSKSKSPSPPSTA	Hydrophilic
908-934	IVVVGQGRQRNKRKRTNAPVKGKGKEP	Hydrophilic
970-993	VEQVGGKKKKRKAGGKKDGGGKNR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
555-562	KKSKSKSK
915-932	RQRNKRKRTNAPVKGKGK
975-1009	GKKKKRKAGGKKDGGGKNREGGKEGREEGQVKKRR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9.333, cyto 9, cyto_mito 8.833, nucl 8.5, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC PF08066 PMC2NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MLHELSLSHLVHSERPSANKSARRLQFTSNVDGDGDKGARRRKCKKMEVDLQDVSHLPSQLNSDSLAARRDEHVPSVIFSRSPSILLRRSVPPNIMASSSSTSPDFPSIHQNLLTSALKLTRSSASLPAQSDLAFHRTLDPQVASTLDGLEERVLAVLNDVMRFVGKGKAREVAVDGEDVRENFHASIVDVVDGLLERADTCIDQHLGRITKPAIAINPAPLKKTKVIPANNKPSIAPGVKGKPQTLFKKSIDNSDTAWYPNIAHKYHARVPLGYVYRDADADETEQELSSTHPYIYELKTPALSYPSSLLSLAHPSASNPPITPTDPLPIASTPITFVSTVEEYHKMMRTILQSKPTAIALDLEHHDYRTYGGFLCLMQLSTREGDWVVDLCVPEIREVMDNTKCDGREGGREESGNEMAELLSDPELVKVLHGAESDVVWLQRDFGLYVVGLFDTFHASKVLDFPRHGLAHLLEMYCDFVPDKKHQLSDWRIRPLPEDMLEYARSDTHFLLYIYDNLLNALLDRQQSLQRKSTSSSRAASPMELDTNSESTKKKSKSKSKSPSPPSTALPQNSNPAFPATLLGTVLARSSQTALRTHVREPYDFASGGGPMGWDTLARKWGKVQLFAPVIGGLPDLPEVGTRGGDDGDGDGDGEGGGGEVGTGLEREIFRAVHKWRDIVAREEDESLRFVLQNHHLFTIAAKPPSSEAELLRLLGLSGNGGGNGNAPMSVVRRRAGEMVRVIRGVGRGWRAVRRVEGGGGKMDVDVDDEDRIVLSSKTEVLERAAPALETASELWGGASSTSSAKSSLLFGSKLKAVVQELGTRKSSLFGSTLTNRIANGGQDFGSIVERIHRSLIIAPTAPVVPFKPTPAPADEPAEDQEMAFIPAAERTTKPVEPPVEKERDTIVVVGQGRQRNKRKRTNAPVKGKGKEPAEDDGAGEGEGEGDAEETPAFDFDSVPNILDDIEQVEQVGGKKKKRKAGGKKDGGGKNREGGKEGREEGQVKKRRLAQAPSTAQSQQFLPTFMSNPHQTSSLAKHPFQPLDHYVDIQPQRVDPSHSDSDSDSIYNFYSREELVDQALKCMQDAGIQLIECVSLLHIRMGVPVLIKHFHYLVSDEQLDHVYASQLLQGLSQSLPPSLMLLSERDLSHKARMYRVTHSTHIGVTQHLALFPPSSPRTHPLTSPPLLGPPPDVHDRPRPVVASSILRRLKSYTKYDPARTVLKPEP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.34
3	0.38
4	0.43
5	0.5
6	0.52
7	0.56
8	0.59
9	0.62
10	0.65
11	0.64
12	0.63
13	0.64
14	0.61
15	0.62
16	0.53
17	0.47
18	0.4
19	0.36
20	0.31
21	0.26
22	0.23
23	0.19
24	0.24
25	0.31
26	0.38
27	0.48
28	0.57
29	0.63
30	0.72
31	0.79
32	0.84
33	0.86
34	0.89
35	0.87
36	0.86
37	0.79
38	0.7
39	0.62
40	0.52
41	0.44
42	0.36
43	0.29
44	0.2
45	0.18
46	0.21
47	0.19
48	0.2
49	0.18
50	0.17
51	0.18
52	0.21
53	0.23
54	0.2
55	0.21
56	0.22
57	0.26
58	0.26
59	0.26
60	0.28
61	0.26
62	0.26
63	0.27
64	0.26
65	0.22
66	0.21
67	0.23
68	0.19
69	0.2
70	0.23
71	0.27
72	0.31
73	0.34
74	0.37
75	0.4
76	0.45
77	0.48
78	0.46
79	0.42
80	0.4
81	0.39
82	0.36
83	0.29
84	0.27
85	0.26
86	0.25
87	0.23
88	0.2
89	0.19
90	0.2
91	0.24
92	0.21
93	0.19
94	0.28
95	0.29
96	0.31
97	0.31
98	0.3
99	0.26
100	0.31
101	0.3
102	0.21
103	0.2
104	0.2
105	0.21
106	0.21
107	0.22
108	0.19
109	0.2
110	0.22
111	0.26
112	0.28
113	0.31
114	0.32
115	0.3
116	0.28
117	0.26
118	0.26
119	0.22
120	0.21
121	0.17
122	0.16
123	0.19
124	0.2
125	0.22
126	0.24
127	0.22
128	0.19
129	0.2
130	0.2
131	0.17
132	0.15
133	0.14
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.08
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.15
153	0.18
154	0.21
155	0.23
156	0.28
157	0.28
158	0.29
159	0.3
160	0.27
161	0.24
162	0.23
163	0.21
164	0.18
165	0.2
166	0.18
167	0.18
168	0.15
169	0.15
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.1
174	0.13
175	0.11
176	0.11
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.1
190	0.12
191	0.12
192	0.14
193	0.2
194	0.21
195	0.22
196	0.26
197	0.22
198	0.23
199	0.25
200	0.25
201	0.21
202	0.23
203	0.24
204	0.26
205	0.33
206	0.32
207	0.33
208	0.33
209	0.36
210	0.36
211	0.4
212	0.4
213	0.41
214	0.5
215	0.58
216	0.66
217	0.72
218	0.72
219	0.67
220	0.6
221	0.54
222	0.51
223	0.42
224	0.33
225	0.3
226	0.32
227	0.37
228	0.4
229	0.38
230	0.38
231	0.46
232	0.52
233	0.51
234	0.52
235	0.48
236	0.56
237	0.55
238	0.58
239	0.52
240	0.45
241	0.41
242	0.37
243	0.37
244	0.28
245	0.28
246	0.19
247	0.18
248	0.22
249	0.25
250	0.22
251	0.24
252	0.27
253	0.33
254	0.39
255	0.45
256	0.41
257	0.36
258	0.38
259	0.43
260	0.42
261	0.35
262	0.3
263	0.25
264	0.23
265	0.23
266	0.21
267	0.14
268	0.11
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.12
282	0.16
283	0.18
284	0.22
285	0.21
286	0.22
287	0.23
288	0.23
289	0.22
290	0.21
291	0.19
292	0.14
293	0.14
294	0.15
295	0.14
296	0.14
297	0.13
298	0.12
299	0.16
300	0.15
301	0.14
302	0.12
303	0.13
304	0.18
305	0.19
306	0.19
307	0.15
308	0.18
309	0.2
310	0.21
311	0.22
312	0.18
313	0.2
314	0.2
315	0.2
316	0.2
317	0.17
318	0.18
319	0.16
320	0.15
321	0.12
322	0.13
323	0.13
324	0.11
325	0.1
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.18
333	0.21
334	0.17
335	0.17
336	0.2
337	0.24
338	0.27
339	0.3
340	0.33
341	0.31
342	0.32
343	0.33
344	0.29
345	0.23
346	0.19
347	0.17
348	0.11
349	0.14
350	0.14
351	0.17
352	0.17
353	0.16
354	0.16
355	0.14
356	0.15
357	0.13
358	0.12
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.09
363	0.11
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.11
387	0.15
388	0.17
389	0.17
390	0.19
391	0.22
392	0.21
393	0.2
394	0.21
395	0.18
396	0.22
397	0.26
398	0.27
399	0.26
400	0.26
401	0.26
402	0.27
403	0.26
404	0.19
405	0.14
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.15
450	0.19
451	0.18
452	0.18
453	0.2
454	0.24
455	0.25
456	0.24
457	0.2
458	0.17
459	0.17
460	0.18
461	0.16
462	0.11
463	0.1
464	0.12
465	0.1
466	0.1
467	0.07
468	0.08
469	0.11
470	0.15
471	0.21
472	0.22
473	0.23
474	0.24
475	0.33
476	0.39
477	0.45
478	0.49
479	0.49
480	0.48
481	0.47
482	0.48
483	0.42
484	0.37
485	0.28
486	0.24
487	0.18
488	0.19
489	0.2
490	0.18
491	0.16
492	0.13
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.09
497	0.1
498	0.09
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.11
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.09
514	0.14
515	0.21
516	0.24
517	0.29
518	0.3
519	0.31
520	0.33
521	0.38
522	0.38
523	0.36
524	0.35
525	0.3
526	0.32
527	0.31
528	0.28
529	0.23
530	0.19
531	0.16
532	0.14
533	0.13
534	0.1
535	0.11
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.15
540	0.23
541	0.27
542	0.35
543	0.43
544	0.53
545	0.61
546	0.71
547	0.78
548	0.8
549	0.86
550	0.86
551	0.85
552	0.8
553	0.73
554	0.64
555	0.59
556	0.54
557	0.45
558	0.4
559	0.33
560	0.33
561	0.3
562	0.28
563	0.23
564	0.19
565	0.17
566	0.13
567	0.13
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.06
579	0.07
580	0.09
581	0.11
582	0.14
583	0.18
584	0.2
585	0.21
586	0.26
587	0.25
588	0.24
589	0.25
590	0.24
591	0.21
592	0.19
593	0.19
594	0.13
595	0.12
596	0.11
597	0.09
598	0.06
599	0.04
600	0.04
601	0.04
602	0.03
603	0.04
604	0.06
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.14
609	0.2
610	0.21
611	0.23
612	0.22
613	0.23
614	0.24
615	0.24
616	0.22
617	0.17
618	0.15
619	0.12
620	0.11
621	0.05
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.03
626	0.03
627	0.04
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.02
645	0.02
646	0.02
647	0.02
648	0.02
649	0.02
650	0.02
651	0.02
652	0.02
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.07
659	0.13
660	0.15
661	0.2
662	0.21
663	0.21
664	0.22
665	0.28
666	0.29
667	0.27
668	0.29
669	0.25
670	0.25
671	0.26
672	0.24
673	0.19
674	0.18
675	0.14
676	0.11
677	0.1
678	0.09
679	0.12
680	0.18
681	0.21
682	0.21
683	0.21
684	0.21
685	0.21
686	0.2
687	0.24
688	0.2
689	0.18
690	0.17
691	0.16
692	0.17
693	0.19
694	0.2
695	0.14
696	0.11
697	0.14
698	0.14
699	0.14
700	0.13
701	0.11
702	0.1
703	0.08
704	0.08
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.07
718	0.11
719	0.12
720	0.13
721	0.14
722	0.16
723	0.2
724	0.2
725	0.23
726	0.25
727	0.26
728	0.26
729	0.25
730	0.24
731	0.21
732	0.21
733	0.17
734	0.15
735	0.14
736	0.15
737	0.18
738	0.22
739	0.23
740	0.24
741	0.25
742	0.24
743	0.23
744	0.23
745	0.23
746	0.19
747	0.18
748	0.17
749	0.15
750	0.12
751	0.11
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.05
764	0.06
765	0.07
766	0.08
767	0.08
768	0.09
769	0.1
770	0.13
771	0.12
772	0.13
773	0.12
774	0.11
775	0.1
776	0.1
777	0.08
778	0.06
779	0.06
780	0.06
781	0.05
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.04
787	0.04
788	0.05
789	0.06
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.08
794	0.08
795	0.1
796	0.11
797	0.12
798	0.13
799	0.13
800	0.15
801	0.16
802	0.16
803	0.15
804	0.14
805	0.13
806	0.15
807	0.16
808	0.21
809	0.22
810	0.25
811	0.25
812	0.24
813	0.23
814	0.22
815	0.21
816	0.16
817	0.14
818	0.12
819	0.16
820	0.18
821	0.21
822	0.2
823	0.2
824	0.19
825	0.19
826	0.19
827	0.15
828	0.13
829	0.11
830	0.1
831	0.1
832	0.1
833	0.09
834	0.09
835	0.08
836	0.07
837	0.11
838	0.12
839	0.12
840	0.13
841	0.13
842	0.13
843	0.16
844	0.18
845	0.16
846	0.15
847	0.15
848	0.15
849	0.16
850	0.15
851	0.12
852	0.1
853	0.13
854	0.13
855	0.15
856	0.18
857	0.19
858	0.22
859	0.26
860	0.29
861	0.27
862	0.31
863	0.3
864	0.28
865	0.27
866	0.27
867	0.22
868	0.18
869	0.16
870	0.12
871	0.12
872	0.1
873	0.08
874	0.06
875	0.07
876	0.09
877	0.1
878	0.1
879	0.13
880	0.18
881	0.19
882	0.2
883	0.25
884	0.3
885	0.32
886	0.38
887	0.42
888	0.44
889	0.43
890	0.43
891	0.38
892	0.35
893	0.32
894	0.27
895	0.19
896	0.18
897	0.18
898	0.2
899	0.23
900	0.26
901	0.3
902	0.4
903	0.49
904	0.55
905	0.64
906	0.71
907	0.76
908	0.82
909	0.88
910	0.89
911	0.9
912	0.9
913	0.91
914	0.87
915	0.81
916	0.74
917	0.69
918	0.6
919	0.54
920	0.46
921	0.4
922	0.36
923	0.33
924	0.29
925	0.23
926	0.21
927	0.16
928	0.13
929	0.09
930	0.06
931	0.05
932	0.05
933	0.04
934	0.04
935	0.04
936	0.04
937	0.04
938	0.04
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.06
944	0.06
945	0.1
946	0.11
947	0.11
948	0.1
949	0.1
950	0.1
951	0.1
952	0.1
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.09
959	0.11
960	0.2
961	0.24
962	0.31
963	0.4
964	0.46
965	0.54
966	0.62
967	0.71
968	0.73
969	0.79
970	0.83
971	0.84
972	0.85
973	0.86
974	0.83
975	0.79
976	0.73
977	0.63
978	0.59
979	0.56
980	0.5
981	0.43
982	0.39
983	0.36
984	0.38
985	0.37
986	0.33
987	0.32
988	0.34
989	0.37
990	0.45
991	0.5
992	0.46
993	0.5
994	0.54
995	0.58
996	0.62
997	0.63
998	0.61
999	0.63
1000	0.67
1001	0.64
1002	0.6
1003	0.54
1004	0.47
1005	0.41
1006	0.33
1007	0.27
1008	0.22
1009	0.21
1010	0.19
1011	0.19
1012	0.2
1013	0.2
1014	0.25
1015	0.24
1016	0.25
1017	0.25
1018	0.25
1019	0.24
1020	0.26
1021	0.3
1022	0.34
1023	0.35
1024	0.34
1025	0.39
1026	0.44
1027	0.47
1028	0.44
1029	0.45
1030	0.39
1031	0.41
1032	0.41
1033	0.37
1034	0.32
1035	0.37
1036	0.37
1037	0.34
1038	0.31
1039	0.25
1040	0.28
1041	0.28
1042	0.31
1043	0.26
1044	0.31
1045	0.34
1046	0.33
1047	0.34
1048	0.3
1049	0.31
1050	0.28
1051	0.25
1052	0.18
1053	0.13
1054	0.14
1055	0.14
1056	0.13
1057	0.12
1058	0.12
1059	0.12
1060	0.14
1061	0.15
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.23
1065	0.22
1066	0.22
1067	0.25
1068	0.22
1069	0.2
1070	0.2
1071	0.16
1072	0.14
1073	0.15
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.15
1079	0.15
1080	0.11
1081	0.1
1082	0.08
1083	0.07
1084	0.08
1085	0.09
1086	0.1
1087	0.1
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.14
1093	0.16
1094	0.17
1095	0.18
1096	0.19
1097	0.18
1098	0.18
1099	0.18
1100	0.19
1101	0.19
1102	0.23
1103	0.23
1104	0.21
1105	0.22
1106	0.22
1107	0.21
1108	0.18
1109	0.16
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.11
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.11
1125	0.12
1126	0.1
1127	0.11
1128	0.1
1129	0.11
1130	0.13
1131	0.17
1132	0.17
1133	0.19
1134	0.23
1135	0.24
1136	0.3
1137	0.34
1138	0.35
1139	0.38
1140	0.46
1141	0.47
1142	0.51
1143	0.56
1144	0.55
1145	0.52
1146	0.53
1147	0.48
1148	0.41
1149	0.41
1150	0.34
1151	0.28
1152	0.24
1153	0.24
1154	0.2
1155	0.18
1156	0.18
1157	0.16
1158	0.16
1159	0.16
1160	0.22
1161	0.21
1162	0.23
1163	0.27
1164	0.31
1165	0.37
1166	0.38
1167	0.41
1168	0.41
1169	0.48
1170	0.47
1171	0.47
1172	0.44
1173	0.42
1174	0.41
1175	0.38
1176	0.33
1177	0.28
1178	0.3
1179	0.34
1180	0.35
1181	0.35
1182	0.43
1183	0.49
1184	0.5
1185	0.53
1186	0.49
1187	0.43
1188	0.46
1189	0.45
1190	0.45
1191	0.42
1192	0.48
1193	0.47
1194	0.46
1195	0.46
1196	0.46
1197	0.5
1198	0.49
1199	0.53
1200	0.53
1201	0.58
1202	0.65
1203	0.7
1204	0.72
1205	0.69
1206	0.69
1207	0.62

A0A5C3QJ95

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer