Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QFW9

Protein Details
Accession A0A5C3QFW9    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22KEEQCKRKCGCGPNPHRLLPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 9.666, cyto 7.5, cyto_nucl 6.666, cyto_pero 5.166, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR006722  Sedlin  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04628  Sedlin_N  
CDD cd14825  TRAPPC2_sedlin  
Amino Acid Sequences MFKEEQCKRKCGCGPNPHRLLPTQNTTPMSHHLFLLSPTDTPLYSLTHFSTRPTQSISSPLSSNLPTWSTSAFAGTLTALSGASSSTQHAGSNNTGGGGGKVVGGGQDRHVVQMIANASLDVVEDVMRREGAGMYLKGVDKFNEWTVSAFVTPGNVKLLLLHEGKNDDGIKSFFVDVWELYLKTMLNPFHTAHTQIRSPVFDARVRVSAKKYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.81
4 0.75
5 0.7
6 0.63
7 0.6
8 0.56
9 0.54
10 0.48
11 0.47
12 0.47
13 0.46
14 0.45
15 0.44
16 0.43
17 0.36
18 0.31
19 0.26
20 0.24
21 0.23
22 0.24
23 0.19
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.15
33 0.16
34 0.19
35 0.19
36 0.21
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.3
41 0.29
42 0.26
43 0.32
44 0.33
45 0.27
46 0.25
47 0.24
48 0.23
49 0.22
50 0.22
51 0.17
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.03
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.12
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.21
153 0.2
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.15
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.14
165 0.16
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.18
172 0.16
173 0.18
174 0.21
175 0.22
176 0.25
177 0.27
178 0.3
179 0.3
180 0.34
181 0.33
182 0.34
183 0.37
184 0.34
185 0.35
186 0.36
187 0.36
188 0.34
189 0.35
190 0.35
191 0.38
192 0.39
193 0.41