Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q9E9

Protein Details
Accession A0A5C3Q9E9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-106GKKVTAAKKVVKKKKPAKKPEEVKFKLTBasic
190-213VINEKRMAKKKPKMTSKRAPGDKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-114KSQAKPTAAAKKTTTKSAAAAKKTTGKKVTAAKKVVKKKKPAKKPEEVKFKLTKEMMPPKK
194-209KRMAKKKPKMTSKRAP
Subcellular Location(s) mito 22, cyto_mito 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MFSLLGRALTRVSLVARTVPCSVNVSQRLSFSVYPRVSFPAAAAAAKSASEKTKSQAKPTAAAKKTTTKSAAAAKKTTGKKVTAAKKVVKKKKPAKKPEEVKFKLTKEMMPPKKPGSPFVFYVAKVRADSPKAETTKEGAEIMVKAGEQWRALSDAEKAPYCAEHEAALAKYTLARDEWWRNADKSLVRVINEKRMAKKKPKMTSKRAPGDKYPGSPYSFFISHQIRTSTLTSGGSKSVFREGGELWKSLPDKEKAHWQDLARKAREVWAAKHVEVAKQVGTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.2
3 0.21
4 0.23
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.27
9 0.29
10 0.31
11 0.35
12 0.37
13 0.35
14 0.35
15 0.36
16 0.36
17 0.37
18 0.31
19 0.35
20 0.32
21 0.31
22 0.32
23 0.34
24 0.3
25 0.27
26 0.24
27 0.21
28 0.2
29 0.19
30 0.18
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.11
36 0.13
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.31
41 0.33
42 0.39
43 0.44
44 0.43
45 0.47
46 0.54
47 0.6
48 0.53
49 0.55
50 0.51
51 0.53
52 0.53
53 0.51
54 0.46
55 0.37
56 0.38
57 0.43
58 0.46
59 0.41
60 0.41
61 0.39
62 0.44
63 0.47
64 0.5
65 0.45
66 0.39
67 0.41
68 0.48
69 0.54
70 0.54
71 0.57
72 0.58
73 0.62
74 0.71
75 0.75
76 0.74
77 0.76
78 0.77
79 0.81
80 0.84
81 0.86
82 0.85
83 0.85
84 0.87
85 0.87
86 0.88
87 0.81
88 0.77
89 0.73
90 0.66
91 0.61
92 0.52
93 0.45
94 0.42
95 0.5
96 0.51
97 0.48
98 0.5
99 0.47
100 0.52
101 0.5
102 0.47
103 0.42
104 0.37
105 0.34
106 0.36
107 0.35
108 0.29
109 0.32
110 0.28
111 0.23
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.18
116 0.19
117 0.2
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.17
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.08
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.13
164 0.18
165 0.22
166 0.25
167 0.27
168 0.27
169 0.28
170 0.31
171 0.27
172 0.24
173 0.27
174 0.26
175 0.24
176 0.3
177 0.31
178 0.36
179 0.41
180 0.42
181 0.43
182 0.5
183 0.57
184 0.61
185 0.67
186 0.67
187 0.71
188 0.78
189 0.8
190 0.81
191 0.84
192 0.84
193 0.86
194 0.84
195 0.79
196 0.73
197 0.72
198 0.67
199 0.6
200 0.55
201 0.49
202 0.44
203 0.4
204 0.37
205 0.33
206 0.3
207 0.26
208 0.28
209 0.28
210 0.27
211 0.29
212 0.29
213 0.25
214 0.28
215 0.29
216 0.24
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.2
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.22
226 0.2
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.27
231 0.28
232 0.27
233 0.22
234 0.27
235 0.27
236 0.28
237 0.34
238 0.31
239 0.32
240 0.35
241 0.46
242 0.45
243 0.49
244 0.51
245 0.49
246 0.53
247 0.59
248 0.65
249 0.57
250 0.54
251 0.5
252 0.51
253 0.55
254 0.5
255 0.45
256 0.44
257 0.46
258 0.44
259 0.49
260 0.45
261 0.4
262 0.38
263 0.37
264 0.28