Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3QKU0

Protein Details
Accession A0A5C3QKU0    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34TSKPRSGYRGRGRSARRGGKBasic
76-99EGSSTRLPPSRRDKGKRRFAGQLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-35KPRSGYRGRGRSARRGGKA
86-92RRDKGKR
537-543KGKGKKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MSDITPSSSTARESTSKPRSGYRGRGRSARRGGKARTDISVGQSSTSTTSRQGQAPRRIEQEPKASVVPNDQGNGEGSSTRLPPSRRDKGKRRFAGQLTSQQDESGNVNGQRDQAPHHRRPASLAADADLTTTLIHELSFPPYADCAICFSAIHPAQPTWSCSPPAGQCCWTTFHLKCIKPWAQKSVKDLEDAWATRGEYGRKCEWRCPGCQTKRQTIPGGYRCFCGSTPSPPLTRLHTPHSCGSSCSRSRNCPHACPLPCHPGPCPPCKVTLTQSCLCGEEQMLVKCGQAPQSPQLTCTESCKLPLACGHSCGDGCHVQPCRPCQKRVIQTCVCGKEETEVICGEREGALRCSNTCTSTFTCGVHQCDELCHEHSSYYLCPFDPVVVTRCPCGTHPIQEHAKDSLIVPRGETLVLPRTECTQPIPTCSSICNKPLPPTLCSSTKDVPHTCQMKCHTGPCTQPCRQEMTLPCRCGSTSKSVVCWQLALGEEGEGPGGSASAVAEILCTRTCTALRYCGRHACKRVCCPLASLGKVAKGKGKKKTALDLTAVEMLDLDADGLHVCDLVCGKPLGCGLHKCDARDHAGPCAPCHRSSFDEVICHCGLTILDPPVPCGTVLRCPHTCMRPPPPCGHPRHACYTLSEREDPRSGCPPCAFLGSKICACGKKELGNVTCSRPREKVSCGTVCAKTLACGFHKCSRLCHAGDCGTCTEPCGKPRKLCFPAIHPCALPCHAPSTCPEDKEHPCKAIITLTCPCGRIQQSAHCNTSTATKPITNGYNSTPNRGALQPKCNSECAIAQRNARLAEALGISPKDKGGDEAGVVWKDEVLVFARTNGKFVSLVERTFEEFVKSSKKHQVLPQMPPEKRRFVIDVAAVYRMDTQMVDVEPHRSVQILRRVDTRIPRPLLSTAIIMNVPSPSPSPGPGLGKLATRLPPKVAAQPASRPVESGWDLPNTSASGTATPVNALPASSWMARRAEYRRTESVPNVVEAPAMEKEAVTEDWEDDDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.44
3 0.49
4 0.5
5 0.55
6 0.6
7 0.64
8 0.71
9 0.71
10 0.72
11 0.71
12 0.78
13 0.78
14 0.79
15 0.81
16 0.79
17 0.77
18 0.76
19 0.77
20 0.78
21 0.79
22 0.71
23 0.64
24 0.59
25 0.52
26 0.49
27 0.5
28 0.39
29 0.32
30 0.29
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.18
36 0.25
37 0.28
38 0.34
39 0.42
40 0.48
41 0.57
42 0.62
43 0.64
44 0.63
45 0.63
46 0.64
47 0.62
48 0.62
49 0.55
50 0.52
51 0.48
52 0.45
53 0.42
54 0.41
55 0.38
56 0.32
57 0.3
58 0.26
59 0.25
60 0.24
61 0.24
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.21
69 0.22
70 0.31
71 0.4
72 0.5
73 0.58
74 0.67
75 0.75
76 0.8
77 0.89
78 0.89
79 0.85
80 0.84
81 0.78
82 0.77
83 0.73
84 0.72
85 0.66
86 0.61
87 0.55
88 0.46
89 0.41
90 0.33
91 0.29
92 0.22
93 0.22
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.26
99 0.25
100 0.28
101 0.33
102 0.41
103 0.46
104 0.54
105 0.56
106 0.53
107 0.58
108 0.6
109 0.55
110 0.49
111 0.43
112 0.35
113 0.32
114 0.31
115 0.26
116 0.18
117 0.13
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.23
144 0.26
145 0.3
146 0.25
147 0.28
148 0.28
149 0.27
150 0.32
151 0.34
152 0.36
153 0.36
154 0.34
155 0.33
156 0.33
157 0.37
158 0.34
159 0.35
160 0.31
161 0.35
162 0.42
163 0.41
164 0.43
165 0.48
166 0.55
167 0.56
168 0.6
169 0.62
170 0.61
171 0.64
172 0.67
173 0.65
174 0.58
175 0.51
176 0.47
177 0.41
178 0.39
179 0.35
180 0.31
181 0.25
182 0.24
183 0.24
184 0.26
185 0.28
186 0.25
187 0.3
188 0.36
189 0.42
190 0.45
191 0.5
192 0.56
193 0.55
194 0.56
195 0.59
196 0.62
197 0.63
198 0.68
199 0.68
200 0.69
201 0.72
202 0.73
203 0.7
204 0.65
205 0.66
206 0.66
207 0.67
208 0.58
209 0.52
210 0.47
211 0.43
212 0.37
213 0.33
214 0.27
215 0.25
216 0.31
217 0.33
218 0.34
219 0.33
220 0.35
221 0.35
222 0.4
223 0.37
224 0.39
225 0.4
226 0.43
227 0.46
228 0.48
229 0.43
230 0.38
231 0.39
232 0.41
233 0.4
234 0.45
235 0.46
236 0.49
237 0.53
238 0.61
239 0.62
240 0.58
241 0.6
242 0.61
243 0.59
244 0.56
245 0.57
246 0.56
247 0.53
248 0.49
249 0.44
250 0.44
251 0.46
252 0.47
253 0.47
254 0.39
255 0.42
256 0.41
257 0.44
258 0.42
259 0.45
260 0.45
261 0.41
262 0.43
263 0.39
264 0.38
265 0.35
266 0.28
267 0.2
268 0.16
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.17
278 0.19
279 0.22
280 0.29
281 0.29
282 0.29
283 0.3
284 0.3
285 0.29
286 0.3
287 0.29
288 0.22
289 0.24
290 0.28
291 0.25
292 0.22
293 0.24
294 0.26
295 0.23
296 0.25
297 0.25
298 0.21
299 0.21
300 0.2
301 0.21
302 0.17
303 0.16
304 0.2
305 0.21
306 0.23
307 0.26
308 0.33
309 0.4
310 0.43
311 0.45
312 0.46
313 0.54
314 0.6
315 0.64
316 0.67
317 0.6
318 0.61
319 0.65
320 0.62
321 0.54
322 0.45
323 0.37
324 0.29
325 0.29
326 0.24
327 0.18
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.21
345 0.2
346 0.24
347 0.25
348 0.22
349 0.24
350 0.26
351 0.28
352 0.25
353 0.24
354 0.19
355 0.19
356 0.21
357 0.2
358 0.18
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.17
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.2
381 0.19
382 0.23
383 0.25
384 0.31
385 0.35
386 0.36
387 0.38
388 0.33
389 0.31
390 0.25
391 0.22
392 0.21
393 0.2
394 0.18
395 0.16
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.11
401 0.13
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.17
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.21
410 0.21
411 0.24
412 0.27
413 0.24
414 0.24
415 0.26
416 0.27
417 0.23
418 0.25
419 0.26
420 0.25
421 0.27
422 0.33
423 0.34
424 0.31
425 0.32
426 0.34
427 0.33
428 0.33
429 0.35
430 0.32
431 0.33
432 0.36
433 0.33
434 0.32
435 0.35
436 0.39
437 0.33
438 0.36
439 0.36
440 0.37
441 0.37
442 0.38
443 0.34
444 0.33
445 0.38
446 0.4
447 0.45
448 0.42
449 0.45
450 0.44
451 0.47
452 0.43
453 0.43
454 0.42
455 0.42
456 0.45
457 0.41
458 0.4
459 0.34
460 0.33
461 0.3
462 0.26
463 0.25
464 0.25
465 0.24
466 0.26
467 0.29
468 0.3
469 0.28
470 0.26
471 0.18
472 0.14
473 0.13
474 0.11
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.06
479 0.06
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.02
488 0.03
489 0.02
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.07
498 0.09
499 0.1
500 0.18
501 0.22
502 0.25
503 0.28
504 0.34
505 0.39
506 0.43
507 0.48
508 0.47
509 0.5
510 0.52
511 0.57
512 0.51
513 0.47
514 0.43
515 0.43
516 0.4
517 0.34
518 0.3
519 0.24
520 0.26
521 0.27
522 0.26
523 0.24
524 0.27
525 0.32
526 0.39
527 0.45
528 0.46
529 0.47
530 0.54
531 0.53
532 0.49
533 0.45
534 0.38
535 0.32
536 0.29
537 0.27
538 0.19
539 0.14
540 0.1
541 0.08
542 0.07
543 0.05
544 0.02
545 0.02
546 0.02
547 0.02
548 0.02
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.04
553 0.04
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.1
560 0.11
561 0.13
562 0.16
563 0.24
564 0.25
565 0.25
566 0.26
567 0.27
568 0.3
569 0.32
570 0.29
571 0.25
572 0.27
573 0.26
574 0.25
575 0.29
576 0.26
577 0.23
578 0.25
579 0.24
580 0.23
581 0.27
582 0.3
583 0.25
584 0.27
585 0.26
586 0.29
587 0.26
588 0.23
589 0.19
590 0.15
591 0.13
592 0.11
593 0.13
594 0.1
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.14
600 0.12
601 0.1
602 0.1
603 0.16
604 0.19
605 0.23
606 0.23
607 0.26
608 0.31
609 0.35
610 0.39
611 0.39
612 0.46
613 0.48
614 0.51
615 0.53
616 0.56
617 0.59
618 0.6
619 0.61
620 0.58
621 0.55
622 0.58
623 0.57
624 0.5
625 0.45
626 0.45
627 0.42
628 0.39
629 0.39
630 0.33
631 0.33
632 0.37
633 0.34
634 0.31
635 0.34
636 0.31
637 0.3
638 0.3
639 0.28
640 0.25
641 0.28
642 0.26
643 0.19
644 0.24
645 0.24
646 0.24
647 0.24
648 0.25
649 0.24
650 0.25
651 0.28
652 0.25
653 0.27
654 0.3
655 0.35
656 0.34
657 0.36
658 0.36
659 0.37
660 0.39
661 0.36
662 0.37
663 0.33
664 0.34
665 0.34
666 0.36
667 0.38
668 0.4
669 0.41
670 0.41
671 0.43
672 0.4
673 0.37
674 0.34
675 0.27
676 0.21
677 0.2
678 0.2
679 0.18
680 0.21
681 0.24
682 0.29
683 0.36
684 0.36
685 0.37
686 0.4
687 0.42
688 0.4
689 0.38
690 0.36
691 0.34
692 0.34
693 0.33
694 0.29
695 0.25
696 0.23
697 0.22
698 0.23
699 0.2
700 0.26
701 0.32
702 0.35
703 0.4
704 0.47
705 0.56
706 0.56
707 0.6
708 0.57
709 0.56
710 0.62
711 0.59
712 0.55
713 0.45
714 0.4
715 0.37
716 0.35
717 0.28
718 0.19
719 0.2
720 0.18
721 0.18
722 0.2
723 0.25
724 0.27
725 0.27
726 0.29
727 0.31
728 0.39
729 0.46
730 0.48
731 0.41
732 0.39
733 0.38
734 0.37
735 0.35
736 0.29
737 0.27
738 0.26
739 0.28
740 0.29
741 0.29
742 0.28
743 0.28
744 0.3
745 0.28
746 0.29
747 0.34
748 0.41
749 0.46
750 0.48
751 0.42
752 0.4
753 0.35
754 0.38
755 0.32
756 0.26
757 0.23
758 0.22
759 0.23
760 0.26
761 0.3
762 0.26
763 0.25
764 0.27
765 0.34
766 0.34
767 0.38
768 0.36
769 0.32
770 0.33
771 0.34
772 0.38
773 0.35
774 0.43
775 0.43
776 0.47
777 0.49
778 0.48
779 0.46
780 0.4
781 0.38
782 0.37
783 0.4
784 0.38
785 0.37
786 0.39
787 0.42
788 0.4
789 0.35
790 0.28
791 0.2
792 0.18
793 0.17
794 0.14
795 0.13
796 0.13
797 0.13
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.11
802 0.12
803 0.13
804 0.13
805 0.13
806 0.16
807 0.2
808 0.19
809 0.19
810 0.17
811 0.14
812 0.13
813 0.12
814 0.11
815 0.09
816 0.11
817 0.11
818 0.14
819 0.22
820 0.22
821 0.23
822 0.22
823 0.22
824 0.2
825 0.2
826 0.25
827 0.21
828 0.21
829 0.22
830 0.24
831 0.24
832 0.25
833 0.25
834 0.19
835 0.18
836 0.2
837 0.27
838 0.27
839 0.31
840 0.39
841 0.43
842 0.45
843 0.51
844 0.59
845 0.57
846 0.64
847 0.69
848 0.69
849 0.68
850 0.71
851 0.7
852 0.65
853 0.59
854 0.55
855 0.48
856 0.41
857 0.44
858 0.39
859 0.38
860 0.33
861 0.34
862 0.29
863 0.26
864 0.24
865 0.19
866 0.16
867 0.11
868 0.1
869 0.11
870 0.12
871 0.14
872 0.13
873 0.16
874 0.16
875 0.17
876 0.17
877 0.15
878 0.16
879 0.22
880 0.3
881 0.32
882 0.34
883 0.38
884 0.42
885 0.47
886 0.54
887 0.53
888 0.53
889 0.52
890 0.51
891 0.5
892 0.48
893 0.45
894 0.38
895 0.32
896 0.23
897 0.21
898 0.21
899 0.17
900 0.16
901 0.14
902 0.12
903 0.12
904 0.12
905 0.13
906 0.14
907 0.16
908 0.19
909 0.23
910 0.27
911 0.28
912 0.3
913 0.29
914 0.3
915 0.3
916 0.31
917 0.33
918 0.34
919 0.34
920 0.33
921 0.37
922 0.37
923 0.43
924 0.45
925 0.44
926 0.44
927 0.49
928 0.54
929 0.55
930 0.52
931 0.45
932 0.38
933 0.4
934 0.38
935 0.34
936 0.29
937 0.27
938 0.28
939 0.27
940 0.29
941 0.22
942 0.19
943 0.18
944 0.15
945 0.13
946 0.14
947 0.16
948 0.14
949 0.14
950 0.14
951 0.15
952 0.14
953 0.13
954 0.12
955 0.12
956 0.16
957 0.18
958 0.19
959 0.21
960 0.23
961 0.25
962 0.31
963 0.35
964 0.4
965 0.46
966 0.51
967 0.54
968 0.56
969 0.6
970 0.57
971 0.6
972 0.53
973 0.47
974 0.41
975 0.34
976 0.3
977 0.24
978 0.24
979 0.17
980 0.16
981 0.14
982 0.12
983 0.13
984 0.16
985 0.16
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.16