Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3QLU0

Protein Details
Accession A0A5C3QLU0    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-46MSVETPHRKRKHYAKSPATPDESTPVKRQRKEHHDKKGKRKEDAVDBasic
344-369AAKEKTQKPGKEKAKKTPKAKSQAHIHydrophilic
388-416AVLTEQEKEKERKRQKKLKRAVGISNEDEHydrophilic
419-440GEVAVEDEKPKKKKKKRSKDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-17RKRKHYAKSP
23-41STPVKRQRKEHHDKKGKRK
340-364PKFRAAKEKTQKPGKEKAKKTPKAK
396-407EKERKRQKKLKR
427-437KPKKKKKKRSK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 6, cyto 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSVETPHRKRKHYAKSPATPDESTPVKRQRKEHHDKKGKRKEDAVDVPPTKGGVIGFELAAAPGTARAAGDDNEFALVATSLVVSIPPVFASRPRDGVEELLDSMLMRYIPALRGVVLSHSNLTFLESNAQIKADCPFAVCRVAFNAMVWSPRIGMKLAGKINLCSPDHVSLLIHRTFNTSIPRHHIPIDDWEFEYGPAANDPEFGGGGEGALPTPPESTSPENEEGAMDVDGKGATAAKGGDPESALAEDTDPGGRWVHKTTGNVLGGESSALEFTVVGMTIANQMLSLTGSIQKFPFAVEHRPTAPAASTSTQQASRKGRHEEDDSDEDEDEQENPPPKFRAAKEKTQKPGKEKAKKTPKAKSQAHIDDDEDDDAMPVVEVQDAPAVLTEQEKEKERKRQKKLKRAVGISNEDEPSGEVAVEDEKPKKKKKKRSKDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.85
3 0.89
4 0.87
5 0.82
6 0.73
7 0.64
8 0.59
9 0.55
10 0.49
11 0.5
12 0.52
13 0.55
14 0.6
15 0.67
16 0.72
17 0.77
18 0.83
19 0.85
20 0.86
21 0.88
22 0.91
23 0.94
24 0.94
25 0.91
26 0.87
27 0.84
28 0.79
29 0.79
30 0.78
31 0.72
32 0.71
33 0.64
34 0.58
35 0.51
36 0.44
37 0.34
38 0.26
39 0.2
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.07
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.12
78 0.19
79 0.21
80 0.25
81 0.26
82 0.28
83 0.28
84 0.29
85 0.27
86 0.22
87 0.19
88 0.16
89 0.14
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.07
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.14
111 0.12
112 0.11
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.18
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.21
145 0.22
146 0.25
147 0.23
148 0.23
149 0.25
150 0.28
151 0.26
152 0.2
153 0.21
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.17
158 0.14
159 0.18
160 0.19
161 0.17
162 0.15
163 0.18
164 0.18
165 0.21
166 0.26
167 0.23
168 0.23
169 0.29
170 0.31
171 0.3
172 0.31
173 0.29
174 0.23
175 0.29
176 0.32
177 0.27
178 0.25
179 0.24
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.12
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.08
206 0.11
207 0.13
208 0.17
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.17
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.09
245 0.11
246 0.14
247 0.17
248 0.18
249 0.2
250 0.27
251 0.27
252 0.26
253 0.23
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.12
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.04
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.16
286 0.15
287 0.21
288 0.23
289 0.27
290 0.27
291 0.29
292 0.29
293 0.25
294 0.22
295 0.17
296 0.17
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.22
302 0.23
303 0.29
304 0.34
305 0.38
306 0.44
307 0.49
308 0.5
309 0.5
310 0.53
311 0.5
312 0.49
313 0.47
314 0.42
315 0.37
316 0.33
317 0.28
318 0.24
319 0.2
320 0.14
321 0.11
322 0.14
323 0.18
324 0.18
325 0.21
326 0.23
327 0.24
328 0.31
329 0.33
330 0.4
331 0.41
332 0.51
333 0.59
334 0.66
335 0.73
336 0.76
337 0.79
338 0.74
339 0.79
340 0.79
341 0.79
342 0.77
343 0.79
344 0.8
345 0.83
346 0.85
347 0.85
348 0.84
349 0.84
350 0.84
351 0.8
352 0.79
353 0.79
354 0.74
355 0.66
356 0.58
357 0.49
358 0.44
359 0.38
360 0.27
361 0.18
362 0.14
363 0.11
364 0.1
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.14
380 0.18
381 0.25
382 0.32
383 0.39
384 0.5
385 0.6
386 0.69
387 0.75
388 0.82
389 0.86
390 0.9
391 0.93
392 0.93
393 0.92
394 0.88
395 0.87
396 0.85
397 0.82
398 0.75
399 0.7
400 0.59
401 0.49
402 0.42
403 0.34
404 0.26
405 0.19
406 0.14
407 0.08
408 0.08
409 0.11
410 0.13
411 0.17
412 0.23
413 0.31
414 0.4
415 0.5
416 0.61
417 0.69
418 0.78
419 0.84
420 0.89