Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3Q7D6

Protein Details
Accession A0A5C3Q7D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
986-1017SGEDKHRDKNKEKDKDKPSKPGKPKWEWAPEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
662-703GRAVRARTKGGDRKRGEVVREVRVIEEPKRSRVAPKSKGKEK
991-1010HRDKNKEKDKDKPSKPGKPK
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 4.5, cyto_nucl 4.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MRFTKPSWIIHSDSPLPTSSSSSSSANPPPSARRQTIFSVHVHPDGSRLATGGLDAKVRIWSTKPILNEAAEKNPKRPKSLSTLAMHTGPVLVVRWAGSGKWLASGSDDAVVMVWDLDPNAKGKVWGSDEVNVEGWKALKRLPGHESDVTDLAWSPGDRYLASVGLDSKVIVWCGNTLESLRTLTLHRGFVKGVTWDPAGEFLATQSDDRTVKIWRTRDWGLEAEVRKPFEDSPGSTFFRRLSWSPDGAHITASNATNNKGYVFIAAVIQRGTWTSEISLVGHENTVEVAAYNPHIFLRDPSAPLATANICSVVALGADDRSVSIWQTKSARPLIVAREVFERQIMDLSWSQDGLTLYAVSSDGTLAAFAFDAAELEGLAPSEAQGVYLRKFGYVAEQNAVNGSGSGSMDGSGRMTPPPSPSPDPAEYKRSILENERAAQQASSREQSLGGGSQHNLAGSSQQNLGGSSQQNLGGSSQQNLGGSSQRSTSIIGGLQGERVNVLVPKKKNKKTGVVSFVGGGVAGVPSAAPPSRSGAGSERRSSLNHTTASSMPRTASGMQRTSSGSAMKKDTNTSGTVGETTFGFSHTHTTTTHTASRGYHHPVPMSMDVDVDYPLSSQSMSASAPRRPSPIDVDAPSFATLDTGSTRGKRKADMLGDENGGRAVRARTKGGDRKRGEVVREVRVIEEPKRSRVAPKSKGKEKEVEAEVEDDVGEDVDRDDDEEDDEDDEDEEEEEDYEDEAGGAVGGGGINLPVPPVLTFLRAESIDGGANDGVVEGTNPEGPEGGATELTFYSGKTIIWSEFLSSPVVALVTTSHFTAAATKDGCVTVISPFGRRLLPTLCLGARLHVLEANKWALMAVTSEGMMYCWNIKSQSTFFPPVSLAPVLSSPSPSSRPLSLLTTTLRPCGAPILVVSSACVYTYTPSLLAFSKLSESWWAAGSEAWQGRQRALSAAHGDAGGALRRACAVVNGAGVVAAIESAVVSSGEDKHRDKNKEKDKDKPSKPGKPKWEWAPEETEPSENTNEDAQGRKPSSVQAEDWSLALTLGHLETRMHAARVVESGIEYKQALLVYAKRLADEGFKGFAEEVVRELMGPVYWRPGNGNGREEEWVSTVAGLNKRELLKDVLAILAKSKILVKFAQEWQDTLKRATAGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.34
4 0.31
5 0.31
6 0.26
7 0.23
8 0.24
9 0.25
10 0.26
11 0.3
12 0.36
13 0.37
14 0.38
15 0.39
16 0.44
17 0.51
18 0.57
19 0.56
20 0.52
21 0.51
22 0.54
23 0.58
24 0.54
25 0.48
26 0.47
27 0.46
28 0.45
29 0.42
30 0.35
31 0.31
32 0.29
33 0.27
34 0.2
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.19
48 0.26
49 0.29
50 0.34
51 0.34
52 0.36
53 0.39
54 0.39
55 0.43
56 0.39
57 0.44
58 0.5
59 0.5
60 0.52
61 0.58
62 0.6
63 0.6
64 0.6
65 0.55
66 0.55
67 0.61
68 0.61
69 0.57
70 0.58
71 0.54
72 0.52
73 0.46
74 0.36
75 0.28
76 0.2
77 0.16
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.14
87 0.14
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.17
92 0.19
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.14
111 0.2
112 0.22
113 0.26
114 0.27
115 0.31
116 0.33
117 0.34
118 0.34
119 0.27
120 0.24
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.16
125 0.16
126 0.2
127 0.23
128 0.28
129 0.32
130 0.36
131 0.4
132 0.42
133 0.42
134 0.39
135 0.37
136 0.32
137 0.27
138 0.22
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.2
172 0.24
173 0.27
174 0.27
175 0.28
176 0.28
177 0.28
178 0.28
179 0.24
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.09
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.17
199 0.23
200 0.3
201 0.34
202 0.34
203 0.4
204 0.43
205 0.45
206 0.45
207 0.41
208 0.37
209 0.4
210 0.37
211 0.36
212 0.36
213 0.34
214 0.3
215 0.3
216 0.26
217 0.25
218 0.28
219 0.25
220 0.27
221 0.32
222 0.34
223 0.33
224 0.34
225 0.3
226 0.28
227 0.29
228 0.25
229 0.26
230 0.29
231 0.31
232 0.31
233 0.35
234 0.37
235 0.33
236 0.33
237 0.25
238 0.22
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.14
248 0.14
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.16
286 0.17
287 0.18
288 0.19
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.14
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.1
312 0.11
313 0.15
314 0.2
315 0.22
316 0.27
317 0.3
318 0.29
319 0.27
320 0.3
321 0.3
322 0.34
323 0.32
324 0.28
325 0.29
326 0.29
327 0.28
328 0.25
329 0.21
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.12
342 0.1
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.17
381 0.2
382 0.21
383 0.2
384 0.2
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.13
389 0.08
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.13
405 0.16
406 0.21
407 0.24
408 0.26
409 0.32
410 0.35
411 0.4
412 0.39
413 0.42
414 0.37
415 0.35
416 0.34
417 0.3
418 0.27
419 0.26
420 0.28
421 0.25
422 0.26
423 0.27
424 0.26
425 0.25
426 0.23
427 0.2
428 0.19
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.16
433 0.16
434 0.16
435 0.15
436 0.13
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.11
443 0.1
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.11
483 0.1
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.11
490 0.16
491 0.2
492 0.3
493 0.4
494 0.47
495 0.55
496 0.58
497 0.64
498 0.66
499 0.71
500 0.67
501 0.59
502 0.53
503 0.44
504 0.39
505 0.29
506 0.21
507 0.12
508 0.06
509 0.04
510 0.03
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.03
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.08
519 0.09
520 0.09
521 0.11
522 0.15
523 0.23
524 0.27
525 0.28
526 0.27
527 0.28
528 0.28
529 0.31
530 0.31
531 0.27
532 0.25
533 0.24
534 0.24
535 0.25
536 0.27
537 0.23
538 0.18
539 0.14
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.16
544 0.18
545 0.19
546 0.18
547 0.2
548 0.2
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.15
553 0.16
554 0.18
555 0.19
556 0.19
557 0.19
558 0.19
559 0.18
560 0.18
561 0.16
562 0.14
563 0.13
564 0.12
565 0.11
566 0.1
567 0.07
568 0.08
569 0.06
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.1
574 0.1
575 0.12
576 0.11
577 0.15
578 0.17
579 0.19
580 0.22
581 0.19
582 0.2
583 0.19
584 0.22
585 0.22
586 0.26
587 0.25
588 0.24
589 0.24
590 0.22
591 0.25
592 0.23
593 0.2
594 0.14
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.1
599 0.07
600 0.06
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.1
610 0.13
611 0.15
612 0.19
613 0.2
614 0.21
615 0.21
616 0.23
617 0.24
618 0.26
619 0.27
620 0.25
621 0.26
622 0.24
623 0.24
624 0.22
625 0.17
626 0.12
627 0.09
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.08
633 0.11
634 0.16
635 0.2
636 0.21
637 0.22
638 0.24
639 0.28
640 0.31
641 0.32
642 0.31
643 0.29
644 0.29
645 0.27
646 0.24
647 0.18
648 0.15
649 0.1
650 0.09
651 0.09
652 0.12
653 0.15
654 0.16
655 0.18
656 0.27
657 0.36
658 0.42
659 0.5
660 0.47
661 0.49
662 0.55
663 0.55
664 0.49
665 0.48
666 0.45
667 0.4
668 0.4
669 0.37
670 0.3
671 0.3
672 0.31
673 0.26
674 0.31
675 0.27
676 0.28
677 0.31
678 0.31
679 0.34
680 0.41
681 0.48
682 0.48
683 0.57
684 0.62
685 0.68
686 0.74
687 0.71
688 0.68
689 0.61
690 0.59
691 0.5
692 0.43
693 0.35
694 0.3
695 0.27
696 0.2
697 0.17
698 0.09
699 0.07
700 0.06
701 0.05
702 0.03
703 0.03
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.04
728 0.04
729 0.04
730 0.03
731 0.03
732 0.02
733 0.02
734 0.02
735 0.02
736 0.02
737 0.02
738 0.02
739 0.02
740 0.03
741 0.03
742 0.03
743 0.03
744 0.06
745 0.07
746 0.09
747 0.09
748 0.1
749 0.12
750 0.12
751 0.12
752 0.1
753 0.11
754 0.1
755 0.1
756 0.1
757 0.08
758 0.07
759 0.07
760 0.06
761 0.05
762 0.04
763 0.04
764 0.03
765 0.04
766 0.05
767 0.06
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.07
777 0.06
778 0.08
779 0.08
780 0.07
781 0.08
782 0.09
783 0.09
784 0.09
785 0.11
786 0.1
787 0.12
788 0.12
789 0.12
790 0.13
791 0.14
792 0.14
793 0.12
794 0.11
795 0.09
796 0.09
797 0.06
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.07
805 0.08
806 0.11
807 0.11
808 0.14
809 0.14
810 0.14
811 0.15
812 0.15
813 0.15
814 0.12
815 0.11
816 0.08
817 0.13
818 0.13
819 0.14
820 0.15
821 0.17
822 0.18
823 0.17
824 0.19
825 0.17
826 0.18
827 0.18
828 0.2
829 0.18
830 0.2
831 0.2
832 0.18
833 0.18
834 0.16
835 0.15
836 0.14
837 0.14
838 0.13
839 0.16
840 0.16
841 0.13
842 0.13
843 0.12
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.07
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.07
856 0.08
857 0.09
858 0.1
859 0.11
860 0.15
861 0.17
862 0.23
863 0.27
864 0.31
865 0.29
866 0.3
867 0.3
868 0.27
869 0.28
870 0.22
871 0.16
872 0.12
873 0.13
874 0.13
875 0.13
876 0.14
877 0.11
878 0.15
879 0.17
880 0.19
881 0.21
882 0.21
883 0.23
884 0.23
885 0.26
886 0.24
887 0.24
888 0.24
889 0.27
890 0.27
891 0.26
892 0.24
893 0.21
894 0.2
895 0.19
896 0.17
897 0.11
898 0.11
899 0.14
900 0.14
901 0.14
902 0.14
903 0.12
904 0.12
905 0.11
906 0.11
907 0.07
908 0.08
909 0.1
910 0.1
911 0.09
912 0.1
913 0.11
914 0.12
915 0.14
916 0.13
917 0.12
918 0.14
919 0.13
920 0.14
921 0.15
922 0.16
923 0.15
924 0.16
925 0.15
926 0.13
927 0.13
928 0.13
929 0.17
930 0.17
931 0.19
932 0.22
933 0.22
934 0.24
935 0.26
936 0.25
937 0.22
938 0.22
939 0.24
940 0.23
941 0.23
942 0.22
943 0.2
944 0.19
945 0.16
946 0.16
947 0.12
948 0.1
949 0.09
950 0.09
951 0.09
952 0.1
953 0.09
954 0.09
955 0.1
956 0.1
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.09
961 0.09
962 0.08
963 0.05
964 0.03
965 0.03
966 0.02
967 0.02
968 0.02
969 0.03
970 0.03
971 0.03
972 0.05
973 0.1
974 0.14
975 0.2
976 0.22
977 0.31
978 0.4
979 0.48
980 0.55
981 0.61
982 0.68
983 0.74
984 0.77
985 0.79
986 0.81
987 0.83
988 0.83
989 0.83
990 0.82
991 0.82
992 0.87
993 0.86
994 0.86
995 0.84
996 0.85
997 0.84
998 0.85
999 0.78
1000 0.72
1001 0.7
1002 0.62
1003 0.6
1004 0.53
1005 0.45
1006 0.36
1007 0.34
1008 0.32
1009 0.25
1010 0.24
1011 0.19
1012 0.19
1013 0.2
1014 0.22
1015 0.21
1016 0.28
1017 0.29
1018 0.29
1019 0.28
1020 0.32
1021 0.36
1022 0.37
1023 0.36
1024 0.31
1025 0.34
1026 0.33
1027 0.32
1028 0.27
1029 0.21
1030 0.16
1031 0.14
1032 0.1
1033 0.07
1034 0.07
1035 0.08
1036 0.08
1037 0.08
1038 0.09
1039 0.16
1040 0.17
1041 0.17
1042 0.18
1043 0.19
1044 0.19
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.14
1048 0.13
1049 0.15
1050 0.13
1051 0.14
1052 0.13
1053 0.11
1054 0.13
1055 0.12
1056 0.13
1057 0.14
1058 0.18
1059 0.2
1060 0.26
1061 0.26
1062 0.24
1063 0.25
1064 0.25
1065 0.26
1066 0.26
1067 0.24
1068 0.21
1069 0.21
1070 0.22
1071 0.21
1072 0.22
1073 0.19
1074 0.16
1075 0.14
1076 0.14
1077 0.14
1078 0.12
1079 0.13
1080 0.11
1081 0.1
1082 0.12
1083 0.12
1084 0.17
1085 0.17
1086 0.18
1087 0.21
1088 0.29
1089 0.37
1090 0.4
1091 0.45
1092 0.4
1093 0.42
1094 0.44
1095 0.42
1096 0.35
1097 0.28
1098 0.24
1099 0.19
1100 0.18
1101 0.18
1102 0.21
1103 0.25
1104 0.25
1105 0.25
1106 0.29
1107 0.31
1108 0.31
1109 0.31
1110 0.3
1111 0.27
1112 0.27
1113 0.27
1114 0.25
1115 0.24
1116 0.23
1117 0.22
1118 0.2
1119 0.18
1120 0.17
1121 0.2
1122 0.19
1123 0.21
1124 0.23
1125 0.26
1126 0.31
1127 0.37
1128 0.45
1129 0.41
1130 0.41
1131 0.45
1132 0.5
1133 0.47
1134 0.42
1135 0.4