FuNGI

A0A5C3QPF4

Protein Details

Accession

A0A5C3QPF4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	ATAPRQSRPPGKKPAEPARRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-17	PPGKKPAE

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 5.832, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD

Amino Acid Sequences

MATAPRQSRPPGKKPAEPARRAWTGTRASTTYSTAPSPSPRPTVPPTSTSSAQPAFPPLSQPNGARSDVPQDRVLQSLAGLTGTTITLRTKTGQHYEGAITSTTADGNTTGVTLRDVRDISSPGQPIKDTLFVASTNIGTWNSGPADAKAPNTDSFRTDTEISQKNAPRANRELQAWSAGADGLSSELASGSGNGDEETFGADAGGGSWDQFAANEQLFGINPTFDESVYTTKIDRSGADYKERERKAQRIANEINGVRSSLVASNNPHLAEERGQVVDDSGIDEENKYSTVVRSTGAYVPPGARRGNPTSPPPNSDVPMVSVNGPDGAAVQASNQPSPSSSKTTTPAPPANATNKPPADAVPAFREFVNTEKQRLTQKKQALFKSEMDKRMADLVKFSQSFKLNKPIPDDLVSILAKDEAKQQAIRDKSCKDASSTEARTIGASLTNVAARAPAAKPAATKIAAPGIKASATSNAVPPANPPKAVLTSKPEVSVTGKKLIPMVIQNIPAFRGSKKPDQVHPTKPSAEAPLAAAPVNGTAVAAPSKPSPPVGSAAAAAAAAAANRLNVNASSFRPNPKAGSFSPGQNGPSPSGGAVQNGTAAANVSPKPKEPGTPNPFFGNRVIKKGTPIHVKDEFNPFKHNKINKAAEVSQMWPYSGKRYMTMFPTPSHQPQQQHSPHMAAPAQPPMPPPPYEEDPAAAQARGYAYMYSPYAYPGQHMMPGMAPPGPPAGYIPAQFMQAIPYPHGMPPPGAMYSPAMGQMPPQGYMQPPPPGAYPPPPNGGGRPSMPPTPIPSHAHPYYPQSPQMPHAVPYPMMMPGPPPGTIPQHPSYDGSNGQAQPVQMGGHA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.82
3	0.82
4	0.78
5	0.76
6	0.73
7	0.72
8	0.67
9	0.61
10	0.58
11	0.54
12	0.54
13	0.52
14	0.45
15	0.43
16	0.42
17	0.42
18	0.37
19	0.33
20	0.3
21	0.27
22	0.3
23	0.32
24	0.35
25	0.37
26	0.39
27	0.38
28	0.43
29	0.47
30	0.53
31	0.51
32	0.5
33	0.5
34	0.51
35	0.51
36	0.47
37	0.47
38	0.4
39	0.37
40	0.34
41	0.33
42	0.29
43	0.28
44	0.31
45	0.27
46	0.31
47	0.34
48	0.34
49	0.35
50	0.37
51	0.38
52	0.33
53	0.32
54	0.36
55	0.37
56	0.39
57	0.36
58	0.35
59	0.35
60	0.36
61	0.34
62	0.24
63	0.2
64	0.17
65	0.15
66	0.11
67	0.09
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.1
75	0.12
76	0.14
77	0.19
78	0.25
79	0.32
80	0.33
81	0.33
82	0.34
83	0.34
84	0.33
85	0.3
86	0.24
87	0.17
88	0.16
89	0.15
90	0.12
91	0.1
92	0.09
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.09
100	0.11
101	0.12
102	0.16
103	0.16
104	0.17
105	0.2
106	0.22
107	0.23
108	0.27
109	0.29
110	0.26
111	0.28
112	0.27
113	0.25
114	0.26
115	0.27
116	0.21
117	0.19
118	0.19
119	0.17
120	0.18
121	0.17
122	0.14
123	0.11
124	0.13
125	0.12
126	0.11
127	0.11
128	0.13
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.18
134	0.19
135	0.2
136	0.2
137	0.22
138	0.24
139	0.27
140	0.28
141	0.25
142	0.27
143	0.27
144	0.28
145	0.27
146	0.25
147	0.3
148	0.35
149	0.35
150	0.39
151	0.41
152	0.42
153	0.46
154	0.47
155	0.45
156	0.45
157	0.48
158	0.45
159	0.44
160	0.42
161	0.38
162	0.38
163	0.32
164	0.26
165	0.2
166	0.16
167	0.13
168	0.09
169	0.08
170	0.05
171	0.05
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.06
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.1
208	0.07
209	0.07
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.11
214	0.11
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.14
219	0.15
220	0.17
221	0.16
222	0.15
223	0.18
224	0.24
225	0.26
226	0.33
227	0.34
228	0.39
229	0.47
230	0.48
231	0.49
232	0.48
233	0.52
234	0.54
235	0.56
236	0.54
237	0.53
238	0.54
239	0.52
240	0.52
241	0.46
242	0.38
243	0.33
244	0.3
245	0.21
246	0.18
247	0.15
248	0.12
249	0.13
250	0.14
251	0.15
252	0.18
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.17
257	0.17
258	0.17
259	0.16
260	0.15
261	0.14
262	0.14
263	0.13
264	0.12
265	0.11
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.13
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.15
287	0.16
288	0.18
289	0.2
290	0.19
291	0.17
292	0.22
293	0.27
294	0.32
295	0.34
296	0.39
297	0.43
298	0.44
299	0.46
300	0.45
301	0.41
302	0.36
303	0.33
304	0.27
305	0.21
306	0.21
307	0.18
308	0.15
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.09
313	0.07
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.15
326	0.17
327	0.19
328	0.2
329	0.22
330	0.24
331	0.29
332	0.32
333	0.34
334	0.34
335	0.31
336	0.31
337	0.32
338	0.35
339	0.35
340	0.34
341	0.35
342	0.32
343	0.31
344	0.28
345	0.25
346	0.25
347	0.22
348	0.22
349	0.19
350	0.2
351	0.2
352	0.19
353	0.2
354	0.15
355	0.17
356	0.23
357	0.2
358	0.21
359	0.22
360	0.25
361	0.33
362	0.39
363	0.43
364	0.42
365	0.48
366	0.52
367	0.57
368	0.58
369	0.55
370	0.52
371	0.5
372	0.5
373	0.49
374	0.46
375	0.4
376	0.37
377	0.32
378	0.35
379	0.32
380	0.24
381	0.2
382	0.18
383	0.21
384	0.22
385	0.22
386	0.2
387	0.23
388	0.26
389	0.26
390	0.34
391	0.32
392	0.34
393	0.38
394	0.35
395	0.33
396	0.32
397	0.3
398	0.22
399	0.22
400	0.19
401	0.14
402	0.13
403	0.12
404	0.09
405	0.09
406	0.13
407	0.11
408	0.12
409	0.13
410	0.14
411	0.2
412	0.23
413	0.25
414	0.25
415	0.25
416	0.28
417	0.3
418	0.3
419	0.26
420	0.24
421	0.26
422	0.29
423	0.3
424	0.26
425	0.24
426	0.24
427	0.21
428	0.2
429	0.16
430	0.09
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.07
440	0.06
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.11
445	0.12
446	0.15
447	0.14
448	0.14
449	0.11
450	0.17
451	0.17
452	0.16
453	0.16
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.09
459	0.1
460	0.11
461	0.11
462	0.13
463	0.13
464	0.12
465	0.14
466	0.2
467	0.19
468	0.19
469	0.19
470	0.18
471	0.23
472	0.24
473	0.24
474	0.22
475	0.24
476	0.25
477	0.25
478	0.23
479	0.2
480	0.23
481	0.26
482	0.23
483	0.25
484	0.25
485	0.24
486	0.25
487	0.25
488	0.22
489	0.18
490	0.2
491	0.17
492	0.19
493	0.19
494	0.18
495	0.18
496	0.18
497	0.17
498	0.14
499	0.18
500	0.21
501	0.28
502	0.35
503	0.39
504	0.44
505	0.51
506	0.57
507	0.59
508	0.59
509	0.57
510	0.51
511	0.48
512	0.43
513	0.38
514	0.32
515	0.23
516	0.19
517	0.16
518	0.15
519	0.13
520	0.12
521	0.08
522	0.08
523	0.07
524	0.06
525	0.04
526	0.03
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.08
532	0.09
533	0.1
534	0.11
535	0.11
536	0.12
537	0.15
538	0.15
539	0.14
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.1
544	0.08
545	0.06
546	0.04
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.07
556	0.1
557	0.12
558	0.18
559	0.2
560	0.25
561	0.28
562	0.29
563	0.3
564	0.29
565	0.32
566	0.27
567	0.3
568	0.27
569	0.26
570	0.28
571	0.27
572	0.27
573	0.25
574	0.26
575	0.22
576	0.22
577	0.19
578	0.16
579	0.17
580	0.16
581	0.13
582	0.12
583	0.1
584	0.1
585	0.1
586	0.09
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.09
591	0.11
592	0.13
593	0.14
594	0.16
595	0.2
596	0.21
597	0.26
598	0.29
599	0.38
600	0.43
601	0.47
602	0.48
603	0.48
604	0.48
605	0.45
606	0.43
607	0.43
608	0.37
609	0.37
610	0.39
611	0.35
612	0.39
613	0.43
614	0.46
615	0.45
616	0.46
617	0.47
618	0.5
619	0.52
620	0.49
621	0.55
622	0.53
623	0.45
624	0.5
625	0.45
626	0.44
627	0.5
628	0.52
629	0.48
630	0.53
631	0.57
632	0.52
633	0.57
634	0.53
635	0.49
636	0.46
637	0.41
638	0.36
639	0.31
640	0.28
641	0.23
642	0.23
643	0.24
644	0.27
645	0.26
646	0.23
647	0.26
648	0.29
649	0.32
650	0.38
651	0.35
652	0.3
653	0.34
654	0.37
655	0.39
656	0.42
657	0.42
658	0.41
659	0.43
660	0.52
661	0.54
662	0.54
663	0.5
664	0.47
665	0.43
666	0.42
667	0.38
668	0.31
669	0.28
670	0.29
671	0.27
672	0.25
673	0.26
674	0.27
675	0.3
676	0.27
677	0.28
678	0.29
679	0.32
680	0.34
681	0.33
682	0.29
683	0.27
684	0.31
685	0.29
686	0.22
687	0.17
688	0.16
689	0.16
690	0.15
691	0.14
692	0.1
693	0.1
694	0.13
695	0.14
696	0.13
697	0.12
698	0.13
699	0.15
700	0.14
701	0.15
702	0.16
703	0.16
704	0.18
705	0.18
706	0.17
707	0.15
708	0.16
709	0.16
710	0.14
711	0.13
712	0.11
713	0.13
714	0.12
715	0.11
716	0.12
717	0.15
718	0.17
719	0.17
720	0.21
721	0.19
722	0.2
723	0.2
724	0.19
725	0.17
726	0.18
727	0.19
728	0.17
729	0.18
730	0.19
731	0.21
732	0.23
733	0.21
734	0.18
735	0.18
736	0.19
737	0.18
738	0.16
739	0.17
740	0.16
741	0.16
742	0.16
743	0.15
744	0.13
745	0.12
746	0.12
747	0.17
748	0.17
749	0.17
750	0.17
751	0.18
752	0.19
753	0.23
754	0.28
755	0.28
756	0.27
757	0.28
758	0.29
759	0.31
760	0.34
761	0.38
762	0.4
763	0.38
764	0.42
765	0.43
766	0.43
767	0.42
768	0.41
769	0.38
770	0.33
771	0.35
772	0.34
773	0.35
774	0.35
775	0.35
776	0.37
777	0.39
778	0.42
779	0.43
780	0.44
781	0.48
782	0.48
783	0.5
784	0.46
785	0.48
786	0.49
787	0.47
788	0.48
789	0.44
790	0.45
791	0.44
792	0.49
793	0.43
794	0.38
795	0.38
796	0.36
797	0.31
798	0.3
799	0.28
800	0.21
801	0.2
802	0.18
803	0.15
804	0.17
805	0.19
806	0.18
807	0.18
808	0.21
809	0.27
810	0.31
811	0.36
812	0.36
813	0.38
814	0.39
815	0.4
816	0.39
817	0.38
818	0.36
819	0.32
820	0.35
821	0.31
822	0.32
823	0.32
824	0.28
825	0.24
826	0.23

A0A5C3QPF4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer